BGI 그룹

BGI 그룹(BGI Group, 과거 명칭 베이징 유전체 연구소)은 선전시 옌톈구에 본사를 둔 중국의 유전체학 기업이다. 이 회사는 원래 1999년 인간 유전체 프로젝트에 참여하기 위한 유전학 연구 센터로 설립되었다. 또한 다른 동물, 식물 및 미생물의 유전체를 시퀀싱한다.

BGI는 팬더와 쌀 식물의 DNA를 해독한 것으로 유명한 소규모 연구소에서 동물 복제, 건강 검사 및 수탁 연구 분야에서 활동하는 다각화된 기업으로 변모했다. BGI의 초기 연구는 중국과학원 산하 베이징 유전체 연구소(Beijing Institute of Genomics)에 의해 이어졌다. 그룹의 비영리 부문인 BGI Research는 유전체 연구소와 협력하며 중국 정부와의 계약에 따라 China National GeneBank를 운영한다. 자회사인 BGI Genomics는 2017년 선전 증권거래소에 상장되었다. 이 회사는 여러 중국 정부 안내 기금(China Government Guidance Funds)과 중국 국유기업의 지원을 받는다.

2021년부터 BGI 그룹과 관련된 여러 논란에 대한 세부 사항이 밝혀졌다. 이러한 논란에는 중국 인민해방군(PLA)과의 협력 혐의 및 산전 검사를 통한 유전 데이터 사용이 포함된다. BGI는 산전 유전 데이터를 PLA와 공유한다는 사실을 부인했다.

 역사 

 베이징 유전체 연구소 

왕젠, 위준, 양환밍 및 류쓰치는 1999년 9월 중국 베이징에서 인간 유전체 프로젝트에 중국 대표로 참여하기 위해 비정부 독립 연구소로서 BGI(당시 명칭 베이징 유전체 연구소)를 설립했다.The dragon's DNA , Jun 17th 2010, The Economist 프로젝트 완료 후 자금이 고갈되자, BGI는 항저우 시정부의 자금 지원을 대가로 항저우시로 이전했다. 2002년 BGI는 쌀 유전체를 시퀀싱했으며, 이는 저널 사이언스의 표지 기사로 다뤄졌다. 2003년 BGI는 SARS 바이러스 유전체를 해독하고 바이러스 검출 키트를 제작했다. 2003년 중국과학원은 BGI와 협력하여 베이징 유전체 연구소를 설립했으며, 양환밍이 초대 소장을 맡았다. BGI 항저우와 저장 대학 또한 새로운 연구소인 저장 대학 제임스 D. 왓슨 유전체 과학 연구소를 설립했다.

 베이징 유전체 연구소로부터의 분사 
2007년 BGI는 중국과학원에서 분리되어 민간 기업이 되었으며 선전시로 이전했다. 위준은 이 무렵 BGI를 떠나며 자신의 지분을 다른 3명의 설립자에게 명목상의 금액으로 매각한 것으로 알려졌다. 2008년 BGI는 아시아인의 첫 번째 인간 유전체를 발표했다.Ye, Jia (2008) An Interview with a Leader in Genomics — Beijing Genomics Institute  Asia Biotech, Retrieved 14b January 2013

2010년 BGI는 일루미나(Illumina) HiSeq 2000 유전자 시퀀싱 장비 128대를 구입했으며,Kevin Davies, (27 September 2011) The Bedrock of BGI: Huanming Yang  Bio-IT World, Retrieved 14 January 2014 이는 국영 대출 기관인 국가개발은행으로부터 향후 10년간 15억 달러의 "협력 자금"을 지원받아 이루어졌다. 연말까지 그들은 3,000만 달러의 예산을 확보한 것으로 보고되었다. 2010년 BGI 아메리카가 미국 케임브리지 매사추세츠주에 본사를 두고 설립되었으며, BGI 유럽이 덴마크 코펜하겐에 설립되었다. 2018년까지 BGI는 미국의 시애틀과 산조세 캘리포니아주, 영국의 런런에 사무소와 실험실을 열었으며, 홍콩, 고베시(일본), 방콕(태국), 라오스, 싱가포르, 브리즈번(호주) 등에 사무소를 둔 BGI 아시아 태평양이 설립되었다.

