Pangkalan data Klasifikasi Struktural Protein

Pangkalan Data Klasifikasi Struktural Protein (bahasa Inggris: Structural Classification of Proteins/ SCOP) adalah pangkalan data klasifikasi struktural protein berdasarkan data yang terdapat dalam Bank Data Protein. Dalam basis data ini, protein dikelompokkan berdasarkan hubungan struktural dan evolusioner. Protein dengan bentuk yang sama tetapi memiliki sedikit kesamaan urutan atau fungsi ditempatkan dalam superfamili yang berbeda, dan diasumsikan hanya memiliki nenek moyang bersama yang sangat jauh. Protein yang memiliki bentuk yang sama dan beberapa kesamaan urutan dan/atau fungsi ditempatkan dalam "famili", dan diasumsikan memiliki nenek moyang bersama yang lebih dekat. 

SCOP di Pusat Rekayasa Protein dan Laboratorium Biologi Molekuler di Cambridge, Inggris. Dari 1994 hingga 2010, pangkalan data ini oleh Alexey G. Murzin dan rekan-rekannya di Pusat Rekayasa Protein. Setelah tahun 2010, mereka mengembangkan pangkalan data ini di Laboratorium Biologi Molekuler. Namun SCOP 1.75 telah dihentikan pada tahun 2014, sehingga tim SCOPe dari Universtas California, Berkeley bertanggung jawab untuk memperbarui basis data dengan cara yang kompatibel, dengan kombinasi metode otomatis dan manual. Rilis terbaru pada April 2019 adalah SCOPe 2.07 (Maret 2018).

Saat ini, terdapat SCOP2 yang merupakan perbaharuan dari SCOP dalam kategori pengelompokan protein serta penampilan hubungan evolusioner antar protein. Pembaruan terbaru yang dilakukan pada tahun 2020 ini menampilkan skema basis data yang disempurnakan, API baru, dan antarmuka web yang dimodernisasi, sehingga merupakan pembaruan paling signifikan yang dilakukan oleh tim Cambridge sejak SCOP 1.75 dan dibangun di atas kemajuan skema dari prototipe SCOP 2.

 Referensi 

Kategori:Bioinformatika
Kategori:Struktur protein
Kategori:Klasifikasi protein
Kategori:Dewan Riset Medis, Britania Raya