Хаплогрупа J (мтДНК)

Хаплогрупа Ј — човечка митохондријална ДНК (mtДНК) хаплогрупа. Кладот потекнува од хаплогрупата JT, која исто така ја довела до хаплогрупата Т. Во областа на медицинската генетика, одредени полиморфизми специфични за хаплогрупата Ј се поврзани со Леберовата наследна оптичка невропатија.

 Потекло 
Околу 45.000 години пред денес, се случила мутација во ДНК на жена која живеела на Блискиот Исток или Кавказ. Дополнителни мутации се случија во линијата J, која може да се идентификува како поткладовите J1a1, J1c1 (пред 27.000 години), J2a (пред 19.000 години), J2b2 (пред 16.000 години) и J2b3 (пред 5.800 години). Носителите на хаплогрупата Ј заедно со лицата што го носат кладот T mtДНК се населиле во Европа од Блискиот Исток за време на доцниот палеолит и мезолит.
+Проценки на времето на спојување за поткладовите на митохондријалната хаплогрупа Ј Потклад Европско време на соединувањеPiia Serk, Human Mitochondrial DNA Haplogroup J in Europe and Near East, Thesis, Tartu 2004  Време на спојување на Блискиот Исток J1a1 27.300 години (± 8.000 години) 17.700 години (± 2.500 години) J1a2 7.700 години (± 3.500 години) - J1b 5.000 години (± 2.200 години) 23.300 години (± 4.300 години) J2a 19.200 години (± 6.900 години) - J2b1 - 15.000 години (± 5.000 години) J2b2 16.600* години (± 8.100 години) 16.000 години (± 5.700 години) J2b3 5.800 години (± 2.900 години) -
* Типографска грешка, беше 161.600 години од оригиналниот изворен материјал според временската табела што го опишува ширењето на населенијата дадени во истата студија.

Сепак, сите изјави во врска со географското потекло на оваа или која било друга хаплогрупа се многу шпекулативни и се сметаат од повеќето популациони генетичари за „раскажување приказни“ и надвор од доменот на науката. Понатаму, заклучувањето блиски асоцијации помеѓу хаплогрупата и специфичната археолошка култура може да биде подеднакво проблематично.
+Возраст на помладите гранки на mtHG Ј Азбучнобројчена ознака Пресметана возраст преку емпириско ширење и сооднос на стапка на дрифт на мутацииA “Copernican” reassessment of the human mitochondrial DNA tree from its root Behar, D.M., van Oven, M., Rosset, S., Metspalu, M., Loogväli, E.L., Silva, N.M., Kivisild, T., Torroni, A. and Villems, R., American Journal of Human Genetics, Vol. CI =95% J2 28,259,7 ± 4,605,0 (помеѓу 23,700 и 32,900 години) J2a 24,051,5 ± 4,183,2 (помеѓу 19,900 и 28,200 години) J2a1 21.186,1 ± 4.485,5 (помеѓу 16.700 и 25.700 години) J2a1a 12.986,1 ± 4.077,7 (помеѓу 8.900 и 17.100 години) J2a1a1 8949,8 ± 3051,3 (помеѓу 5900 и 12000 години) J2a1a1a 7.591,6 ± 2.889,6 (помеѓу 4.700 и 10.500 години) J2a1a1a2 3618,9 ± 2973,9 (помеѓу 600 и 6600 години)

 Распространетост 
мини|Проектирана просторна честотна распределба за хаплогрупата Ј.
Базалната хаплогрупа J* се наоѓа кај Соќотри (9,2%).

Просечната честота на хаплогрупата Ј како целина денес е најголема на Блискиот Исток (12%), проследено со Европа (11%), Кавказ (8%) и Североисточна Африка (6%). Од двете главни подгрупи, J1 зазема четири петтини од вкупниот број и е широко распространет на континентот, додека J2 е повеќе локализиран околу Медитеранот, Грција, Италија/Сардинија и Шпанија.

Исто така, постојат ограничени докази дека поткладот Ј1 одамна е присутен во Средна Азија. На пример, можеби најголемата инциденца на хаплогрупата Ј е 19% од полските Роми, кои припаѓаат на Ј1 (иако ова исто така се припишува на некој вид „ефект на основачот“.B.A. Malyarchuk, T. Grzybowski, M.V. Derenko, J. Czarny, and D. Miścicka-Śliwka, Mitochondrial DNA diversity in the Polish Roma, Annals of Human Genetics, vol. Во Пакистан, каде што западноевроазиските лоза се јавуваат на честоти до 50% во некои етно-лингвистички групи, инциденцата на J1 е во просек околу 5%, додека J2 е многу ретка. Сепак, J2 се наоѓа меѓу 9% од малцинството Калаши во северозападен Пакистан.Lluís Quintana-Murci, Raphaëlle Chaix, R. Spencer Wells, Doron M. Behar, Hamid Sayar, Rosaria Scozzari, Chiara Rengo, Nadia Al-Zahery, Ornella Semino, A. Silvana Santachiara-Benerecetti, Alfredo Coppa, Qasim Ayub, Aisha Mohyuddin, Chris Tyler-Smith, S. Qasim Mehdi, Antonio Torroni, and Ken McElreavey, Where west meets east: the complex mtDNA landscape of the southwest and Central Asian corridor, American Journal of Human Genetics, vol.

