Open Babel

Open Babelは 自由ソフトウェアであり、主にを変換するために用いられる化学ツールである 。情報学との関連が強いため、このプログラムはというよりはケモインフォマティクスに属するものといえる。Windows、UNIX、Linux、macOS、Androidで利用可能で、GNU GPL 2.0ライセンスのもとで配布されている。

このプロジェクトでは、「Open Babelが、クロスプラットフォームなプログラムとして、ユーザーと開発者をともに支援するコミュニティ指向の科学的プロジェクトとなり、ファイル形式とデータの内部変換を含む、化学、その他の多くの関連分野を支援するように設計されたライブラリとなる」ことを目標と掲げている。

 歴史 
Open Babelとは ケモインフォマティクスライブラリから派生した。同様には、元の化学プログラム Babel と"OBabel"と呼ばれる非公開のオブジェクト指向ライブラリにあったアイディアを基本にしていた。

 主な機能 
 110種以上のをサポート
 相互変換
 分子探索
 キラリティの検出
 分子の重ね合わせ
 R・C++・C#・Java・Perl・Python・Ruby・Scalaインターフェイス
 SMARTS記法を用いた部分構造フィルタリング
 分子動力学法による構造最適化
 水素原子の付加・削除
 フィンガープリント計算

脚注

 参考文献 
 The Blue Obelisk-Interoperability in Chemical Informatics, Rajarshi Guha, Michael T. Howard, Geoffrey R. Hutchison, Peter Murray-Rust, Henry Rzepa, Christoph Steinbeck, Jörg K. Wegner, and Egon L. Willighagen, J. Chem. Inf. Model.; 2006; 

 関連項目 

 化学データベース
  - Openbabelに基づいた分子力学プログラム
  - OpenBabel/のJava版
 XDrawChem  - OpenBabelに基づいた2D 描画プログラム



 外部リンク 
 OpenBabelホームページ 
 blueobelisk.org
 E-BABEL 対話式のOpenBabel - Virtual Computational Chemistry Laboratory
 Online Molecule Format Converter
 Geoff Hutchison(プロジェクトの先導的開発者)のポッドキャストでのインタビュー chemCast Episode 003
 Design flaws in OELib

Category:化学データベース
Category:計算化学ソフトウェア
Category:ケモインフォマティクス
Category:化学に関する自由ソフトウェア
Category:C++でプログラムされた自由ソフトウェア