Serpin

Serpin atau Serine Protease Inhibitor adalah sebuah kelompok besar protein yang bekerja sebagai penghambat protease dan merupakan penghambat protease terbesar dan paling banyak ditemui pada makhluk hidup. Gen yang menyerupai serpin telah ditemukan pada binatang, tumbuhan, virus pox dan bakteri. Serpin bekerja dengan cara mengubah bentuk untuk menghambat enzim target.

 Struktur 
Serpin terdiri dari 350-400 asam amino dan memiliki berat molekul 40-50 kDa. Penyusunnya adalah 3 lembaran beta (A, B, C) dan 8-9 heliks alfa (hA-hI).

Sebagai penghambat protease, serpin memiliki struktur lingkaran yang berguna untuk berhubungan dengan celah aktif protease. Berbeda dengan penghambat protease serin lainnya yang memiliki lingkaran pusat reaktif (LPR) yang pendek dan kaku, serpin memiliki LPR yang panjang dan lentur.

 Pembagian 
Serpin dibagi dalam beberapa clade yaitu:
 Clade A (Antitripsin-like)
 Clade B (Ovalbumin-like)
 Clade C (Antitrombin)
 Clade D (Heparin Kofaktor II)
 Clade E (PAI-1/GDN)
 Clade F (PEDF)
 Clade G (Penghambat C1)
 Clade H (Protein peredam panas 47)
 Clade I (Neuroserpin)
 Clade J (Belangkas)
 Clade K (Serangga)
 Clade L (Nematoda)
 Clade M (Schistosoma)
 Clade N (Viral SPI1-2/Crm-A-like)
 Clade O (Viral SPI3-like)
 Clade P (Tumbuhan)

 Persebaran 
Serpin terdapat pada semua makhluk hidup eukariota seperti binatang dan tumbuhan kecuali jamur dan klorofita. Serpin juga dapat ditemukan pada sebagian bakteri dan virus yang menginfeksi makhluk hidup eukariota.

 Virus 
Sejauh ini serpin baru ditemukan pada virus poxviridae. Serpin dari cabang Orthopoxvirus (pox sapi, ectromelia, vaccinia, variola dan pox kelinci) tergabung dalam 2 clade, yaitu clade n, mengandung serpin SPI-1-like dan SPI-2-like, dan clade o, mengandung serpin SPI-3-like.

 Chordata 
Serpin pada eukariota yang lebih tinggi dapat dibagi menjadi 2 kelompok besar, yaitu serpin intraselulkar (serpin-ov) dan serpin ekstraselular. Serpin-ov membentuk clade (b) dan merupakan nenek moyang dari serpin ekstraseluler.

Sedangkan serpin ekstraselular dapat dibagi ke dalam 8 clade, yang paling besar adalah clade a. Serpin dalam kelompok ini terlibat dalam banyak proses, paling umum adalah penghambatan proteinase serin.

 Manusia 
Sampai saat ini serpin yang ditemukan pada manusia berjumlah 34 buah yang berasal dari sembilan clade. Serpin pada manusia berfungsi dalam proses penggumpalan darah, fibrinolisis dan peradangan. Sebanyak 7 serpin pada manusia tidak berfungsi sebagai penghambat proteinase.

{| class="navbox collapsible collapsed" style="border:0; margin-top:0.2em;"
|-
! style="text-align: center"| Serpin pada Manusia
|-
 Nama Gen  Nama Umum  Letak Fungsi SERPINA1  Antitripsin Ekstraselular Menghambat elastase neutrofil SERPINA2 Protein terkait Antitripsin Extracellular Kemungkinan pseudogen SERPINA3 Antikimotripsin Ekstracellular Menghambat katepsin G SERPINA4 Kallistatin (PI4) Extracellular Menghambat kalikrein SERPINA5 Penghambat Protein C (PAI-3) Extracellular Menghambat protein C aktif SERPINA6 Globulin Pengikat Kortikosteroid Extracellular Mengikat kortisol SERPINA7 Globulin Pengikat Tiroksin Extracellular Mengikat tiroksin SERPINA8 Angiotensinogen Extracellular Memotong amino-terminal dengan renin protease mengakibatkan pelepasan angiotensin I SERPINA9 Centerin Extracellular Memelihara sel B naive SERPINA10 Penghambat Proteinase Protein Z-dependen Extracellular Menghambat faktor Z dan XI teraktivasi SERPINA11 XP_170754.3 Extracellular  SERPINA12 Vaspin Extracellular Adipositokin pemeka insulin SERPINA13 XM_370772 Extracellular Menghambat elastase neutrofil SERPINB1 Penghambat Elastase Neutrofil Monosit Intracellular Menghambat uPA SERPINB2 Penghambat Pengaktif Plasminogen 2 (PAI2) Intracellular/extracellular Menghambat katepsin L dan V SERPINB3 Antigen Karsinoma Sel Skuamosa 1 Intracellular Menghambat katepsin G dan kimase SERPINB4 Antigen Karsinoma Sel Skuamosa 2 Intracellular Menghambat metastasis SERPINB5 Maspin  Intracellular Menghambat katepsin G  SERPINB6 Penghambat Proteinase 6 (PI6) Intracellular Pematangan megakariosit SERPINB7 Megsin Intracellular Menghambat furin SERPINB8 Antiproteinase sitoplasmik 8 (PI8) Intracellular Menghambat granzim B SERPINB9 Antiproteinase sitoplasmik 9 (PI9) Intracellular Menghambat trombin dan tripsin SERPINB10 Bomapin (PI10) Intracellular - SERPINB11 Epipin Intracellular Menghambat tripsin SERPINB12 Yukopin Intracellular Menghambat katepsin L dan K SERPINB13 Headpin (PI13) Intracellular Menghambat trombin dan faktor Xa SERPINC1 Antitrombin Extracellular Menghambat trombin SERPIND1 Kofaktor Heparin II Extracellular Menghambat trombin, uPA, tPA dan plasmin SERPINE1 Penghambat Aktivator Plasminogen 1 (PAI1) Extracellular Menghambat uPA dan tPA SERPINE2] Neksin Protease I (PI7) Ekstracellular  SERPINF1 Hs.512272 Extracellular Molekul anti-angiogenik poten SERPINF2 Faktor Turunan Epitelium Pigmen Extracellular Penghambat plasmin SERPING1 Antiplasmin Alfa 2 Extracellular Penghambat esterase C1 SERPINH1 Protein Penyekat Panas 47kDa Intracellular Molekul Kaperon untuk kolagen SERPINI1 Neuroserpin Extracellular Penghambat tPA, uPA dan plasmin SERPINI2 Penghambat Proteinase Serin Turunan Myoepitelium Extracellular Menghambat metastasis kanker

 Sumber 

Kategori:Protein