На Арапскиот полуостров, mtДНК хаплогрупата J се наоѓа меѓу Саудијците (10,5-18,8% J1b) и Јеменците (0-20% J1b). Поткладот J1b се јавува и на Блискиот Исток кај Ирачаните (7,1%) и Палестинците (4%).

Во Африка, хаплогрупата Ј е концентрирана на североисток. Се наоѓа кај Алжирците (3,23-14,52%), како и кај Суданските Копти (10,3% J1a; 10,3% J2),  Суданците Фулани (10,7% J1b), Месериа (6,7% J1b), Аракиен (5,9% J1b), Египќани (5,9%), Мозабитски Бербери (3,53%), Судански Хауси (2,9% J1b), Зенетски Бербери (2,74%), Беја (2,1% J1b), и Регибате Сахрави (0,93%).

Во Европа, >2% распределба на честота на mtДНК J е како што следува:Lucia Simoni, Francesc Calafell, Davide Pettener, Jaume Bertranpetit, and Guido Barbujani, Geographic Patterns of mtDNA Diversity in Europe, American Journal of Human Genetics, vol.

 Ј* = Ирска - 12%, Англија-Велс - 11%, Шкотска - 9%, Оркнеј - 8%, Германија - 7%, Русија (европска) - 7%, Исланд - 7%, Австрија-Швајцарија - 5%, Финска-Естонија — 5%, Шпанија-Португалија — 4%, Франција-Италија — 3%
 J1a = Австрија-Швајцарија — 3%
 J1b1 = Шкотска - 4%
 J2 = Франција-Италија — 2%
 J2a = Хомогено распространето во Европа; отсутен во нациите околу Кавказ; не е познато да се најде на друго место.
 J2b1 = Практично отсутен во Европа; се наоѓа во различни облици на Блискиот Исток.
 J2b1a = Пронајден во Западна Европа и Русија.

Хаплогрупата Ј, исто така, е пронајден меѓу староегипетски мумии ископани на археолошкото наоѓалиште Абусир ел-Мелек во Блискиот Египет, кои датираат од предптолемејскиот/доцното ново кралство, птолемејскиот и римскиот период. Хаплогрупата Ј е забележана во древните фосили на Гуанче ископани во Гран Канарија и Тенерифе на Канарските Острови, кои се датирани со дардиојаглерод помеѓу 7-ми и 11-ти век од нашата ера. Сите поединци кои носат клад беа инхумирани на локацијата на Тенерифе, при што беше пронајдено дека еден примерок припаѓа на поткладот J1c3 (1/7; ~ 14%). Кладот J, исто така, е пронајдена меѓу иберомаурусските примероци кои датираат од епипалеолитот на праисториската локација Афалу. Околу 22% од набљудуваните хаплотипови припаѓале на различни J поткладови, вклучувајќи недиференцирани J (1/9; 11%) и J1c3f (1/9; 11%).

Во Источен Сибир, хаплогрупата J1c5 е забележана во примероци на Јакути (3/111 = 2,7% Виљуј Јакут, 2/148 = 1,4% Северен Јакут, 1/88 = 1,1% Централен Јакут, 1/164 = 0,6% Централен Јакут), Евенки во Јакутија (4/125 = 3,2%) и Евенки во Јакутија (1/105 = 1,0%). Хаплогрупата J2a2b3 е забележана во примерок од Њукжа Евенкс (2/46 = 4,3%). Хаплогрупата Ј2, исто така, е забележана во примерок од евенки собрани во округот Олењоски, округот Жигански и округот Уст-Мајски во Јакутија (7/125 = 5,6%). Еден пример на хаплогрупата J1c10a1 е забележан во примерокот на Проектот за разновидност на човечкиот геном од десет поединци Ороќен од најсеверната Кина.Sardana A Fedorova, Maere Reidla, Ene Metspalu, et al., "Autosomal and uniparental portraits of the native populations of Sakha (Yakutia): implications for the peopling of Northeast Eurasia." BMC Evolutionary Biology 2013, 13:127.Duggan AT, Whitten M, Wiebe V, Crawford M, Butthof A, et al. (2013), "Investigating the Prehistory of Tungusic Peoples of Siberia and the Amur-Ussuri Region with Complete mtDNA Genome Sequences and Y-chromosomal Markers." PLoS ONE 8(12): e83570.

