Deinococcus–Thermus

Deinococcus–Thermus е колено во кое спаѓаат бројни видови на екстремофилни бактерии.
Овие бактерии имаат дебел клеточен ѕид кој им дава Грам-позитивно обојување, но тие имаат и втора мембрана па затоа се поблиски по структура со Грам-негативните бактерии. Томас Кавалир-Смит го нарекува ова колено Hadobacteria (според грчкото име на подземјето - Хад).

 Таксономија 
Коленото Deinococcus-Thermus се состои од една класа (Deinococci) и два реда:
 Deinococcales вклучуваат две фамилии (Deinococcaceae и Trueperaceae), и три рода, Deinococcus, Deinobacterium и Truepera.Garrity GM, Holt JG. (2001) Phylum BIV. "Deinococcus–Thermus". In: Bergey’s manual of systematic bacteriology, pp. 395-420. Eds D. R. Boone, R. W. Castenholz. Springer-: New York.Garrity GM, Bell JA, Lilburn TG. (2005) Phylum BIV. The revised road map to the Manual. In: Bergey’s manual of systematic bacteriology, pp. 159-220. Eds Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM. Springer-: New York. Truepera radiovictrix е најрано дивергираниот член на редот. Родот Deinococcus формира посебен монофилектички кластер во однос на Deinobacterium и Truepera. Родот вклучува неколку видови кои се отпорни на зрачење; тие се познати по нивната способност да "јадат" јадрен отпад и други токсични материјали, и да преживуваат во вакуум простор и екстреми на топлина и студ.
 Thermales вклучуваат неколку родови отпорни на топлина (Marinithermus, Meiothermus, Oceanithermus, Thermus, Vulcanithermus, Rhabdothermus) групирани во една фамилија, Thermaceae.http://www.bacterio.cict.fr/classifphyla.html#DeinococcusThermus  Филогенетските анализи покажуваат дека во рамките наThermales, Meiothermus и Thermus видовите формираат монофилектички кластер, во однос на Marinithermus, Oceanithermus, Vulcanithermus и Rhabdothermus. Ова сугерира дека Meiothermus и Thermus видовите се повеќе сродни еден со друг во однос на другите родови во редот. Видот Thermus aquaticus бил значаен за развојот на полимераза верижната реакција (PCR).
Иако овие две групи потекнуваат од заеднички предок, механизмите на резистенција се претпоставува дека еволуирале независно.

 Молекуларни обележја 
Најдени се молекуларни обележја во форма на CSIs (анг. conserved signature indels) и белковини (CSPs) кои уникатно се споделуваат само меѓу членовите на коленото Deinococcus-Thermus. Овие CSIs и CSPs се карактеристични обележја кои го оделуваат ова колено од сите други бактериски групи и се во согласност со разликите во физиологијата. Најдени се и CSIs и CSPs, кои ја поддржуваат таксономската поделба во склоп на самото колено. Некои од CSIs кои ја поддржуваат дистинкцијата на ниво на редовите се одговорни за екстремофилните одлики. CSIs најдени во бета подединицата на ДНК-зависната РНК полимераза и ДНК топоизомеразата во Thermales видовите може да е инволвирана во термофилноста на овие бактерии, додека оние најдени во ексцинуклеаза ABC, ДНК гираза, и RadA-белковината за поправка на ДНК во Deinococcales видовите може да се инволвирани во радиорезистенцијата. Два CSPs кои уникатно се присутни во родот Deinococcus се смета дека играат улога во формирањето на карактеристичниот радиорезистентен фенотип. Овие CSPs ја вклучуваат белковината за поправка на штети PprA.

 Филогенија 
Филогенијата е заснована на 16S рРНК-заснованото LTP ослободување 123 од Проектот "Животно дрво на сите видови" (анг. The All-Species Living Tree Project).'The All-Species Living Tree' Project.

Моментално прифатената таксономија е заснована на Списокот на имиња на прокариотите со евиденција во номенклатурата (анг. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature - LPSN) и  Националниот центар за биотехнолошки информации (анг. National Center for Biotechnology Information - NCBI).
 Колено Deinococcus-Thermus [Deinococcaeota Oren et al. 2015]
 Класа Deinococci Garrity & Holt 2002 ["Hadobacteria" Cavalier-Smith 1992 emend. Cavalier-Smith 1998; Hadobacteria Cavalier-Smith 2002; "Xenobacteria"]
  Ред Deinococcales Rainey et al. 1997
 Фамилија Deinococcaceae Brooks and Murray 1981 emend. Rainey et al. 1997
 Род Deinococcus Brooks and Murray 1981 emend. Rainey et al. 1997
 Род Deinobacterium Ekman et al. 2011
  Фамилија Trueperaceae Rainey et al. 2005
 Род Truepera da Costa, Rainey and Albuquerque 2005
 Ред Thermales Rainey and Da Costa 2002
  Фамилија Thermaceae Da Costa and Rainey 2002
 Род Thermus Brook and Freeze 1969 emend. Nobre et al. 1996 
 Род Meiothermus Nobre et al. 1996 emend. Albuquerque et al. 2009
 Род Marinithermus Sako et al. 2003
 Род Oceanithermus Miroshnichenko et al. 2003 emend. Mori et al. 2004
 Род Rhabdothermus Steinsbu et al. 2011
 Род Vulcanithermus Miroshnichenko et al. 2003 

 Секвенционирани геноми 
Во моментов има вкупно 10 секвенционирани геноми на видови во ова колено.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/MICROBES/microbial_taxtree.html
 Deinococcus radiodurans R1
 Thermus thermophilus HB27
 Thermus thermophilus HB8
 Deinococcus geothermalis DSM 11300
 Deinococcus deserti VCD115
 Meiothermus ruber DSM 1279
 Meiothermus silvanus DSM 9946
 Truepera radiovictrix DSM 17093
 Oceanithermus profundus DSM 14977
Двете Meiothermus видови беа секвенционирани под покровителство на проектот Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea (GEBA), кој има за цел секвенционирање на организми за добивање на филогенетски податоци, и не е ограничен на патогените видови. Моментално, геномот на Thermus aquaticus Y51MC23 е во завршна фаза на комплетирање од страна на DOE Joint Genome Institute.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomeprj/55053

 Наводи 

Категорија:Бактерии
Категорија:Прокариоти
Категорија:Микробиологија
Категорија:Екстремофили
Категорија:Бактериологија