Community Cyberinfrastructure for Advanced Microbial Ecology Research and Analysis

Community Cyberinfrastructure for Advanced Microbial Ecology Research and Analysis（略称：CAMERA）とはメタゲノミクスデータ解析のためにホストされたソフトウェアツールとハイパフォーマンスコンピューティング基盤を提供するオンラインクラウドコンピューティングサービスであるPubMed Central: "CAMERA: A Community Resource for Metagenomics"DOE Microbial Genomics: Microbial Genome Databases。このプロジェクトは2006年1月にのフラッグシッププロジェクトとして発表されたGordon and Betty Moore Foundation: Leading Department of Energy Genome Scientist to Direct Joint Marine Microbial Metagenomics Cyberinfrastructure Initiative (press release)。

役割
このプロジェクトはクラスタコンピューティングや動作させるためのハイパフォーマンスコンピューティング基盤を提供することにより最適化されたカスタムバイオインフォマティクスツールセットを開発している一般の研究コミュニティの独立メンバーが生成した蓄積されているメタゲノムデータの大規模リポジトリでゲノム研究を加速させるのが目的であるCAMERA: What is CAMERA?CAMERA: Reference Datasets。

CAMERAはまた科学者がのグローバル・オーシャン・サンプリング・エクスペディションにあるデータにアクセスし仕事に使うことを支援しているAnchorage Daily News: Scientist stalks wily microbes from sailboat。2007年、GOSのデータセットがこれまで最大規模のパブリックドメインとして公開されたScience Daily: Millions Of New Genes, Thousands Of New Protein Families Found In Ocean Sampling Expedition (press release)。また、公式サイトに他の多くのデータセットがダウンロードできるCAMERA: Full Datasets。

ゴードン・アンド・ベティ・ムーア財団がこのプロジェクトに2006年1月から7年で2450万ドルの研究助成金を出資しているCAMERA: What is CAMERA?。

歴史

設立時、CAMERAの役割は海洋微生物のゲノム研究に主眼を置いていた。後に役割を拡大し地球生態学を含めることにし、当初のプロジェクト名だった「Community Cyberinfrastructure for Advanced Marine Microbial Ecology Research and Analysis」から海洋を意味する「Marine」を省いた。

人物
CAMERAの首脳陣は以下の通り:About CAMERA: People
主任研究員  (UCSD)
常務取締役 ポール・ギルナ (UCSD)

関連項目
バイオインフォマティクス
メタゲノミクス
微生物生態学

脚注

外部リンク

 UCSD: UCSD Partners with Venter Institute to Build Community Cyberinfrastructure for Advanced Marine Microbial Ecology Research and Analysis

Category:生物学データベース
Category:バイオインフォマティクス
Category:生態微生物学
Category:ゲノムプロジェクト
Category:長大な項目名