 Поткладови 
мини| Шематско стебло на mtДНК хаплогрупата J. Наведените возрасти (во ка) се проценки на максималната веројатност добиени за целиот mtДНК геном.

 Дрво 
Ова филогенетско дрво на поткладовите на хаплогрупата J се заснова на трудот на Манис ван Овен и Манфред Кајзер Ажурирано сеопфатно филогенетско стебло на глобалната варијација на човечката митохондријална ДНК  и последователните објавени истражувања.
mtДНК HG "J" P-дрво Ј
 J1
 J1b
 J1b1
 J1b1a
 J1b1a1
 J1b1a2
 J1b1b
 J1b1b1
 J1b2
 J1b3
 J1c
 J1c1
 J1c1b
 J1c1c
 J1c2
 J1c2a
 J1c2b
 J1c2b1
 J1c2b1a
 J1c3
 J1c3a
 J1c3a1
 J1c3b
 J1c3b1
 J1c3c
 J1c4
 J1c5
 J1c5a
 J1c6
 J1c7
 J1c7a
 J1c8
 J1c8a
 J1d
 J1d1
 J2
 J2a
 J2a1
 J2a1a
 J2a1a1
 J2a1a1a
 J2a1a1b
 J2a2
 J2a2a
 J2b
 J2b1
 J2b1a
 J2b1a1
 J2b1a2
 J2b1a3
 J2b1b

 Генетски карактеристики 
Тоа е теоретизирано  дека раздвојувањето на оксидативната фосфорилација поврзана со SNP кои ја дефинираат mt-хаплогрупата J последователно произведува повисока телесна топлина во фенотипот на mtДНК J поединци. Ова е поврзано со селективен притисок за присуството на хаплогрупата во северна Европа, особено Норвешка.Different genetic components in the Norwegian population revealed by the analysis of mtDNA & Y chromosome polymorphisms  Поединците од хаплогрупите UK, J1c и J2 беа поподложни на Леберовата наследна оптичка невропатија, бидејќи тие имаат намален капацитет на оксидативна фосфорилација, што делумно произлегува од пониските нивоа на mtДНК. J mtДНК е исто така поврзана со ХИВ инфицирани лица кои покажуваат забрзана прогресија до СИДА и смрт. Мутацијата T150C, која е ексклузивна, но не и дефинитивна, на J2 поткладот на Хаплогрупата Ј може да биде дел од веројатната јадрено контролирана општа машинерија во врска со ремоделирањето и репликацијата на mtДНК. Контролирање на ремоделирање кое би можело да ја забрза репликацијата на mtДНК со што се компензира оксидативното оштетување во mtДНК, како и функционалното влошување кое се јавува со староста поврзана со неа. Утврдено е дека хаплогрупата Ј е заштитен фактор против исхемична кардиомиопатија. Исто така, беше откриено дека Хаплогрупата Ј е заштитен фактор кај пациентите со остеоартритис од Шпанија но не и од ОК, и се претпоставува дека ова се должи на различен генетски состав (полиморфизми) на Хаплогрупата Ј во двете населенија. Студијата во која беа вклучени пациенти со европско и западно азиско потекло или потекло покажа дека поединците класифицирани како хаплогрупа Ј или К покажаа значително намалување на ризикот од Паркинсонова болест наспроти поединците кои ја носат најчестата хаплогрупа, H.

 Популарна култура 

 Мтдната на Марио Батали е Ј1.23andMe
 Ксимена Наварета Мис Универзум 2010, е хаплогрупа J.
 Ричард III од Англија имал J1c2c3 mtДНК хаплогрупа.
 во книгата на Брајан Сајкс, Седумте ќерки на Ева, хаплогрупата Ј се нарекува „Клан Јасмин“.

 Наводи 

 Надворешни врски 

 Општо
 Место на митохондријална ДНК на Иан Логан
 Phylotree на Манис ван Овен
 Хаплогрупа Ј
 Џим Логан 2009 mt-Haplogroup J дрво на поткладови и гранки со мутација
 Сеопфатна анализа на mtДНК Haplogroup J (Џим Логан. септември, 2008)  
 Рафинирана филогенаја за mtДНК хаплогрупата Ј
 Поткладовите на mtДНК хаплогрупата J и предложените мотиви за доделување контролни-регионални секвенци во овие кладови 
 Карта на mtHaplogroup J. (Наслови на руски/кирилица) 
 J (& subclades) mt-Haplogroup проект на FTДНК
 Ширење на Haplogroup J, од National Geographic
 Географски обрасци на различноста на mtДНК во Европа, Луција Симони и сор., 2000 година.
 PDF
 J mtДНК Јаху групната датотека преземање

Категорија:Човечки мтДНК хаплогрупи