SARS-CoV-2

SARS-CoV-2 aut 2019-nCoV, anni 2019 coronavirus novum sive coronarium virus novum sive coronarium virus syndromatis respiratorii acuti gravis 2 est virus biologicum, unum ex duobus sarbecoviris generis Betacoronavirorum,Historia taxonomiarum,  materia genetica ARN munitum atque monocatenarium sensu positivo ((+)ssRNA), ex fere 29 900 nucleotidis (29.9 kB) compositum.

Variantes typi SARS-CoV-2 geneticae descriptae sunt.

Virus anno 2019 Wuhan in urbe Sinica, climate subtropico humido, primo agnotum est; ibi multi homines pneumonia laborantes observati sunt. Putatur novum coronavirus 2019-nCoV, ut SARS-CoV originis zoonoticae esse. Qua de causa morbus respiratorius designatur zoonosis nomine COVID-19 (morbus coronaviri anno 2019 agnotum, interdum vulgo pneumonia Wuhaniensis).

Morbus hic, ex Sinis egressus, tribus mensibus (mensibus Decembri anni 2019 et Ianuario Februarioque anni 2020) se in multas orbis terrarum civitates propagabat.

 Natura coronaviri SARS-CoV-2 
 Aspectus 
Viro capsida est, ut omnibus coronaviris, sub microscopio electronico formae coronae, de qua virus nomen suum emanavit. 

Diameter circiter 50–200 nm (cf. Influenza A virus: 80-120 nm) metitur.

Intra virus invenitur genoma ex ARN compositum, quod cinctum est globuliformi capsida; illae sunt duo genera proteinorum, E et M. Superficie eius permultae spinae locatae sunt. Licet, ut non solum virus SARS-CoV, sed etiam SARS-CoV-2 spinis his enzymum angiotensinum convertens 2 attingeret.

 Taxinomia 
In virologia, ut influenza A virus, phylo negarnaviricotorum attributum est. Quamquam adhuc novum hoc coronavirus in taxinomia ICTV officiali (2018b) non inclusum est, tamen putatur se sarbecoviris attribuendum esse sub Betacoronaviris in ordine Nidoviralium. SARS-CoV-2 est virus biologicum cum ARN substantia genetica. 

 Virus monocatenarium et sensu positivo 
Coronovirus Wuhaniense est virus ARN monocatenarium sensu positivo, quod significat: 
 Materia genetica eius ex acido ribonucleico (ARN) constat,
 catenam simplicem (Anglice: single-stranded, ss), non duplicem format,
 intra cellulam alienam directe (sensu positivo (+), (5'-ad-3') transferri potest.

 Genoma 
Genoma viri SARS-CoV-2 illo viri SARS-CoV valde simile videtur: circiter 79% codicis genetici sunt eiusdem ordinis. Similitudo genomati unius vespertilionis betacoronavirorum etiam 96.3% aestimata est. Pro eo quidam originem pandemiae 2020 ex vespertilionibus esse putant. Videntur mutationes geneticae betacoronaviri vespertilionis (at non SARS-CoV) ad glycoproteinum spinas externas formantes velut ad proteinum capsidae spectare.

 Structura principalis virorum SARS et SARS-CoV-2  
Genomati virorum SARS partes insunt diversae regiones ORF (Anglice: open reading frames, margines lectoriae apertae); velut proteina structurae, vocitantur S, E, M, N; in SARS-CoV-2:
 M. L. A.  Litt.  Productum  Genum  Numerusaminoacidorum  Notae  Fons ORF1a     4 405  16 proteinorumnon structuralium  UniprotUniporot de A7J8L3 ORF1b      UniprotUniprot de A0A1S6L957 ORF2  S  Spinae /protuberantiae   1 282  proteinum structuralespinarum  ORF3a   proteina accessoria   275   ORF3b     proteinum novum   ORF4  E  proteinum E   75  proteinum structuralecapsidae  ORF5  M  proteinum M   222  proteinum structurale  ORF6   proteina accessoria   61   ORF7a    121   ORF7b      ORF8    121   ORF9a  N  Nucleocapsidum    proteinum structuralenucleocapsidi  ORF9b  419   ORF10*       Summa   9 860  29 891 nucleotida 
Genum haemagglutinini esterasis, ut in alphacoronaviris (αCoV), in SARS-CoV-2 abest.

