Métagénomik

Métagénomika nyaéta ulikan ngeunaan sakabéh bahan génétik ti sakabéh organismeu dina hiji lingkungan, anu nyadiakeun wawasan ngeunaan komposisi pangeusina, karageman, sarta poténsi pungsionalna. Métagénomika geus ngamungkinkeun para panalungtik pikeun ngimeutan kandungan mikroba sampel lingkungan jeung klinis tanpa perlu ngultur anu méakkeun waktu.

Métagénomika geus ngarobah ékologi mikroba jeung biologi évolusionér ku ngungkab kapabilitas biodiversitas jeung métabolik anu saméméhna nyumput. Ku turunna biaya sekuensing DNA, kiwari studi métagénomik geus matuh ngimeutan ratusan dugi ka rébuan conto, ngamungkinkeun éksplorasi komunitas mikroba skala gedé katut peranna dina kaséhatan sareng ékosistem global.    

Panalungtikan métagénomik biasana maké sékuénsing shotgun atawa sekuensing bacaan panjang (<i>long-read</i>). Widang ieu ogé disebut salaku génomika lingkungan, ékogénomika, génomika komunitas, atanapi mikrobiomika anu geus muka pangaweruh ngeunaan kahirupan mikroba saluareun anu biasa diungkabkeun ku cara kultur tradisional.

Métagénomika béda ti sekuensing amplikon, katelah ogé métabarkoding atawa sekuensing dumasar PCR. Béda utamana nyaéta métodologi dasarna, sabab métagénomika nargétkeun sakabéh DNA dina sampel, anapon sekuénsing amplikon mah husus nargétkeun hiji atawa sababaraha gén husus. Pamakéan data ogé béda antara dua pendekatan ieu. Sékuénsing amplikon nyadiakeun utamana propil komunitas anu ngawincik taksa nu hadir dina sampel, anapon métagénomika ngawengku ogé énzim jeung jalurna anu disandina. Ti heula, sékuénsing amplikon remen dipaké sékuénsing sampel lingkungan pikeun mariksa gén spésipik anu kajaga (conserved), kayaning gén rRNA 16S, pikeun nempo profil karageman mikroba. Ieu panalungtikan nunjukkeun yén kalolobaan karageman mikroba teu kabaca ku cara kultur.

 Tempo ogé 

 Binning
 Epidemiologi sareng limbah
 Métaproteomik
 Ékologi mikroba
 Patogenomik
 Analisis Virome

 Réferénsi 

 Tautan éksternal 

 Fokus kana Metagenomik di situs wéb jurnal Nature Reviews Microbiology
 Inisiatif "Penilaian Kritis Interpretasi Metagenom" (CAMI) pikeun meunteun metode dina metagenomik