Актинобактерии

Актинобактериите (латински: Actinobacteria) се големо колено на Грам-позитивни бактерии со висока содржина на G:C. Можат да бидат копнени или водни форми.

 Одлики 
Тука се вклучени некои од најчестите почвени, слатководни и морски организми, кои играат важна улога во разградувањето на органските материи, како целулозата и хитинот, што ги прави витален дел во јаглеродниот циклус. На овој начин се обновуваат хранливите минерални состојки за растенијата во почвата, а се создава и хумус. Останатите актинобактерии ги населуваат растенијата и животните, каде има и неколку патогени (на пример, Mycobacterium, Corynebacterium, Nocardia, Rhodococcus и неколку видови од родот Streptomyces).

Актинобактериите се познати по производството на вторични метаболити, па затоа се предмет на интерес за фармакологијата и индустријата. Во 1940, Селман Ваксман открил дека почвените бактерии, кои тој ги проучувал, произведувале актиномицин (вид на антибиотик), поради што добил Нобелова награда. Оттогаш кај почвените микроорганизми се откриени илјадници природни антибиотици (кои не се добиени по синтетски пат), особено од родот Streptomyces.

Некои актинобактерии образуваат разгранувачки филаменти кои на некој начин наликуваат на мицелиите кај габите, поради што првобитно тие беа класифицирани под името актиномицети. Повеќето членови се аеробни, но неколку, како Actinomyces israelii, можат да растат и во анаеробни услови. За разлика од Firmicutes (другата поголема група на Грам-позитивни бактерии), овие имаат ДНК со висока содржина на G:C, а некои актиномицетни видови создаваат надворешни спори (ендоспори).

Одредени видови на актинобактерии (како на пример Streptomyces griseus) се одговорни за мирисот на почвата по орање или по дождливо време, главно во потоплите климатски подрачја.http://science.howstuffworks.com/question479.htm

