Pohon kehidupan (biologi)

Pohon kehidupan atau pohon kehidupan universal adalah sebuah kiasan, model dan alat riset yang dipakai untuk menjelaskan evolusi kehidupan dan mendeskripsikan hubungan antar organisme, baik yang masih hidup dan yang telah punah. Model tersebut dipakai dalam On the Origin of Species (1859) karya Charles Darwin.

— Charles DarwinDarwin, Charles (1859). "Four: Natural Selection; or the Survival of the Fittest". On the origin of species by means of natural selection, or, The preservation of favoured races in the struggle for life (First Edition, First Thousand ed.). London: John Murray. Hal 129. Diambil11 August 2018.

Pohon kehidupan berasal dari abad pertengahan untuk menggambarkan silsilah keluarga. Sedangkan pohon filogenetika dalam kerangka evolusi berasal dari pertengahan abad kesembilan belas.

Istilah pohon filogenetika untuk hubungan evolusi spesies sepanjang waktu diciptakan oleh Ernst Haeckel, yang melangkah lebih jauh dari Darwin dalam mengemukakan sejarah filogenik kehidupan. Dalam penggunaannya di saat sekarang, pohon kehidupan mengacu pada kumpulan kompilasi database filogenetika yang komprehensif dan berakar pada leluhur universal terakhir yang hidup di bumi. Open Tree of Life, pertama kali diterbitkan September 2015, adalah proyek untuk mengumpulkan database pohon kehidupan yang dapat diakses publik secara gratis.

 Penggunaan di masa sekarang 
Pada tahun 1990, Carl Woese, Otto Kandler dan Mark Wheelis mengusulkan sebuah "pohon kehidupan" yang terdiri dari tiga garis keturunan dimana mereka memperkenalkan istilah domain sebagai klasifikasi peringkat tertinggi dalam tingkatan taksonomi. Mereka juga menyarankan istilah bakteria, archaea dan eukariota untuk tiga domain berbeda yang sebelumnya archaea dikelompokkan kedalam bakteri.Woese, Carl R.; Kandler, O; Wheelis, M (1990). "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya". Proc Natl Acad Sci USA. 87 (12): 4576–9. 

.

Model pohon masih dianggap valid untuk bentuk kehidupan eukariotik. Pada tahun 2010, penelitian ke cabang paling awal dari pohon eukariota telah menghasilkan pohon lainnya dengan empat Burki, Fabien; Shalchian-Tabrizi, Kamran & Pawlowski, Jan (2008), "Phylogenomics reveals a new 'megagroup' including most photosynthetic eukaryotes", Biology Letters, 4 (4): 366–369, atau dua supergrup.Kim, E.; Graham, L.E.; Redfield, Rosemary Jeanne (2008), Redfield, Rosemary Jeanne (ed.), "EEF2 analysis challenges the monophyly of Archaeplastida and Chromalveolata", PLOS ONE, 3 (7): e2621. Tampaknya belum ada konsensus atau kesepakatan; dalam sebuah artikel ulasan, Roger dan Simpson menyimpulkan bahwa "dengan laju perubahan saat ini dalam pemahaman kita tentang pohon kehidupan eukariota, kita harus melanjutkannya dengan hati-hati."Roger, A.J. & Simpson, A.G.B. (2009), "Evolution: Revisiting the Root of the Eukaryote Tree", Current Biology, 19 (4): R165–7, 

Pada 2015, draf pertama Open Tree of Life diterbitkan, di mana informasi dari hampir 500 pohon kehidupan dari berbagai macam kelompok organisme mencakup 2.3 juta spesies makhluk hidup yang diterbitkan sebelumnya digabungkan ke dalam satu database online, bebas untuk diakses dan diunduh.

Pada tahun 2016, pohon kehidupan baru, yang merangkum evolusi semua bentuk kehidupan yang diketahui, diterbitkan, menggambarkan temuan genetik terbaru bahwa cabang-cabang tersebut sebagian besar terdiri dari bakteri. Studi baru ini menggabungkan lebih dari seribu bakteri dan archaea yang baru ditemukan.Taylor, Ashley P. (11 April 2016). "Branching Out: Researchers create a new tree of life, largely comprised of mystery bacteria". www.the-scientist.com atauThe Scientist. diakses 15 November 2020

 Catatan kaki 

 Referensi 




 Pranala luar 
 Tree of Life Web Project - explore complete phylogenetic tree interactively
 Tree of Life Evolution Links species on Earth through a shared evolutionary history
 Science journal issue - Issue devoted to the tree of life.
 The Tree of Life by Garrett Neske, The Wolfram Demonstrations Project: "presents an interactive tree of life that allows you to explore the relationships between many different kinds of organisms by allowing you to select an organism and visualize the clade to which it belongs."
 The Green Tree of Life - Hyperbolic tree University of California/Jepson Herbaria
 NCBI's taxonomy database common tree

Kategori:Sejarah biologi