Varian Beta SARS-CoV-2

Varian Beta SARS-CoV-2, juga dikenal sebagai garis keturunan B.1.351 atau 501.V2, adalah varian dari SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan Covid-19. Varian ini termasuk varian yang dianggap penting. Ia ditemukan pertama kali di Teluk Nelson Mandela, Provinsi Eastern Cape, Afrika Selatan, pada Oktober 2020 dan dilaporkan oleh departemen kesehatan negara tersebut pada 18 Desember 2020. Analisis filogeografi menunjukkan bahwa varian ini telah muncul di daerah Teluk Nelson Mandela sejak Juli atau Agustus 2020.

Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) melabeli varian ini sebagai varian Beta bukan untuk menggantikan nama ilmiah, melainkan sebagai nama yang dipakai secara umum di ruang publik. WHO menganggapnya sebagai varian yang diwaspadai (variant of concern).

 Penemuan 
Tim genomik yang dipimpin oleh KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP) di Universitas KwaZulu-Natal menemukan varian baru ini. Varian ini ditemukan dengan pengurutan keseluruhan genom. Urutan genomik garis keturunan ini dikumpulkan ke pangkalan data urutan GISAID.

 Sifat 
 Gejala 

 Transmisi 
Peneliti dan pihak berwenang melaporkan bahwa prevalensi varian ini lebih tinggi di antara orang muda dengan tanpa keadaan kesehatan tertentu dan sering menyebabkan penyakit serius dalam beberapa kasus dibandingkan varian lain. Departemen Kesehatan Afrika Selatan juga menyatakan bahwa varian ini mungkin menjadi mendorong gelombang kedua pandemi di negaranya karena varian ini menyebar lebih cepat daripada varian lain sebelumnya.

 Genetika 

+ (hanya yang mengubah asam amino) Gen Nukleotida Asam amino ORF1ab C1059T  T265I G5230T  K1655N C8660T  H2799Y C8964T  S2900L A10323G  K3353R G13843T  D4527Y C14408T1  P4715L1 C17999T  T5912I Bulir C21614T  L18F A21801C  D80A A22206G  D215G G22299T  R246I G22813T  K417N G23012A  E484K A23063T  N501Y A23403G1  D614G1 G23664T  A701V ORF3a G25563T  Q57H C25904T  S171L E C26456T  P71L N C28887T  T205I Sumber: Tegally dkk. (2021), Extended Data Fig. 5 Catatan:N501Y berarti perubahan dari asparagina (N) menjadi tirosina (Y) pada posisi asam amino 501.Untuk daftar simbol asam amino α yang dipakai dalam protein sesuai arahan RNA duta, lihat ini: 1Muncul dalam induk garis keturunan B.1.
Mutasi pada SARS-CoV-2 cukup sering: lebih dari empat ribu mutasi telah dideteksi hanya pada bulir proteinnya menurut Konsorsium Britania Raya untuk Genom COVID-19.

Varian ini terdiri dari 31 mutasi: 19 mutasi tak bersinonim, 2 mutasi hapus, dan 10 mutasi bersinonim, yaitu 21 mutasi yang mengubah protein dan 10 mutasi yang tidak berdampak.

Ilmuwan mencatat bahwa varian ini bisa lebih mudah menempel pada sel manusia karena tiga mutasi dalam domain pengikat reseptor (RBD) pada bulir virus, yaitu N501Y, K417N, dan E484K. Dua di antaranya, E484K dan N501Y, ada dalam motif pengikat reseptor (RBM) dari domain pengikat reseptor (RBD). Mutasi N501Y juga ada dalam varian Alpha dan Gamma.

 Efikasi vaksin 
Perubahan asam amino E484K, sebuah mutasi domain pengikat reseptor (RBD), dilaporkan berhubungan dengan kaburnya dari antibodi penetral yang bisa berdampak buruk terhadap efikasi vaksin Covid-19 yang bergantung pada protein bulir. Mutasi bulir E484K dikaitkan dengan kasus reinfeksi dengan varian Beta di Brazil yang diyakini para peneliti sebagai kasus reinfeksi pertama untuk varian ini. Peluang perubahan dalam antigenisitas disebut sebagai "mutasi kabur" dari antibodi monoklonal yang mampu menetralkan protein bulir varian SARS-CoV-2.

