Handknattleiksárið 1999-00

Handknattleiksárið 1999-00 var keppnistímabilið í íslenskum handknattleik sem hófst haustið 1999 og lauk vorið 2000. Haukar urðu Íslandsmeistarar í karlaflokki og ÍBV í kvennaflokki.
 Karlaflokkur 
Nissandeild karla
Haukar urðu Íslandsmeistarar í meistaraflokki karla eftir 57 ára bið. Keppt var í tólf liða deild, þar sem fjögur félög urðu jöfn að stigum. Átta lið fóru í úrslitakeppni með útsláttarfyrirkomulagi, en Víkingur og Fylkir féllu niður um deild.

 Félag Stig 33 28 28 26 26 24 23 21 20 18 15 2
 Úrslitakeppni 1. deildar 
8-liða úrslit
 Afturelding - HK 19:12
 HK - Afturelding 24:22
 Afturelding - HK 18:16
  sigraði í einvíginu, 2:1
 KA - FH 27:20
 FH - KA 34:33 (e.bráðabana)
 KA - FH 26:20
  sigraði í einvíginu, 2:1
 Fram - Stjarnan 22:21 (e.framl.)
 Stjarnan - Fram 22:20
 Fram - Stjarnan 21:20
  sigraði í einvíginu, 2:1
 Haukar - ÍBV 27:21
 ÍBV - Haukar 36:37 (e.framl.)
  sigruðu í einvíginu, 2:1
Undanúrslit
 Afturelding - Haukar 25:31
 Haukar - Afturelding 23:24
 Afturelding - Haukar 25:26
  sigruðu í einvíginu, 2:1
 KA - Fram 26:21
 Fram - KA 29:27 (e.framl.)
 KA - Fram 22:24
  sigraði í einvíginu, 2:1
Úrslit
 Fram - Haukar 30:20
 Haukar - Fram 28:21
 Fram - Haukar 22:27
 Haukar - Fram 24:23
  sigruðu í einvíginu, 3:1

 1.  deild 
Grótta/KR sigraði í 1. deild og fór upp í Nissandeild ásamt Breiðabliki. Keppt var í átta liða deild með þrefaldri umferð.

 Félag Stig  / 39  31  28  22  22  b-lið 14  b-lið 12  0

 Bikarkeppni HSÍ 
Fram sigraði í bikarkeppninni  í fyrsta sinn eftir úrslitaleik gegn Stjörnunni.

8-liða úrslit
 Grótta / KR - Víkingur 31:32 (e. framlengingu)
 Stjarnan - Afturelding 22:21
 Fram - Valur 23:20
 HK - ÍR 29:26

Undanúrslit
 Fram - HK 29:20
 Stjarnan - Víkingur 24:22

Úrslit
 Fram - Stjarnan 27:23
 Evrópukeppni 
Ekkert íslenskt félag tók þátt í Evrópukeppni í karlaflokki þetta ár

 Kvennaflokkur 
 1.  deild 
Eyjastúlkur urðu Íslandsmeistarar í meistaraflokki kvenna í fyrsta sinn. Keppt var í einni ellefu liða deild með tvöfaldri umferð. Átta efstu liðin fóru í úrslitakeppni með útsláttarfyrirkomulagi.

 Félag Stig 31 27 27 /25 24 24 22 21 12 7 0

 Úrslitakeppni 1. deildar 
8-liða úrslit
 Haukar - Víkingur 27:24 (e.framl.)
 Víkingur - Haukar 17:20
  sigruðu í einvíginu, 2:0
 FH - Valur 26:25
 Valur - FH 20:24
 FH - Valur 21:16
  sigraði í einvíginu, 2:1
 ÍBV - Fram 25:24
 Fram - ÍBV 25:29
  sigraði í einvíginu, 2:0

 Grótta/KR - Stjarnan 21:26
 Stjarnan - Grótta/KR 19:20
 Grótta/KR - Stjarnan 19:18 (e.framl.)
 / sigraði í einvíginu, 2:1

Undanúrslit
 Víkingur - Grótta/KR 23:25 (e.framl.)
 Grótta/KR - Víkingur 23:13
 / sigraði í einvíginu, 2:0
 FH - ÍBV 23:24
 ÍBV - FH 22:23 (e.framl.)
 FH - ÍBV 20:24
  sigraði í einvíginu, 2:1
Úrslit
 ÍBV - Grótta/KR 30:25
 Grótta/KR - ÍBV 25:27 (e.framl.)
 ÍBV - Grótta/KR 19:17
  sigraði í einvíginu, 3:0

 Bikarkeppni HSÍ 
Valur sigraði í bikarkeppninni eftir úrslitaleik gegn Gróttu/KR.

8-liða úrslit
 Fram - Valur 20:19
 Stjarnan Haukar 23:22 (e. tvöfalda framlengingu)
 Grótta/KR - FH 35:28
 Afturelding - ÍR 21:22 (e. framlengingu)

Undanúrslit
 Grótta/KR - ÍR 23:17
 Valur - Stjarnan 27:21

Úrslit
 Valur - Grótta / KR 27:23 (e. tvöfalda framlengingu)
 Evrópukeppni 
Ekkert íslenskt félag tók þátt í Evrópukeppni í kvennaflokki þetta ár
Flokkur:Handknattleikur á Íslandi