2011년 BGI는 4,000명의 과학자와 기술자를 고용하고 있으며,Lone Frank, High-Quality DNA , Apr 24, 2011, The Daily Beast 1억 9,200만 달러의 매출을 기록했다고 보고했다. BGI는 3일 만에 치명적인 2011년 독일 슈퍼박테리아 확산 사태의 원인인 대장균 유전체 시퀀싱을 완료하고 오픈 라이선스로 공개했다. 2012년부터는 차이나 생명보험, 중신그룹의 골드스톤 인베스트먼트, 마윈의 Yunfeng Capital, 소프트뱅크 차이나 캐피탈 등의 투자를 받아 서비스를 상업화하기 시작했다. 그해 그들은 데이터 집약적인 생명과학 논문을 발표하기 위해 바이오메드 센트럴과 협력하여 자체 과학 저널인 GigaScience를 창간했다. 이후 BGI의 GigaScience Press 부서와 옥스퍼드 대학교 출판부 사이에 새로운 파트너십이 형성되었으며, 2017년부터 GigaScience는 옥스퍼드 대학교 출판부와 공동 출판되고 있다. 2025년 9월 BGI는 국제 편집, 소프트웨어 및 GigaDB 팀을 해고했으며, BGI 수석 과학자 쉬쉰은 자신을 출판인 및 편집장으로 임명했다. 2025년 11월, 어떠한 협의도 없었다는 점과 이러한 변화가 엄격하게 검토되고 재현 가능한 연구를 출판하려는 저널의 오랜 약속에 영향을 미칠 수 있다는 우려를 이유로 편집위원회의 대다수가 사임했다.

2013년 BGI는 미국 외국인 투자 심의 위원회의 승인을 얻은 후 DNA 시퀀싱 기술의 주요 공급업체인 미국 마운틴뷰 (캘리포니아주)의 Complete Genomics를 1억 1,800만 달러에 인수했다. Complete Genomics는 MGI의 미국 기반 자회사이며, MGI는 2022년 상하이 증권거래소에 상장되기 전까지 BGI의 자회사였다.

2015년 BGI는 상하이 중산 병원 임상 정밀 의학 센터와 협력 계약을 체결했으며, 2015년 5월에 1억 위안의 예산으로 문을 열었다. 그들은 15년 동안 지속될 중국의 92억 달러 규모 의료 연구 프로젝트에서 시퀀싱 기관으로 참여하고 있는 것으로 알려졌다. 2017년 5월, 시애틀과 산조세에 공동 위치한 웨스트코스트 혁신 센터 설립이 발표되었으며, 시애틀에서는 정밀 의학 연구와 워싱턴 대학교, Allen Institute for Brain Science, 빌 & 멜린다 게이츠 재단, 워싱턴 주립 대학교와의 협력이 계획되었고, 산조세에서는 이미 100명의 직원이 있는 기존 연구소에서 차세대 시퀀싱 기술을 개발하고 있다. 2018년 5월에는 캐나다 Mount Sinai Hospital (Toronto)와 북미 최초의 BGISEQ 플랫폼 설치를 위한 합의에 도달했다.

그룹의 자회사인 BGI Genomics는 2017년 7월 선전 증권거래소에서 기업공개를 단행했다. 2018년 보고에 따르면 BGI는 왕젠이 85.3%를 소유하고 있으며, 그룹은 핵심 부문인 BGI Genomics의 지분 42.4%를 보유하고 있다.

2019년, BGI 자회사인 Forensic Genomics International이 전국의 사람들에 대한 유전적 프로필을 담은 위챗 연동 데이터베이스를 구축했다는 사실이 보도되었다. 2020년 7월에는 BGI가 언론의 조사를 받은 후 급여 보호 프로그램(Paycheck Protection Program) 대출금을 반환했다는 소식이 전해졌다.

2021년, 국영 기업인 자오상쥐와 국가개발투자공사(State Development and Investment Corporation)가 BGI Genomics의 지분을 인수했다.

