Untai pengkode

Ketika mengacu pada transkripsi DNA, untai pengkode (atau untai informasional) adalah untai DNA yang urutan basanya identik dengan urutan basa transkrip RNA yang dihasilkan (meskipun dengan timina digantikan oleh urasil). Untai inilah yang mengandung kodon, sedangkan untai non-pengkode mengandung antikodon. Selama transkripsi, RNA polimerase II berikatan dengan untai cetakan non-pengkode, membaca antikodon, dan mentranskripsi urutannya untuk mensintesis transkrip RNA dengan basa komplementer.

Menurut konvensi, untai pengkode adalah untai yang digunakan saat menampilkan urutan DNA. Untai ini disajikan dalam arah 5' ke 3'.

Di mana pun gen berada pada molekul DNA, satu untai adalah untai pengkode (atau untai sense), dan yang lainnya adalah untai non-pengkode (juga disebut untai antisense, untai antikode, untai templat, atau untai transkripsi).

Untaian dalam gelembung transkripsi
Selama transkripsi, RNA polimerase membuka gulungan bagian pendek dari heliks ganda DNA di dekat awal gen (situs awal transkripsi). Bagian yang tidak tergulung ini dikenal sebagai gelembung transkripsi. RNA polimerase, dan dengannya gelembung transkripsi, bergerak sepanjang untai nonpengkode dalam arah yang berlawanan, 3' ke 5', serta mempolimerisasi untai yang baru disintesis dalam arah 5' ke 3' atau hilir. Heliks ganda DNA digulung ulang oleh RNA polimerase di bagian belakang gelembung transkripsi. Seperti cara kerja dua ritsleting yang berdekatan, ketika ditarik bersama-sama, mereka membuka dan menutup lagi saat mereka bergerak ke arah tertentu. Berbagai faktor dapat menyebabkan DNA untai ganda putus; dengan demikian, menyusun ulang gen atau menyebabkan kematian sel.

Hibrida RNA-DNA
Ketika heliks terlepas, untai pengkode terdiri dari basa-basa tak berpasangan, sementara untai cetakan terdiri dari komposit RNA:DNA, diikuti oleh sejumlah basa tak berpasangan di bagian belakang. Hibrida ini terdiri dari nukleotida-nukleotida transkrip RNA yang paling baru ditambahkan, yang berpasangan basa komplementer dengan untai cetakan. Jumlah pasangan basa dalam hibrida ini masih dalam penyelidikan, tetapi telah disarankan bahwa hibrida tersebut terbentuk dari 10 nukleotida terakhir yang ditambahkan.

Referensi

Bacaan lanjutan

Kategori:Biologi molekuler
Kategori:DNA