B3 DNA結合ドメイン

B3 DNA結合ドメイン（B3 DNA binding domain）あるいはB3ドメイン（B3 domain）とは、DNA結合ドメインの一つである。転写因子のみに見られ、現在までに40種以上の転写因子（    ）にて発見されている。それら全ての遺伝子において、B3ドメインは他のドメイン（AP2 DNA結合ドメインなど）と共に高度に保存されている(InterPro: IPR003340)。 

B3ドメインは100-120アミノ酸残基で構成され、7つのベータストランドと2つのアルファヘリックスを含み、DNA結合性偽バレル構造をフォールディングにより形成する（SCOP 117343）。この立体構造はDNAの主溝と相互作用することで、B3ドメインがDNAと結合することを可能にする。 

 B3ファミリー 
シロイヌナズナにおいて、B3ドメインを含む転写因子には3つの主要なファミリーがある：  

 ARF（ Auxin Response Factor） 
 ABI3（ ABscisic acid Insensitive 3 ） 
 RAV（Related to ABI3/VP1） 

 タンパク質  ARF1- B3  ABI3- B3  RAV1- B3  立体構造の解析方法  分子モデル   分子モデル   NMR   認識配列  TGTCTC    CATGCA    CACCTG  
 及び については、溶液NMRでの構造解析結果のみ判明している。

 関連タンパク質 
エンド型制限酵素EcoRIIのN末端ドメイン。また、エンド型制限エンドヌクレアーゼ BfiIのC末端ドメインは、同様のDNA結合性擬似バレル構造を有している 。 

 脚注 

 外部リンク 

 転写因子のDNA結合ドメインのデータベース  Uses a curated set of DNA-binding domains to predict transcription factors in all completely sequenced genomes. 
 Transfacデータベースによる転写因子分類表。 
 シロイヌナズナ転写因子のデータベース 
 PlantTFDB：植物転写因子データベースにおけるB3、RAV、およびARFファミリーのページ 
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