Verrucomicrobia

Verrucomicrobia е колено на бактерии. Ова колено содржи само неколку опишани видови (коленото е именувано според видот Verrucomicrobium spinosum). Досега идентификуваните видови се изолирани од слатководни средини, почви, а присутни се и во човечкиот измет. Голем број на видови кои сѐ уште не се култивирани утврдено е дека стапуваат во разни асоцијации со еукариотски домаќини како протисти и нематоди. Додека терминот verrucae е име за брадавици кои се јавуваат по рацете и нозете, ова бактериско колено не е именувано бидејќи е предизвикувачки агенс за брадавици, туку поради нивната морфологија која потсетува на брадавици.

Постојат докази дека Verrucomicrobia се наоѓаат во изобилство во животната средина, особено во почвите. Ова колено се смета дека има две сестрински колена: Chlamydiae и Lentisphaerae, кои заедно се групираат во т.н. PVC група. Коленото Verrucomicrobia може да се разликува од соседните колена во рамките на PVC групата со неколку  CSIs (анг. Conserved signature inserts and deletions). Овие CSIs претставуваат единствени, синапоморфични одлики кои сугерираат заедничко потекло на членовите во рамките на Verrucomicrobia, а истовремено ги разграничуваат од останатите бактерии. Неколку CSIs се уникатно споделувани помеѓу колената Verrucomicrobia и Chlamydiae. Овие CSIs се доказ дека Chlamydiae се најблиску сродни со Verrucomicrobia, и дека тие се посродни една со друга, отколку што било која од нив е со Planctomycetes.

Томас Кавалир-Смит има хипотизирано дека Verrucomicrobia припаѓаат на таксонот Planctobacteria, кој пак е дел на поголемиот таксон Gracilicutes. Податоците добиени од 16S рРНК го потврдуваат ова гледиште. Во 2008 година, целиот геном на Methylacidiphilum infernorum (2.3 Mbp) беше објавен. Неговиот единечен кружен хромозом кодира околу 2473 белковини, од кои 731 немаат познати хомолози. Овие анализи открија и многу можни хомологии со Proteobacteria.CS1 maint: Multiple names: authors list (link)

 Филогенија 
Филогенијата е врз основа на работата на проектот Проектот "Животно дрво на сите видови" (анг. The All-Species Living Tree Project).

