Хаплогрупа М18

Хаплогрупа М18 — човечка митохондријална ДНК (mtДНК) хаплогрупа. Тоа е лоза специфична за Индија.

 Потекло 
М18 е потомок на макро-хаплогрупатаThangaraj, Kumarasamy; Chaubey, Gyaneshwer; Singh, Vijay; Vanniarajan, Ayyasamy; Thanseem, Ismail; Reddy, Alla G; Singh, Lalji (2006). "In situ origin of deep rooting lineages of mitochondrial Macrohaplogroup 'M' in India". BMC Genomics. 7: 151. doi:10.1186/1471-2164-7-151. PMC 1534032. PMID 16776823. (mtДНК) иMetspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M; Gilbert, M Thomas P; Endicott, Phillip; Mastana, Sarabjit; Papiha, Surinder S; Skorecki, Karl; Torroni, Antonio; Villems, Richard (2004). "Most of the extant mtDNA boundaries in South and Southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans". BMC Genetics. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC 516768. PMID 15339343. индиска специфична варијанта на М. хаплогрупи од коренот на хаплогрупата М (суперхаплогрупа М4'30).Maji, S; Krithika, S; Vasulu, TS (April 2009). "Phylogeographic distribution of mitochondrial DNA macrohaplogroup M in India". Journal of Genetics. 88 (1): 127–39. doi:10.1007/s12041-009-0020-3. PMID 19417557. S2CID 28080968. Супер-клад M4'30 е единствениот клад што дели средна лоза помеѓу 2 хаплогрупи, додека остатокот од сите M лоза потекнува независно од коренот на макрохаплогрупата М; со што се поддржува идејата за брзо растурање на современите луѓе долж азискиот брег откако тие ја напуштиле Африка, проследено со долг период на изолација.

Во очекување на дополнителни информации од комплетните mtДНК секвенци, хаплогрупата M18 првпат беше дефинирана од Метспалу и сор., во 2004 година со користење на трансверзијата на np 16318.Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M; Gilbert, M Thomas P; Endicott, Phillip; Mastana, Sarabjit; Papiha, Surinder S; Skorecki, Karl; Torroni, Antonio; Villems, Richard (2004). "Most of the extant mtDNA boundaries in South and Southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans". BMC Genetics. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC 516768. PMID 15339343. Ова подоцна беше ревидирано од Тангарај и сор., во 2006 година.Maji, S; Krithika, S; Vasulu, TS (April 2009). "Phylogeographic distribution of mitochondrial DNA macrohaplogroup M in India". Journal of Genetics. 88 (1): 127–39. doi:10.1007/s12041-009-0020-3. PMID 19417557. S2CID 28080968. Во моментов, хаплогрупата се карактеризира со две мутации на кодирачкиот регион, 12498 и 15942, и дополнителна мутација на контролниот регион 194.

 Распространетост 
Студијата од 2004 година на Метспалу и сор., ја анализираше варијацијата на mtДНК кај примероците од 796 Индијци, 436 Иранци и ги спореди со примероци од Европа, Кина и Тајланд. Студијата покажа преваленца на М18 на ниски честоти низ широка географска област која ги опфаќа југоисточните делови на Саудиска Арабија, широко низ Иран, Пакистан, Индија, Непал, Бангладеш и Мјанмар.Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M; Gilbert, M Thomas P; Endicott, Phillip; Mastana, Sarabjit; Papiha, Surinder S; Skorecki, Karl; Torroni, Antonio; Villems, Richard (2004). "Most of the extant mtDNA boundaries in South and Southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans". BMC Genetics. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC 516768. PMID 15339343.

Студијата на Метспалу откри дека просторната распространетост на М18 достигнала врв низ дел од Пенџаб Пакистан, Пенџаб, Индија, Раџастан и низ голем дел од Андра Прадеш.