 Statistik 

 Kasus menurut negara (Diperbarui per 21 Juli 2021) GISAID Negara Kasus terkonfirmasi Tanggal KoleksiAngola40122 April 2021Argentina 124 April 2021Aruba410 April 2021Australia7328 Juni 2021Austria2608 Juni 2021Bahrain 19 April 2021Bangladesh5616 Juni 2021 Belgia1.07514 Juni 2021Bosnia dan Herzegovina 111 Februari 2021Botswana34227 Juni 2021Brasil65 April 2021Brunei 120 Januari 2021Bulgaria29 Juni 2021Kamboja 131 Mei 2021Kamerun9 1 Maret 2021Kanada86021 Juni 2021Cile422 Mei 2021Cina894 Juni 2021Kolombia 113 April 2021Kosta Rika124 Mei 2021Pantai Gading16 Maret 2021Kroasia41Ceko7110 Juni 2021Republik Demokratik Kongo3020 April 2021Denmark12129 Juni 2021Djibouti229 April 2021Guinea Khatulistiwa431 April 2021Estonia3723 April 2021Eswatini2623 Maret 2021Finlandia1,12321 Mei 2021Prancis2.14923 Juni 2021Guyana Prancis27 April 2021Gabon421 Februari 2021Georgia 123 Mei 2021Jerman2.23119 Juni 2021Ghana178 April 2021Yunani1929 April 2021Guadeloupe425 Mei 2021Guam328 April 2021Guinea Bissau11 Februari 2021India20814 Juni 2021Indonesia102 Juni 2021Iran23 April 2021Irak 126 Februari 2021Irlandia6919 April 2021Israel24028 Mei 2021Italia691 Juni 2021Jepang8913 Juni 2021Yordania218 April 2021Kenya17831 Mei 2021Kuwait 121 Juni 2021Latvia913 Mei 2021Lesotho1418 Januari 2021Lituania119 April 2021Luksemburg74422 Mei 2021Malawi31216 April 2021Malaysia16110 Juni 2021Malta31 Juni 2021Martinik228 April 2021Mauritius712 Maret 2021Mayotte3231 Januari 2021Meksiko2016 Mei 2021Mozambik32822 April 2021Namibia9Belanda69327 Mei 2021Selandia Baru3125 Juni 2021Makedonia Utara110 Maret 2021Norwegia36211 Juni 2021Pakistan355 Juni 2021Panama212 Januari 2021Filipina1,2138 April 2021Polandia457 Juni 2021Portugal992 Juni 2021Qatar65018 Mei 2021Reuni40019 Juni 2021Rumania726 Mei 2021Rusia2312 Juni 2021Rwanda3915 Juni 2021Arab Saudi315 April 2021Singapura10025 Juni 2021Sint Maarten124 Maret 2021Slowakia3127 Mei 2021Slovenia316 April 2021Somalia1Afrika Selatan6.15421 Juni 2021Korea Selatan1917 April 2021Sudan Selatan324 April 2021Spanyol58818 Juni 2021Sri Lanka426 Maret 2021Suriname531 Maret 2021Swedia2,32217 Juni 2021Swiss22522 Juni 2021Taiwan326 April 2021Thailand4025 Mei 2021Togo25 Februari 2021Tunisia 124 April 2021Turki91224 Mei 2021Uganda132 April 2021Uni Emirat Arab627 April 2021Britania Raya81224 Juni 2021AS2.45428 Juni 2021Zambia16128 April 2021Zimbabwe33126 Februari 2021Dunia (103 negara)Jumlah: 28.380Total per 21 Juli 2021

 Penyebaran 

Pada 23 Desember 2020, Menteri Kesehatan Britania Raya, Matt Hancock, mengumumkan bahwa dua orang yang berkunjung dari Afrika Selatan ke Britania Raya terinfeksi dengan varian Beta (varian 501.V2).

Pada 3 Mei 2021, varian ini telah masuk ke Indonesia. 

 Lihat pula 

 Varian SARS-CoV-2
 Varian Alpha SARS-CoV-2
 Varian Gamma SARS-CoV-2
 Varian Delta SARS-CoV-2

 Referensi 

 Pranala luar 

  Laporan COG-UK tentang Mutasi Penting Bulir SARS-CoV-2 di Britania Raya
  Garis keturunan PANGO: Laporan Varian Baru - Laporan persebaran global garis keturunan B.1.351
  Pangkalan data pengurutan GISAID - Pelacakan varian Covid-19

Kategori:Varian SARS-CoV-2