 ORF1a/ORF1b 
Partibus ORF1a et ORF1b genomatis informatio proteinorum 16 non structuralium (pns 1-16) insunt ut:
 pns3 = PSpro (papaino similis proteasis, PLpro)
 psn5 = 3CSpro (picornaino 3C similis proteasis, 3CLpro)
 psn12 = RdRp (ARN dependens ARN polymerasis)
 psn13 = Hel/MTasis (helicasis)
 psn14 = ExoN/N7-MTasis (exoribonucleasis)
 psn15 = NendoU (Nidovirorum endoribonucleasis Uridylati)
 psn16 = 2'-O-MTasis

 Varietates geneticae 
SARS CoV 2 varietates frequenter evolvunt. Adhuc variantes geneticae proteini S se evolvebant. 
 Varietates proteini S 
Adhuc plus quam 4000 mutationes geneticae notae sunt. Per exemplum:
 Varietas D614G proteini S G614 (origine D614) contagionis probabilitatem auget.
 Varietas alpha: Varietas N501Y (Varietas curae laborantis 202012 et 01 sive 20B/501Y.V1 sive B.1.1.7), primum in Cantio, Britanniarum regni cognoscitur.
 Varietas 501Y.V2 eiusdem mutationis geneticae N501Y in Africae Australis inventa est.
 Varietas delta: B.1.617.2
 Varietas omicron: B.1.1.529 cum evasione antigenica maiore currente

 Effectus in organisma in gradu moleculari habitus
Receptorium virorum et SARS-CoV et SARS-CoV-2 videtur enzymum angiotensinum convertens 2, quod in variis organis locatum est, imprimis in cellulis alveolaribus pulmonum velut enterocytis intestini tenuis, paulo minus in aliis partibus organismi, ut in tractu gastrointestinali, renibus, cute.

 Vitae tempus extra organismum 
Uniformis informatio temporis vitae novi coronaviri potuit elaborari, valores scilicet adhuc divulgati ab horis paucis ad dies multos variant, sane de variis generis superficierum pendentes:
 Vira in liquoribus usque ad 3 horas, in cupro ad 4 horas, in chartoni ad 24 horas, in materia plastica et in aciario inoxidabili ad septuaginta duo (imprimis tredecim plasticae, sedecim aciarii) horas consistere videntur.

 Morbi cum viro coniuncti 
In natura viri SARS-CoV in vespertilionibus versantur; cetera vero coronavirorum etiam in avibus. Virus SARS-CoV-2 est unum ex septem coronaviris (OC43, HKU1, NL63, 229E, MERS-CoV, SARS-CoV), quod homines afficere potest. Anno 2020 permultae contagiones causa fuerunt pandemiae, cuius morbi nomen COVID-19 iussum est.

 Habitationes naturales 
Nondum in homines morbo propagato hoc virus in vespertilionibus versabatur. 

Iam anno 2015 in vespertilionibus diversa quinque genomata virorum SARS investigabantur. Hodie coniunctio inter vira SARS vespertilionum et homines putatur: post mutationes minores et glycoproteini S spinarum et capsidae viri in homines diffuderunt.

 Vespertiliones et transmissio virorum 

Vespertiliones chiropteris attribuuntur. Post rodentia chiropteris sunt genera plus quam mille, secunda omnium mammalium. Animalia haec in transmissione plus quam sexaginta virorum vincta sunt. Suspicatur inter chiroptera quibusdam speciebus facultatem esse certa vira disseminandi vel transmittendi - ut quaedam ex coronaviridis, rhabdoviridis, paramyxoviridis, ebolaviris .

 COVID-19 

 Periodus incubationis 
Tempus inter contagionem et symptomata prima plerumque dies quinque (2-14), rarius ad viginti quattuor dies complectitur.

 Symptomata 
Primum febris, myalgiae (dolores musculorum), et tussis sicca oriuntur, communiter cum generali corporis fatigatione vel lassitudine, ex quo pneumonia (inflammatio pulmonum vel partium illorum) observari potest.

 Historia et 
Iam mense Decembris anni 2019 in Sinis quidam homines pneumonias contraxerunt. Suspicatae origines sunt nundinae conchyliorum in urbe Wuhan. Tempore brevi contagiones viro toto in orbe terrarum porrexerunt, proinde die 11 Martii 2020 Ordo mundi sanitarius COVID-19 pandemiam declaravit.

 Notae 

 Epidemia
 Pandemia
 Vaccinum ARN

 Nexus externi 

 Ordo mundi sanitarius de coronaviro novo, 2019-nCoV. 
 gisaid.org Missionis GISAID situs interretialis 

Categoria:Nidovirales
Categoria:Riboviria
Categoria:Vira
Categoria:COVID-19
Categoria:COVID-19 pandemia