Високата инциденца (33%) на јазолскиот хаплотип M18 кај Лода од Западен Бенгал што зборува австроазија, сугерираше можен основачки ефект кај ова население.Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M; Gilbert, M Thomas P; Endicott, Phillip; Mastana, Sarabjit; Papiha, Surinder S; Skorecki, Karl; Torroni, Antonio; Villems, Richard (2004). "Most of the extant mtDNA boundaries in South and Southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans". BMC Genetics. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC 516768. PMID 15339343. Исто така, ја објасни речиси двократната разлика помеѓу проценките за спојување за овој кластер пресметани со и без племенските податоци, во студијата на Метспалу.

Бидејќи интензивниот генетски дрифт (особено ефектите на основачот) може да воведе пристрасност во пресметката на времето на спојување, затоа Метспалу и сор. 17.100 ± 4.700 п.н.е. соодветно.Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M; Gilbert, M Thomas P; Endicott, Phillip; Mastana, Sarabjit; Papiha, Surinder S; Skorecki, Karl; Torroni, Antonio; Villems, Richard (2004). "Most of the extant mtDNA boundaries in South and Southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans". BMC Genetics. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC 516768. PMID 15339343. Тангарај и сор., ја процениле возраста на спојување на Хаплогрупата М18 на 20,800 ± 8900 ybp (Тангарај и сор., 2006).Maji, S; Krithika, S; Vasulu, TS (April 2009). "Phylogeographic distribution of mitochondrial DNA macrohaplogroup M in India". Journal of Genetics. 88 (1): 127–39. doi:10.1007/s12041-009-0020-3. PMID 19417557. S2CID 28080968.

Сумирајќи, поединци од Хаплогрупата М18 се пронајдени во

 Саудиска Арабија
 Иран
 Авганистан
 Пакистан
 Индија
 Непал
 Бутан
 Кина
 Бангладеш
 Мјанмар

Дополнително, Хаплогрупата М18а е пронајдена во мезолитски ловец-собирач во близина на Балангода, Шри Ланка датиран cal BP 5455-5375.

 Распространетост во Индија 
Релативно висока честота на хаплогрупата М18 беше забележана во Пардхан од Андра Прадеш, додека таа беше целосно отсутна во Најкпод Гонд и Анд (Тангарај и сор., 2006).Maji, S; Krithika, S; Vasulu, TS (April 2009). "Phylogeographic distribution of mitochondrial DNA macrohaplogroup M in India". Journal of Genetics. 88 (1): 127–39. doi:10.1007/s12041-009-0020-3. PMID 19417557. S2CID 28080968. M18 беше пронајден во Браманите од Утар Прадеш (Сан и сор., 2006), Десаст Браман од Махараштра (Гаиквад и Кашјап, 2005 година), Кандајат од Ориса (Саху и Кашјап, 2006 година) и Ораон од Бихар ал (2006, Тангарај).

Чандрасекар А и Рагавендра Рао, и сор., го потврдија монофилетското потекло на Хаплогрупата М18 и открија дека се јавува со висока честота кај луѓето од Мал Пахарија (со 29% од големината на примерокот).

Студијата на Метспалу и сор., откри дека хаплогрупата М18 низ Андра Прадеш и југоисточниот дел на Тамил Наду, но целосно отсутна во соседните Карнатака и Керала. Можно објаснување е олеснувањето на мешањето долж крајбрежјето на Арапското Море и Бенгалскиот Залив.Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M; Gilbert, M Thomas P; Endicott, Phillip; Mastana, Sarabjit; Papiha, Surinder S; Skorecki, Karl; Torroni, Antonio; Villems, Richard (2004). "Most of the extant mtDNA boundaries in South and Southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans". BMC Genetics. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC 516768. PMID 15339343. Меѓутоа, бидејќи апсолутната честота на оваа хаплогрупа е прилично мала, не може да се исклучи дека зголемувањето на големината на примерокот би го нарушило набљудуваниот модел на ширење.

 Наводи 

 Надворешни врски 

 Место на митохондријална ДНК на Иан Логан: Хаплогрупа М18

Категорија:Човечки мтДНК хаплогрупи