Alteromonas Macleodii

Alteromonas macleodii (A. macleodii) adalah bakteri laut Gram-negatif, aerobik, yang termasuk dalam kelas Gammaproteobacteria dan famili Alteromonadaceae, yang dapat ditemukan di berbagai habitat laut.  

 Fisiologi 
A. macleodii merupakan bakteri berbentuk batang, panjang rata-rata 1–2 μm, motil dengan satu flagel, dan bersifat heterotrofik. Bakteri ini dapat hidup bebas di air atau menempel pada permukaan, termasuk berasosiasi dengan organisme lain. Penyebarannya luas, dari perairan tropis hingga beriklim sedang, dari zona pesisir hingga pelagis, dan dari zona fotik hingga laut dalam. Memiliki Variasi genomik dan fleksibilitas metabolik memungkinkan pertumbuhan pada beragam substrat, sementara beberapa strain dapat bertahan pada kondisi lingkungan yang menantang, seperti kadar logam berat tinggi, salinitas tinggi, dan oksigen rendah.

 Genom 
Hingga November 2022, sebanyak 52 genom A. macleodii tersedia secara publik, termasuk 23 dari kultur murni dan sisanya dari rakitan metagenom. Empat belas genom lengkap memberikan wawasan penting tentang susunan dan evolusi pangenomnya. Genom A. macleodii relatif besar (rata-rata 4,5 Mb) dengan sekitar 3.000 gen inti dan kumpulan gen aksesori serta gen unik yang luas. Gen-gen fleksibel tersebar di pulau genom yang dapat berfungsi sebagai pengganti dalam hal ini yaitu mengkodekan gen dengan fungsi serupa antar strain atau aditif yang mana menyediakan beragam gen spesifik strain. Pulau genomik ini dapat menentukan fenotipe individu atau subkelompok filogenetik, misalnya dengan mengkodekan enzim pengurai karbohidrat, metabolit sekunder, atau lipopolisakarida membran. Beberapa strain juga mengandung plasmid berukuran 30–800 kb, banyak di antaranya membawa kaset resistensi logam yang beragam.

 Filogeni 
Strain A. macleodii memiliki kesamaan >99,5% pada urutan gen rRNA dan identitas nukleotida rata-rata 90–98%, menunjukkan hubungan erat antar strain meskipun diisolasi dari lokasi global yang berbeda. Beberapa strain hampir identik secara genomik, dengan kurang dari 10 polimorfisme. Studi awal membedakan strain menjadi ekotipe permukaan dan ekotipe dalam, yang kemudian diklasifikasikan ulang sebagai Alteromonas mediterranea.

 Peran Ekologis 
A. macleodii berperan penting dalam siklus bahan organik di laut, baik di perairan dalam maupun pesisir, karena kemampuan degradasinya terhadap beragam substrat mudah berubah. Analisis pangenom menunjukkan bahwa fleksibilitas metabolik ini terkait dengan pulau genom yang memediasi adaptasi ekologi dan evolusi. Fenotipe ini meliputi produksi siderofor, degradasi polisakarida alga, dan komunikasi sel. Selain itu, A. macleodii dapat memengaruhi pertumbuhan mikroba lain, seperti Prochlorococcus, dengan memberikan efek stimulasi atau kompetitif tergantung kondisi lingkungan, termasuk stres oksidatif, sehingga memiliki implikasi ekologis yang signifikan.

 Referensi 

Kategori:Bakteri
Kategori:Bakteri Gram-negatif
Kategori:Bakteri heterotrofik
Kategori:Alteromonas