 미국의 제재 

2020년 7월, 미국 상무부 산하 산업안보국은 신장 위구르 자치구에서의 유전적 분석 작업으로 인한 인권 침해 조력 혐의로 BGI의 자회사 두 곳을 거래 제한 목록에 올렸다. 2023년 3월, 미국 상무부는 소수 민족에 대한 감시 및 억압 혐의로 BGI Research와 BGI Tech Solutions (Hongkong)를 거래 제한 목록에 추가했다.

BGI는 이후 BGI와 그 자회사에 대한 정부 자금 지원을 금지하는 2024 회계연도 국방수권법의 문구를 완화하기 위해 Steptoe & Johnson의 로비스트를 고용했다.

2024년 현재, BGI는 미국 국방부가 작성한 미국 내에서 활동하는 중국 군사 기업 목록에 올라와 있다. 2024년 4월, 미국 하원 중국전략경쟁특별위원회(United States House Select Committee on Strategic Competition between the United States and the Chinese Communist Party)는 국방부에 BGI 자회사인 Innomics와 STOmics가 동일한 목록에 포함되지 않은 이유에 대한 설명을 요청했다.

 연구 
 대장균 
2011년 BGI는 항생제 내성을 유발하는 유전자를 식별하기 위해 유럽에서 유행한 대장균 박테리아의 유전체를 시퀀싱했다.

 COVID-19 
2020년 1월, BGI Genomics는 코로나19를 유발하는 SARS-CoV-2 바이러스를 식별하는 데 도움이 되는 실시간 형광 RT-PCR 키트를 발표했다. 이는 이후 세계보건기구의 긴급 사용 목록을 포함하여 14개 국가 및 지역에서 검증 및 사용 승인을 받았다. BGI Genomics는 2021년 4월까지 RT-PCR 키트가 180개 이상의 국가 및 지역에 배포되었다고 보고했다. 또한 BGI는 훠옌(Huo-Yan) 실험실이라는 명칭의 생물안전 등급 2 고처리량 핵산 검출 실험실을 개발했다.

2020년 상반기에 BGI 그룹은 캘리포니아주에 코로나19 테스트 실험실 설치를 실비로 돕겠다고 제안했다. 캘리포니아주 정부는 지정학적 우려로 이 제안을 거절했으나, 산타클라라군은 BGI로부터 코로나19 테스트 키트와 장비를 구입했다.

2020년 8월 25일, 로이터는 스웨덴에서 약 3,700명의 사람들이 BGI Genomics의 코로나19 테스트 키트 결함으로 인해 코로나바이러스에 감염되었다는 잘못된 통보를 받았다고 보도했다. WHO 긴급 사용 목록에 다섯 번째로 등재되었고, 시판되는 테스트들을 독립적으로 검증한 네덜란드의 연구에서 민감도 테스트 최고점을 받았음에도 불구하고, BGI Genomics는 매우 낮은 수준의 바이러스를 감지할 때 실험실마다 사용하는 기준치의 차이 때문이라며 제품을 옹호했다.

 생물정보학 기술 

컴퓨터 센터의 연간 예산은 900만 달러였다. 같은 해, BGI의 계산 생물학자들은 드 노보(de novo) 시퀀싱 동안 차세대 시퀀서(특히 일루미나의 Genome Analyzer)가 생산하는 수십억 개의 25~75염기쌍 스트링을 정렬하기 위해 그래프 이론에 기반한 첫 번째 성공적인 알고리즘을 개발했다.

SOAPdenovo는 인간 크기 유전체의 드 노보 어셈블리, 정렬, SNP 검출, 재시퀀싱, indel 찾기 및 구조적 변이 분석을 위해 BGI가 개발한 툴 세트인 "SOAP"(Short Oligonucleotide Analysis Package)의 일부이다. 일루미나 시퀀서의 짧은 리드(short reads)를 위해 제작된 SOAPdenovo는 다수의 인간 유전체 (인간 참조 유전체에 매핑하여 감지되지 않은 8킬로바이트 삽입 식별)와 자이언트 판다와 같은 동물의 조립에 사용되었다.

