Nukleotidas

(Deoksi)nukleotidai – (deoksi)nukleozidų, kurie sudaryti iš heterociklinės bazės ir cukraus, fosfatai. Iš jų net tik sudaromi biopolimerai DNR ir RNR, bet jie įeina ir į kai kurių kofaktorių (NAD, NADP, KoA, FAD, FMN) sudėtį. Nukleotidai atlieka svarbų vaidmenį ląstelės metabolizme, signalo perdavime.Juodka Benediktas (1989). Nukleino rūgščių, chemijos ir biochemijos pagrindai. Vilnius, „Mokslas“, 1989, 271p. 

 Nomenklatūra 
Nukleotidų pavadinimai sudaromi iš keturių raidžių.
 Pirmoji (mažoji) nurodo ar nukleotidas yra ribonukleotidas, ar deoksiribonukleotidas. Ribonukleotido atveju pirmoji raidė nerašoma, o deoksiribonukleotido atveju rašoma d.
 Antroji (didžioji) raidė nurodo kokia heterociklinė bazė įeina į nukleotido sudėtį:
 G: Guaninas
 A: Adeninas
 T: Timinas paprastai aptinkamas DNR sudėtyje
 C: Citozinas
 U: Uracilas paprastai aptinkamas RNR sudėtyje
 Trečioji (didžioji) raidė nurodo kiek fosforo rūgšties liekanų yra nukleotido sudėtyje: viena (M; Mono-), dvi (D; Di-), trys (T; Tri-).
 Ketvirtoji raidė P nurodo, kad sudėtyje yra fosforo rūgšties liekanų.

Pavyzdžiui, deoksi citidin tri fosfatas sutrumpintai žymimas dCTP.

 (Deoksi)nukleotidų struktūra 
Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie ribonukleozidų, turime ribonukleotidus, jei prie deoksiribonukleozidų – deoksiribonukleotidus. Pirmieji yra RNR monomerai, antrieji – DNR monomerai. Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie adenozino 5'-hidroksilo grupės, turime adenozin-5'-fosfatą, jei prie uridino 2'-hidroksilo grupės – turime uridin-2'-fosfatą, jei prie deoksitimidino 3'-hidroksilo grupės – deoksitimidin-3'-fosfatą.

 Nukleotidai 
 310px|Chemical structure of adenosine monophosphateAdenozinmonofosfatasAMP 156px|Chemical structure of adenosine diphosphateAdenozindifosfatasADP 186px|Chemical structure of adenosine triphosphateAdenozintrifosfatasATP 154px|Chemical structure of guanosine monophosphateGuanozinmonofosfatasGMP 184px|Chemical structure of guanosine diphosphateGuanozindifosfatasGDP 300px|Chemical structure of guanosine triphosphateGuanozintrifosfatasGTP 117px|Chemical structure of thymidine monophosphateTimidinmonofosfatasTMP 148px|Chemical structure of thymidine diphosphateTimidindifosfatasTDP 178px|Chemical structure of thymidine triphosphateTimidintrifosfatasTTP 117px|Chemical structure of uridine monophosphateUridinmonofosfatasUMP 148px|Chemical structure of uridine diphosphateUridindifosfatasUDP 178px|Chemical structure of uridine triphosphateUridintrifosfatasUTP 117px|Chemical structure of cytidine monophosphateCitidinmonofosfatasCMP 148px|Chemical structure of cytidine diphosphateCitidindifosfatasCDP 178px|Chemical structure of cytidine triphosphateCitidintrifosfatasCTP

 Deoksinukleotidai 

 126px|Chemical structure of deoxyadenosine monophosphateDeoksiadenozinmonofosfatasdAMP 156px|Chemical structure of deoxyadenosine diphosphateDeoksiadenozindifosfatasdADP 186px|Chemical structure of deoxyadenosine triphosphateDeoksiadenozintrifosfatasdATP 154px|Chemical structure of deoxyguanosine monophosphateDeoksiguanozinmonofosfatasdGMP 184px|Chemical structure of deoxyguanosine diphosphateDeoksiguanozindifosfatasdGDP 214px|Chemical structure of deoxyguanosine triphosphateDeoksiguanozintrifosfatasdGTP 118px|Chemical structure of deoxythymidine monophosphateDeoksitimidinmonofosfatasdTMP 148px|Chemical structure of deoxythymidine diphosphateDeoksitimidindifosfatasdTDP 178px|Chemical structure of deoxythymidine triphosphateDeoksitimidintrifosfatasdTTP 118px|Chemical structure of deoxyuridine monophosphateDeoksiuridinmonofosfatasdUMP 148px|Chemical structure of deoxyuridine diphosphateDeoksiuridindifosfatasdUDP 178px|Chemical structure of deoxyuridine triphosphateDeoksiuridintrifosfatasdUTP 118px|Chemical structure of deoxycytidine monophosphateDeoksicitidinmonofosfatasdCMP 148px|Chemical structure of deoxycytidine diphosphateDeoksicitidindifosfatasdCDP 178px|Chemical structure of deoxycytidine triphosphateDeoksicitidintrifosfatasdCTP

 Nukleotidų gavimas 
Iš nukleotidų sudarytos nukleino rūgštys, tad nukleotidai paprastai gaunami jas hidrolizuojant. Hidrolizuojant RNR šarmais gaunama nukleozid-2'-fosfatų ir nukleozid-3'-fosfatų mišinys. Paveikus DNR arba RNR įvairiais fermentais, susidaro ir nukleozid-5'-fosfatų. Nukleino rūgščių hidrolizės produktai rodo, kas rūgšties liekana nukleotiduose gali jungtis prie nukleozidų 2'-hidroksilo, 3'-hidroksilo arba 5'-hidroksilo grupių.

 Nukleotidų funkcijos 
Nukleotidai įeina ne tik į nukleino rūgščių, bet ir į nukleotidinių kofermentų
 nikotinamidadenindinukleotido (NAD+),
 jo fosforilinto analogo NADP+,
 flavinadenindinukletido (FAD),
 flavinmononukleotido (FMN),
 kofermento A (KoA) ir kt. sudėtį.
Organizme būna ir laisvų nukleotidų. Nukleotidais vadinami ir nukleozid-5'-difosfatai ir trifosfatai. Šie polifosfatai yra labai svarbūs ląstelės bioenergetikai, ypač adenozin-5'-trifosfatas (ATP). Nukleozid-5'-trifosfatai yra nukleino rūgščių biosintezės substratai. Labai svarbūs yra ir nukleozid-3',5'-ciklofosfatai, ypač adenozin-3',5'-ciklofosfatas, kuris yra daugelio hormonų veikimo tarpininkas.

 Šaltiniai 

Kategorija:Nukleorūgštys