PROSITE

PROSITE는 단백질 데이터베이스이다. 단백질 패밀리, 도메인, 활성 부위, 아미노산의 패턴 및 특성을 설명하는 항목으로 구성된다. 이는 스위스 생물정보학 연구소의 팀이 직접 선별하고 Swiss-Prot 단백질 주석에 긴밀하게 통합시켜 제작하였다. PROSITE는 1988년 Amos Bairoch에 의해 만들어졌으며, 그는 20년 이상 그룹을 이끌었다. 2018년 7월부터 PROSITE 및 Swiss-Prot의 책임자는 Alan Bridge이다.

PROSITE는 새로 발견된 단백질의 기능을 식별하고, 기존에 알려지지 않은 활성을 가진 단백질을 분석하는 데 사용된다. 잘 연구된 유전자의 특성을 생물학적으로 관련된 유기체에 적용할 수 있으며, 서로 다르거나 잘 알려지지 않은 유전자의 경우 유사성을 기반으로 생화학적 기능을 예측할 수 있다. PROSITE는 단백질 서열 분석 및 모티프 탐지 도구를 제공한다. PROSITE는 ExPASy 단백질체 분석 서버의 일부이다.

ProRule 데이터베이스는 PROSITE의 도메인 설명을 기반으로 한다. 기능적으로 또는 구조적으로 중요한 아미노산에 대한 추가 정보를 제공한다. 활성 부위, 기질 또는 보조 인자 결합 부위, 번역 후 변형 부위 또는 이황화 결합과 같은 생물학적으로 의미 있는 잔기에 대한 정보가 포함되어 있어 기능 결정에 도움이 된다. 이러한 ProRule은 PROSITE 모티프를 기반으로 주석을 자동으로 생성할 수 있다.

 통계 
2022년 2월 26일 기준으로, 2022_01 릴리스에는 1,902개의 문서, 1,311개의 패턴, 1,336개의 프로필, 1,352개의 ProRule이 포함되어 있다.

 관련 항목 

 유니프롯(Uniprot): 정보에 대한 핵심 자료원인 범용 단백질 데이터베이스이며, PROSITE는 여기에 데이터를 추가한다.
 InterPro: 단백질 패밀리, 도메인 및 기능 부위 데이터베이스의 데이터를 그룹화하는 중앙 집중식 데이터베이스이며, 데이터의 일부는 PROSITE에서 제공된다.
 단백질 세포 내 위치 예측(Protein subcellular localization prediction): PROSITE 활용의 또 다른 예시이다.

 참고 자료 

 외부 링크 


 ProRule: PROSITE에 기반을 둔 데이터베이스

분류:단백체학