Varian Gamma SARS-CoV-2

Varian Gamma SARS-CoV-2, juga dikenal sebagai garis keturunan P.1, 20J/501Y.V3, atau VOC-202101/02, adalah varian dari SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan Covid-19. Varian ini termasuk varian yang dianggap penting.

Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) melabeli varian ini sebagai varian Gamma bukan untuk menggantikan nama ilmiah, melainkan sebagai nama yang dipakai secara umum di ruang publik. WHO menganggapnya sebagai varian yang diwaspadai (variant of concern).

 Penemuan 
Varian ini pertama kali ditemukan oleh Institut Penyakit Menular Nasional (NIID) Jepang pada 6 Januari 2021 dalam empat orang yang tiba di Tokyo yang telah berkunjung ke Amazonas, Brazil, empat hari yang lalu. Varian ini kemudian dinyatakan merebak di Brazil. Yayasan Oswaldo Cruz yang dijalankan negara Brasil mengonfirmasikan keyakinannya bahwa varian tersebut telah menyebar di hutan hujan Amazon dan telah beredar di sana sejak Juli 2020.

 Sifat 
 Transmisi 

Pusat Penemuan, Diagnosis, Genomik, dan Epidemiologi Arbovirus (CADDE) mengeluarkan artikel jurnal tentang sampel yang dikumpulkan dari Manaus antara November 2020 dan Januari 2021. Penelitian ini menunjukkan bahwa varian ini (P.1) sekitar 2,0 kali lipat (1,7–2,4 kali lipat) lebih menular dan terbukti mampu menghindari sekitar 32 persen (21–46 persen) kekebalan dari infeksi koronavirus sebelumnya sehingga memungkinkan terjadi reinfeksi. Peningkatan juga tampak pada tingkat kematiannya. Varian ini sekitar 50 persen (20–90 persen) lebih mematikan.

 Mutasi 

+ (hanya yang mengubah asam amino) Gen Nukleotida Asam amino ORF1a   S1188L   K1795Q   S3675hapus   G3676hapus   F3677hapus ORF1b   P314L   E1264D Bulir   L18F   T20N   P26S   D138Y   R190S   K417T   E484K   N501Y   D614G   H655Y   T1027I   V1176F ORF3a   S253P ORF8   E92K N   P80R   R203K   G204R Sumber: Faria dkk. (2021), CoVariants Catatan: N501Y berarti perubahan dari asparagina (N) menjadi tirosina (Y) pada posisi asam amino 501.Untuk daftar simbol asam amino α yang dipakai dalam protein sesuai arahan RNA duta, lihat ini: 

Mutasi pada SARS-CoV-2 cukup sering: lebih dari empat ribu mutasi telah dideteksi hanya pada bulir proteinnya menurut Konsorsium Britania Raya untuk Genom COVID-19.

Varian ini terdiri dari 35 mutasi: 21 mutasi tak bersinonim, 3 mutasi hapus, 1 mutasi sisipan, dan 10 mutasi bersinonim, yaitu 25 mutasi yang mengubah protein dan 10 mutasi yang tidak berdampak.

 Efikasi vaksin 
Seiring keberjalanan penelitian, kemampuan varian ini dalam menetralkan antibodi telah dievaluasi oleh ilmuwan dalam karya pracetak yang menunjukkan bahwa delapan orang yang telah diimunisasi oleh CoronaVac memiliki plasma darah yang kurang tanggap terhadap varian ini (P.1). Karena penelitian ini hanya memiliki partisipan sedikit, tidak dimungkinkan pembuatan kesimpulan statistik karena butuh lebih banyak partisipan. Para ilmuwan dari MIT, Harvard, dan Cambridge serta paramedis rumah sakit di Boston membenarkan bahwa orang-orang yang telah divaksinasi dengan Pfizer–BioNTech atau Moderna mengalami penurunan neutralisasi secara signifikan terhadap P.1.

 Statistik 

 Kasus per negara (diperbarui 26 Juli 2021) GISAID NegaraKasus terkonfirmasiKasus terakhir yang dilaporkanAmerika Serikat21.14429 Juni 2021Brasil12.45613 Juni 2021Kanada8.481Belgia1,5181 Juli 2021Meksiko1.28524 Juni 2021Chili2.14913 Juni 2021Spanyol78626 Juni 2021Italia55129 Juni 2021Belanda51817 Juni 2021Kolombia3161 Juni 2021Jerman31222 Juni 2021Prancis28923 Juni 2021Trinidad dan Tobago25015 Juni 2021Argentina23612 Mei 2021Guyana Prancis22511 Juni 2021Inggris Raya20023 Juni 2021Portugal17623 Juni 2021Uruguay17115 April 2021Swiss16221 Juni 2021Aruba11620 Juni 2021Jepang10813 Juni 2021Suriname10825 Mei 2021Swedia7014 Juni 2021Paraguay534 Mei 2021Denmark4929 Juni 2021Haiti4720 Mei 2021Luksemburg4721 Mei 2021Ekuador3618 Juni 2021Kosta Rika3221 Mei 2021Irlandia2727 Mei 2021Peru2522 Februari 2021Austria2410 Juni 2021Malta2421 Juni 2021Turki2329 Maret 2021Bolivia172 Juni 2021Venezuela1726 Mei 2021Republik Ceko139 Juni 2021Republik Dominika1210 Juni 2021Israel1116 Mei 2021Singapura811 Juni 2021Australia725 April 2021Selandia Baru731 Mei 2021Norwegia715 Juni 2021Polandia719 Juni 2021Kuwait619 Januari 2021Afrika Selatan628 Desember 2020Curacao628 Mei 2021Rumania625 Mei 2021Yordania528 April 2021Slovenia431 Mei 2021Taiwan428 Januari 2021Lituania331 Mei 2021Korea Selatan33 April 2021Cina217 April 2021Kroasia219 April 2021DR Kongo212 Februari 2021Finlandia223 Mei 2021Bangladesh118 Februari 2021Barbados122 Mei 2021Kepulauan Cayman117 Juni 2021Kepulauan Faroe112 Januari 2021Guam130 April 2021Guyana118 Januari 2021Filipina121 Februari 2021Puerto Riko19 Juni 2021Liberia120 Juni 2021Ghana115 April 2021Papua Nugini15-7 April 2021Arab Saudi131 Januari 2021Dunia (69 negara)Jumlah:  '51 557  ' Total per 22 Juli 2021 

 Penyebaran 

 Lihat pula 

 Varian SARS-CoV-2
 Varian Alpha SARS-CoV-2
 Varian Beta SARS-CoV-2
 Varian Delta SARS-CoV-2

 Referensi 

 Pranala luar 

  Laporan COG-UK tentang Mutasi Penting Bulir SARS-CoV-2 di Britania Raya
  Garis keturunan PANGO: Laporan Varian Baru - Laporan persebaran global garis keturunan P.1
  Pangkalan data pengurutan GISAID - Pelacakan varian Covid-19

Kategori:Varian SARS-CoV-2