2015년까지 BGI는 Thermo Fisher Scientific의 Ion Torrent 장치에 기반한 BGISEQ-100과 BGISEQ-1000을 출시했으며, 두 기기 모두 NIFTY(비침습적 태아 삼염색체성 테스트) 산전 검사에 대해 중국 국가식품약품감독관리국의 승인을 받았다. 2015년 10월, BGI는 대형 데스크탑 시퀀싱 시스템인 BGISEQ-500을 출시했다. 2016년 말까지 이 시스템에 대해 500건 이상의 주문을 받았으며 112,000회 이상의 테스트를 실행한 것으로 보고되었다. 2016년 9월 BGI와 중국 정부에 의해 개소된 China National GeneBank는 해당 시스템 기기를 150대 보유하고 있다. BGISEQ-500은 일루미나의 플랫폼과 경쟁할 수 있는 시퀀싱 플랫폼으로 개발되었다. 2016년 11월, BGI는 데스크탑 시퀀서의 소형 버전인 BGISEQ-50을 출시했다. 2017년에 BGI는 WGS를 600달러에 제공하기 시작했다. 2022년 9월, MGI는 새로운 초고속 중저처리량 시퀀서인 DNBSeq-G99를 출시했다.

2021년 BGI는 유전체 전반의 공간 전사체학 기술인 Stereo-seq을 개발했으며, 2022년에 이 기술을 사용하는 과학 사용자 컨소시엄의 첫 번째 연구 결과를 발표했다. 2022년, BGI Research와 중국과학원대학은 전 세계 과학자들과 협력하여 시퀀싱 기술을 사용해 단일 세포 시퀀싱을 수행함으로써 초기 인간 배아 발달에 대한 이해를 넓혔으며, 비인간 영장류의 첫 번째 전신 세포 지도 완성, 세계 최초의 돼지 전신 단일 세포 전사체 지도 완성, 그리고 개별 세포 수준에서의 뇌 기능 전문화가 개미 군집 내의 사회적 노동 분업을 어떻게 결정하는지 설명하기 위해 개미의 뇌를 연구했다.

 농업 및 생물 다양성 

2002년 BGI는 인디카(indica) 품종 쌀의 유전체를 발표했다. 2014년 BGI는 89개국에서 수집된 3,000개의 쌀 유전체를 재시퀀싱하는 프로젝트에도 협력했다.

BGI는 지구상의 모든 알려진 진핵 생물 종의 DNA 시퀀싱을 목표로 하는 국제 지구 바이오게놈 프로젝트(Earth BioGenome Project)의 회원이다. BGI는 10,000종 이상의 식물 유전체를 시퀀싱하는 제휴 프로젝트인 10KP 유전체 시퀀싱 프로젝트에 기여해 왔다.

 동물계 

2004년 BGI는 닭의 유전체를 발표한 국제 닭 유전체 컨소시엄(International Chicken Genome Consortium)의 회원으로 활동했다. 2009년 BGI는 자이언트 판다의 유전체를 발표했다.

2014년 BGI와 20개국 과학자들은 48종의 조류에 대한 유전체 전반 시퀀싱을 완료하기 위해 협력했다. 2020년 BGI는 조류 가계의 92.4%에 해당하는 363종 유전체의 전체 유전체 시퀀싱 완료에 기여했다.

2022년 BGI는 세계 최초의 아홀로틀 뇌 재생 시공간 지도를 발표하는 연구를 주도했다. 같은 해 BGI, 동북임업대학교 및 기타 기관들이 수행한 연구는 남중국 호랑이의 염색체 수준 유전체를 조사하고 이를 아무르 호랑이와 비교함으로써 남중국 호랑이 근친교배의 유전체적 결과를 밝혀냈다.

2023년 BGI와 과학 컨소시엄은 공동으로 영장류 뇌 세포 지도를 발표했다.