 Систематика 
 Вид "Cathayosporangium alboflavum" ♠ Runmao et al. 1995
 Вид "Candidatus Planktophila limnetica" Jezbera et al. 2009
 Вид "Tonsillophilus suis" ♠ Azuma and Bak 1980
 Класа Rubrobacteria Suzuki 2013 (Rubrobacteridae Rainey et al. 1997 emend. Zhiet al. 2009)
 Ред Rubrobacterales Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
 Фамилија Rubrobacteraceae Rainey et al. 1997
 Класа Thermoleophilia Suzuki & Whitman 2013 (Thermoleophilidae)
 Ред Gaiellales Albuquerque et al. 2012
 Фамилија Gaiellaceae Albuquerque et al. 2012
 Ред Thermoleophilales Reddy & Garcia-Pichel 2009
 Фамилија Thermoleophilaceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
 Ред Solirubrobacterales Reddy & Garcia-Pichel 2009
 Фамилија Conexibacteraceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
 Фамилија Patulibacteraceae Takahashi et al. 2006 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
 Фамилија Solirubrobacteraceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi et al. 2009
 Класа Coriobacteriia Konig 2013 emend. Gupta et al. 2013 (Coriobacteridae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
 Ред Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013
 Фамилија Atopobiaceae Gupta et al. 2013
 Фамилија Coriobacteriaceae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
 Ред Eggerthellales Gupta et al. 2013
 Фамилија Eggerthellaceae Gupta et al. 2013
 Класа Acidimicrobiia Norris 2013 (Acidimicrobidae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
 Ред Acidimicrobiales Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009 [Acidimicrobineae Garrity, Bell & Lilburn 2003]
 Фамилија Acidimicrobiaceae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
 Фамилија Iamiaceae Kurahashi et al. 2009
 Фамилија "Microthrixaceae" Joseph et al. 2003
 Класа Nitriliruptoria Ludwig et al. 2013 (Nitriliruptoridae Kurahashi et al. 2010)
 Ред Egibacterales Zhang et al. 2016
 Фамилија Egibacteraceae Zhang et al. 2016
 Ред Egicoccales Zhang et al. 2015
 Фамилија Egicoccaceae Zhang et al. 2015
 Ред Euzebyales Kurahashi et al. 2010
 Фамилија Euzebyaceae Kurahashi et al. 2010
 Ред Nitriliruptorales Sorokin et al. 2009
 Фамилија Nitriliruptoraceae Sorokin et al. 2009
 Класа Actinobacteria Stackebrandt et al. 1997 (Actinobacteridae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
 Вид ?"Boyliae praeputiale" ♠ Yates et al. 2002
 Ред ?"Actinomarinales" Ghai et al. 2013 ["Actinomarinidae" Ghai et al. 2013]
 Фамилија "Actinomarinaceae" Ghai et al. 2013
 Ред Acidothermales Sen et al. 2014
 Фамилија Acidothermaceae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi et al. 2009
 Ред "Catenulisporales" Donadio et al. 2012 (Catenulisporineae Cavaletti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009)
 Фамилија Actinospicaceae Cavaletti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009
 Фамилија Catenulisporaceae Busti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009
 Ред "Streptomycetales" Kampfer 2012 (Streptomycetineae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
 Фамилија Streptomycetaceae Waksman & Henrici 1943 emend. Zhi et al. 2009
 Ред Geodermatophilales Sen et al. 2014
 Фамилија Geodermatophilaceae Normand 2006 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
 Ред Frankiales Sen et al. 2014 (Frankineae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
 Фамилија Motilibacteraceae Lee 2013
 Фамилија Cryptosporangiaceae Zhi, Li & Stackebrandt 2009
 Фамилија Frankiaceae Becking 1970 emend. Zhi et al. 2009
 Фамилија Sporichthyaceae Rainey et al. 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
 Ред Nakamurellales Sen et al. 2014
 Фамилија Nakamurellaceae Tao et al. 2004 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009 [Microsphaeraceae Rainey et al. 1997]
 Ред "Kineosporiales" Kampfer 2012 (Kineosporineae Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
 Фамилија Kineosporiaceae Zhi, Li & Stackebrandt 2009
 Ред Micrococcales Prevot 1940 [Arthrobacteria; Micrococcineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Yassin et al. 2011; incl. Flavobacterium oceanosedimentum; Bifidobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009; Actinomycetales Buchanan 1917 emend. Zhi et al. 2009]
 Фамилија Intrasporangiaceae
 Фамилија Microbacteriaceae
 Фамилија Cellulomonadceae
 Фамилија Promicromonosporaceae
 Фамилија Sanguibacteraceae
 Фамилија Rarobacteraceae
 Фамилија Jonesiaceae
 Фамилија Bogoriellaceae
 Фамилија Beutenbergiaceae
 Фамилија Ruaniaceae
 Фамилија Actinomycetaceae
 Фамилија Demequinaceae
 Фамилија Dermabacteraceae
 Фамилија Brevibacteriaceae
 Фамилија Micrococcaceae {incl. Bifidobacteriaceae]])
 Ред "Propionibacteriales" Patrick & McDowell 2012 (Propionibacterineae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
 Фамилија Nocardioidaceae
 Фамилија Propionibacteriaceae
 Ред "Streptosporangiales"  Goodfellow 2012  (Streptosporangineae  Ward-Rainey et al. 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
 Фамилија Streptosporangiaceae
 Фамилија Nocardiopsaceae
 Фамилија Thermomonosporaceae
 Ред "Jiangellales" Tang et al. 2012 (Jiangellineae  Tang et al. 2011)
 Фамилија Jiangellaceae Tang et al. 2011
 Ред "Glycomycetales"  Labeda 2012  (Glycomycetineae  Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
 Фамилија Glycomycetaceae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
 Ред "Micromonosporales"  Genilloud 2012  (Micromonosporineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009 ; Actinoplanales]
 Фамилија Micromonosporaceae
 Ред "Pseudonocardiales"  Labeda & Goodfellow 2012 (Pseudonocardineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Labeda et al. 2011)
 Фамилија Pseudonocardiaceae
 Ред "Corynebacteriales" Goodfellow & Jones 2012 (Corynebacterineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009; Mycobacteria)
 Фамилија Segniliparaceae
 Фамилија Nocardiaceae [Gordoniaceae; Williamsiaceae]
 Фамилија Dietziaceae
 Фамилија Corynebacteriaceae
 Фамилија Tsukamurellaceae
 Фамилија Mycobacteriaceae

Забелешки: ♠ Видови кои се наведени во NCBI, но не во LSPN.

 Поважни родови 

Повеќето актинобактерии кои се важни од медицински или економски аспект се наоѓаат во поткласата Actinobacteridae, ред Actinomycetales. Додека многу од нив предизвикуваат заболувања кај луѓето, родот Streptomyces е важен извор на антибиотици.

Од актинобактериите кои не се наоѓаат во Actinomycetales, Gardnerella е најистражувана. Нејзината систематика е контроверзна, при што MeSH ја класифицира и како Грам-позитивна, и како Грам-негативна бактерија.

Секвенционирани (или во фаза на секвенционирање) се 44 геноми од актинобактерии.

 Наводи 

Категорија:Бактерии
Категорија:Грампозитивни бактерии
Категорија:Бактериологија
Категорија:Микробиологија
Категорија:Прокариоти