 Таксономија 
Моментално прифатената таксономија се заснова на Списокот на имиња на прокариотите со евиденција во номенклатурата (анг. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature - LPSN) и Националниот центар за биотехнолошки информации (анг. National Center for Biotechnology Information - NCBI).
 Колено Verrucomicrobia Hedlund 2012 [Verrucomicrobaeota Oren et al. 2015]
 Род ?"Candidatus Epixenosoma" ♠ Bauer et al. 2005
 Вид "Candidatus Epixenosoma ejectans" ♠ Bauer et al. 2005
 Род ?Lentimonas ♠ Choo & Cho 2006
 Вид "Lentimonas marisflavi" ♠ Choo & Cho 2006
 Род? "Methyloacida" ♠ Islam et al. 2008
 Род ?"Methylacidimicrobium" ♠ van Teeseling et al. 2014
 Вид "M. cyclopophantes" ♠ van Teeseling et al. 2014
 Вид "M. fagopyrum" ♠ van Teeseling et al. 2014
 Вид "M. tartarophylax" ♠ van Teeseling et al. 2014
 Ред ?"Methylacidiphilales" ♠ Op den Camp 2009
 Фамилија "Methylacidiphilaceae" ♠ Op den Camp 2009
 Род "Methylacidiphilum" ♠ Hou et al. 2008 emend. Op den Camp et al. 2009
 Вид "M. fumariolicum" ♠ (Pol et al. 2007) Op den Camp et al. 2009
 Вид "M. infernorum" ♠ (Dunfield et al. 2007) Hou et al. 2008
 Вид "M. kamchatkense" ♠ Islam et al. 2008
 Класа ?"Spartobacteria" Sangwan et al. 2004
 Род "Candidatus Xiphinematobacter" ♠ Vandekerckhove et al. 2000
 Вид "Ca. X. americani" ♠ Vandekerckhove et al. 2000
 Вид "Ca. X. brevicolli" ♠ Vandekerckhove et al. 2000
 Вид "Ca. X. rivesi" ♠ Vandekerckhove et al. 2000
 Ред "Chthoniobacterales" Sangwan et al. 2004
 Фамилија "Chthoniobacteraceae" Sangwan et al. 2004
 Род "Chthoniobacter" ♠ Sangwan et al. 2004
 Вид "Chthoniobacter flavus" ♠ Sangwan et al. 2004
 Класа Opitutae Choo et al. 2007
 Ред Opitutales Choo et al. 2007
 Фамилија Opitutaceae Choo et al. 2007
 Род ?"Diplosphaera" ♠  Wertz et al. 2012 non Bialosuknia 1909
 Вид "Diplosphaera colitermitum" ♠  Wertz et al. 2012
 Род Alterococcus Shieh and Jean 1999
 Вид Alterococcus agarolyticus Shieh and Jean 1999
 Род Opitutus Chin et al. 2001
 Вид Opitutus terrae Chin et al. 2001
 Род Cephaloticoccus Lin et al. 2016
 Вид C. capnophilus Lin et al. 2016
 Вид C. primus Lin et al. 2016
 Ред Puniceicoccales Choo et al. 2007
 Фамилија Puniceicoccaceae Choo et al. 2007
 Род Cerasicoccus Yoon et al. 2007
 Вид C. arenae Yoon et al. 2007 (type sp.)
 Вид "C. frondis" ♠ Yoon et al. 2010
 Вид "C. maritimus" ♠ Yoon et al. 2010
 Род Coraliomargarita Yoon et al. 2007
 Вид Coraliomargarita akajimensis Yoon et al. 2007
 Род Pelagicoccus Yoon et al. 2007
 Вид P. albus Yoon et al. 2007
 Вид P. croceus Yoon et al. 2007
 Вид P. litoralis Yoon et al. 2007
 Вид P. mobilis Yoon et al. 2007 (type sp.)
 Род Puniceicoccus Choo et al. 2007
 Вид Puniceicoccus vermicola Choo et al. 2007
 Класа Verrucomicrobiae Hedlund et al. 1998 emend. Yoon et al. 2008
 Ред Verrucomicrobiales Ward-Rainey et al. 1996 emend. Yoon et al. 2008
 Фамилија Verrucomicrobia subdivision 3 [Pedosphaeraceae]
 Род ?"Pedosphaera" ♠ Ozyurt 2008
 Вид "Pedosphaera parvula" ♠ Ozyurt 2008
 Род Limisphaera ngatamarikiensis Anders et al. 2015
 Вид Limisphaera ngatamarikiensis Anders et al. 2015
 Фамилија Akkermansiaceae Hedlund & Derrien 2012
 Род Akkermansia Derrien et al. 2004
 Вид Akkermansia muciniphila Derrien et al. 2004
 Фамилија Rubritaleaceae Hedlund 2012
 Род Rubritalea Scheuermayer et al. 2006
 Вид R. halochordaticola Yoon et al. 2011
 Вид R. marina Scheuermayer et al. 2006 (type sp.)
 Вид R. sabuli Yoon et al. 2008
 Вид R. spongiae Yoon et al. 2007
 Вид R. squalenifaciens Kasai et al. 2007
 Вид R. tangerina Yoon et al. 2007
 Фамилија Verrucomicrobiaceae Ward-Rainey et al. 1996 emend. Takeda et al. 2008
 Род ?Fucophilus ♠ Sakai et al. 2001b
 Вид Fucophilus fucoidanolyticus ♠ Sakai et al. 2001b
 Род Brevifollis Otsuka et al. 2013
 Вид Brevifollis gellanilyticus Otsuka et al. 2013
 Род Haloferula Yoon et al. 2008 emend. Bibi et al. 2011
 Вид H. chungangensis Kang et al. 2013
 Вид H. harenae Yoon et al. 2008
 Вид H. helveola Yoon et al. 2008
 Вид H. luteola Bibi et al. 2011
 Вид H. phyci Yoon et al. 2008
 Вид H. rosea Yoon et al. 2008 (type sp.)
 Вид H. sargassicola Yoon et al. 2008
 Род Persicirhabdus Yoon et al. 2008
 Вид Persicirhabdus sediminis Yoon et al. 2008
 Род Luteolibacter Yoon et al. 2008
 Вид L. algae Yoon et al. 2008
 Вид L. cuticulihirudinis Glaeser et al. 2012
 Вид L. luojiensis Jiang et al. 2012
 Вид L. pohnpeiensis Yoon et al. 2008 (type sp.)
 Вид L. yonseiensis Park et al. 2013
 Род Roseibacillus Yoon et al. 2008
 Вид R. persicicus Yoon et al. 2008
 Вид R. ishigakijimensis Yoon et al. 2008 (type sp.)
 Вид R. ponti Yoon et al. 2008
 Род Roseimicrobium Otsuka et al. 2013
 Вид Roseimicrobium gellanilyticum Otsuka et al. 2013
 Род Prosthecobacter (ex Staley et al. 1976) Staley et al. 1980 emend. Takeda et al. 2008
 Вид P. algae Lee et al. 2014
 Вид P. dejongeii Hedlund et al. 1998
 Вид P. debontii Hedlund et al. 1998
 Вид P. fluviatilis Takeda et al. 2008
 Вид P. fusiformis (ex Staley et al. 1976) Staley et al. 1980 (type sp.)
 Вид P. vanneervenii Hedlund et al. 1998
 Род Terrimicrobium Qiu et al. 2014
 Вид Terrimicrobium sacchariphilum Qiu et al. 2014
 Род Verrucomicrobium Schlesner 1988
 Вид Verrucomicrobium spinosum Schlesner 1988

Забелешки:
♠  Видот се наоѓа во NCBI, но го нема во Бактериолошкиот Код (1990 година и последователните ревизии), како што е наведено во LPSN.

 Наводи 

Категорија:Бактерии
Категорија:Бактериологија
Категорија:Микробиологија
Категорија:Прокариоти