 법적 분쟁 
2019년 경쟁사인 일루미나(Illumina, Inc.)는 BGI를 상대로 다수의 특허 침해 소송을 제기했다. 이에 대응하여 BGI는 일루미나가 연방 독점 금지법 및 캘리포니아 부정경쟁법을 위반했다고 주장하며 맞소송을 제기했다. 2022년 5월, 미국 법원은 일루미나의 DNA 시퀀싱 시스템이 BGI의 특허 2건을 침해했다는 판결을 내리고 일루미나가 BGI 그룹에 3억 3,380만 달러를 지급하도록 명령했다. 판결문에 따르면 일루미나는 특허를 고의로 침해했으며, 일루미나가 BGI 자회사인 Complete Genomics를 상대로 침해를 주장한 3건의 특허는 무효라고 명시되었다. 2022년 7월, 일루미나와 MGI Tech, Complete Genomics는 DNA 시퀀싱 기술에 대한 미국 내 소송을 종결하기로 합의했으며, 일루미나는 모든 미국 내 소송을 해결하기 위해 3억 2,500만 달러를 지급하기로 합의했다. 합의의 일환으로 일루미나는 BGI 계열사의 특허에 대한 라이선스를 받게 되며, 양사는 향후 3년 동안 미국 내에서 특허나 독점 금지 위반으로 서로를 고소하지 않기로 합의했다.

2024년 9월 미국 하원 중국전략경쟁특별위원회 증언에서, 학자 안나 B. 퍼글리시(Anna B. Puglisi)는 조지타운 대학교의 Center for Security and Emerging Technology 재직 당시 작성한 보고서와 관련하여 BGI 그룹으로부터 법적 위협을 받았다고 밝혔다.

 중국 인민해방군과의 협력 

2021년 1월 로이터는 BGI가 중국 인민해방군(PLA) 및 중국인민해방군국방과기대학과 같은 제휴 기관과 협력하여 군인의 근력 강화 및 기타 프로젝트를 수행했다고 보도했다. 2021년 7월 로이터는 BGI가 중국 인민해방군의 도움을 받아 산전 검사를 개발했으며, 이 검사가 유전 데이터 수집에도 사용되었다고 보도했다. 사우스 차이나 모닝 포스트와의 인터뷰에서 BGI 대표는 로이터 보도 내용을 부인했다. 사우스 차이나 모닝 포스트는 BGI가 중국인민해방군 총병원 및 육군군의대학과 논문을 발표했다는 점을 언급하며, 중국에서는 "많은 일류 병원들이 군에 소속되어 있다"라고 설명했다. BGI는 또한 "해외에서 수집된 모든 NIPT 데이터는 일반 데이터 보호 규칙(GDPR)에 규정된 대로 홍콩에 있는 BGI 실험실에 보관되며 5년 후 폐기된다"라고 밝혔다. BGI는 이어서 "BGI는 국가 안보나 국방 목적으로 NIFTY 테스트 데이터를 중국 당국에 제공하도록 요청받은 적이 없으며 제공한 적도 없다"라고 언급했다.

로이터 보도에 대응하여 독일의 한 개인정보 보호 규제 당국은 독일 회사가 BGI의 산전 유전자 테스트를 사용하는 것에 대한 조사에 착수했다. 2021년 8월, 영국은 BGI의 산전 검사에 대해 의약품 및 보건의료제품 규제청(MHRA) 등록 요건을 발표했다. 호주, 에스토니아, 캐나다, 폴란드의 규제 당국과 미국의 국가방첩안보센터(NCSC)도 우려를 표명했다.

2021년 11월 로이터는 BGI에 고용된 코펜하겐 대학교의 장궈지에(Guojie Zhang) 교수가 군인의 고산병 관리를 돕기 위해 PLA를 위한 약물을 개발하고 있다고 보도했다. BGI는 이 연구가 "군사적 목적으로 수행되지 않았다"라고 밝혔다. 2021년 12월 1일, 코펜하겐 대학교는 로이터 보도에 대해 논평했다.

2022년 10월, 미국 국방부는 상장 자회사인 BGI Genomics Co를 미국 내에서 활동하는 "중국 군사 기업" 목록에 추가했다.

 같이 보기 
 중국 국가 인간 유전체 센터
 웰컴 트러스트 생어 연구소
 브로드 연구소

 각주 

 외부 링크 


분류:유전학 연구소
분류:중화인민공화국의 연구소
분류:DNA 시퀀싱
분류:중국의 브랜드
분류:선전시의 기업
분류:유전체학 기업
분류:중국의 군수산업체