Sekretom

Sekretom adalah kumpulan protein yang diekspresikan oleh suatu organisme dan disekresikan ke dalam ruang ekstraseluler. Pada manusia, subset proteom ini mencakup 13-20% dari semua protein termasuk sitokin, faktor pertumbuhan, protein dan regulator matriks ekstraseluler, serta reseptor pelepasan. Sekretom jaringan tertentu dapat diukur dengan spektrometri massa dan analisisnya merupakan jenis proteomika yang dikenal sebagai sekretomika.

Definisi
Istilah "sekretom" diciptakan oleh Tjalsma dan koleganya pada tahun 2004 untuk menunjukkan semua faktor yang disekresikan oleh sel, bersama dengan konstituen jalur sekresi. Pada tahun 2010, definisi sekretom ini direvisi untuk hanya mencakup protein yang disekresikan ke dalam ruang ekstraseluler. Konsep terkait mencakup matrisom, yang merupakan bagian dari sekretom yang mencakup protein matriks ekstraseluler dan protein terkaitnya; reseptom, yang mencakup semua reseptor membran, dan adhesom, yang mencakup semua protein yang terlibat dalam adhesi sel.

Kuantifikasi
Protein yang disekresikan pada manusia mencakup 13–20% dari seluruh proteom dan mencakup faktor pertumbuhan, kemokin, sitokin, molekul adhesi, protease, dan reseptor pelepasan. Gen pengkode protein manusia (39%, 19613 gen) diprediksi memiliki peptida sinyal dan/atau setidaknya satu daerah transmembran yang menunjukkan transpor aktif protein yang sesuai keluar dari sel (sekresi) atau lokasi di salah satu dari banyak sistem membran dalam sel. Bukti yang semakin meningkat menunjukkan bahwa selain muatan protein; komponen non-protein seperti lipid, mikro-RNA, dan RNA duta, juga dapat disekresikan oleh sel melalui mikrovesikel (diameter 100–>1000 nm), yang dilepaskan dari membran plasma dan eksosom (diameter 30–150 nm), yang dilepaskan melalui peristiwa eksositosis endosomal. Faktor-faktor yang ada di kedua organel ini mencakup hingga 42% dari sekretom dan telah dimasukkan sebagai sekretom kolektif. Ada beragam metodologi yang tersedia untuk mempelajari sekretom sel tumbuhan, sel manusia dan sel mamalia, sel punca, serta sel kanker.

Referensi

 Bacaan lanjutan 

Secretome in Omics.org's alphabetically listed omes and omics



Kategori:Proteomika
Kategori:Sekresi