Serin protease

Serin protease (atau serin endopeptidase) kelompok enzim-enzim yang membelah ikatan peptida pada protein. Serin berperan sebagai asam amino nukleofilik. Serin protease ditemukan dalam jumlah yang cukup baik pada organisme eukariota maupun prokariota. Serin protease terdiri atas dua kategori besar berdasarkan strukturnya yaitu struktur seperti kimotripsin (seperti tripsin) atau seperti subtilisin

 Klasifikasi 

Sistem klasifikasi protease MEROPS memiliki 16 superfamili (tahun 2013) yang tiap superfamili terdiri dari banyak famili. Setiap superfamili menggunakan dyad dalam ikatan protein yang berbeda sehingga menyebabkan evolusi konvergen mekanisme katalitik.

Untuk superfamili P terdiri dari gabungan kelas famili nukleofil campuran. Superfamili S adalah serin protease murni.

+Famili serin proteaseProtein superfamiliFamiliContohSBS8, S53Subtilisin (Bacillus licheniformis)SCS9, S10, S15, S28, S33, S37Prolil oligopeptidase (Sus scrofa)SES11, S12, S13D-Ala-D-Ala peptidase C (Escherichia coli)SFS24, S26Signal peptidase I (Escherichia coli)SHS21, S73, S77, S78, S80Sitomegalovirus (herpesvirus 5)SJS16, S50, S69Lon-A peptidase (Escherichia coli)SKS14, S41, S49Clp protease (Escherichia coli)SOS74K1F endosialidase CIMCD (Enterobacteria phage K1F)SPS59Nucleoporin 145 (Homo sapiens)SRS60Lactoferin (Homo sapiens)SSS66Murein tetrapeptidase LD-karboksipeptidase (Pseudomonas aeruginosa)STS54Rhomboid-1 (Drosophila melanogaster)PAS1, S3, S6, S7, S29, S30, S31, S32, S39, S46, S55, S64, S65, S75Kimotripsin A (Bos taurus)PBS45, S63Penicillin G asilase precursor (Escherichia coli)PCS51Dipeptidase E (Escherichia coli)PEP1DmpA aminopeptidase (Ochrobactrum anthropi)  S48, S62, S68, S71, S72, S79, S81

 Referensi 

Kategori:Enzim