Rhizobium

Rhizobium adalah genus bakteri tanah Gram-negatif yang memfiksasi nitrogen. Spesies Rhizobium membentuk asosiasi pengikat nitrogen endosimbiotik dengan akar kacang-kacangan dan Parasponia.

Bakteri ini mengkolonisasi sel-sel tumbuhan di dalam nodul akar, di mana mereka mengubah nitrogen atmosfer menjadi amonia dan kemudian memberikan senyawa nitrogen organik seperti glutamina atau ureida ke tanaman. Tanaman, pada gilirannya, menyediakan senyawa organik yang dibuat dengan fotosintesis untuk bakteri. Hubungan yang saling menguntungkan ini terjadi pada semua rhizobia, di mana genus Rhizobium adalah contoh yang khas.

 Sejarah 
Martinus Beijerinck adalah yang pertama kali mengisolasi dan menumbuhkan mikroorganisme dari nodul kacang-kacangan pada tahun 1888. Ia menamakannya Bacillus radicicola, yang sekarang ditempatkan dalam Bergey's Manual of Determinative Bacteriology di bawah genus Rhizobium.

 Penelitian 
Rhizobium membentuk hubungan simbiosis dengan tanaman tertentu seperti kacang-kacangan, memfiksasi nitrogen dari udara menjadi amonia, yang bertindak sebagai pupuk alami untuk tanaman. Penelitian saat ini sedang dilakukan oleh ahli mikrobiologi dari Agricultural Research Service untuk menemukan cara untuk memanfaatkan fiksasi nitrogen Rhizobium. Penelitian ini melibatkan pemetaan genetik dari berbagai spesies rhizobia dengan spesies tanaman simbiotik masing-masing, seperti alfalfa atau kedelai. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk meningkatkan produktivitas tanaman tanpa menggunakan pupuk.

Dalam biologi molekuler, Rhizobium juga telah diidentifikasi sebagai pencemar dari kit pereaksi ekstraksi DNA dan sistem air ultra murni, sehingga Rhizobium dapat muncul secara keliru di kumpulan data mikrobiota atau metagenom. Kehadiran bakteri pengikat nitrogen sebagai kontaminan mungkin karena penggunaan gas nitrogen dalam produksi air ultra-murni untuk menghambat pertumbuhan mikrob dalam tangki penyimpanan.

 Spesies 

 Rhizobium aegyptiacum Shamseldin et al. 2016
 Rhizobium aggregatum (Hirsch and Müller 1986) Kaur et al. 2011NOTE: This strain was formerly named Blastobacter aggregatus.
 Rhizobium alamii Berge et al. 2009

 Rhizobium altiplani Baraúna et al. 2016
 Rhizobium alvei Sheu et al. 2015
 Rhizobium anhuiense Zhang et al. 2015

 Rhizobium azibense Mnasri et al. 2014
 Rhizobium azooxidifex Behrendt et al. 2016
 Rhizobium bangladeshense Harun-or Rashid et al. 2015
 symbiovar trifolii
 symbiovar viciae
 Rhizobium binae Harun-or Rashid et al. 2015

 Rhizobium calliandrae Rincón-Rosales et al. 2013

 Rhizobium capsici Lin et al. 2015
 Rhizobium cauense Liu et al. 2015
 Rhizobium cellulosilyticum García-Fraile et al. 2007
 Rhizobium daejeonense Quan et al. 2005
 Rhizobium ecuadorense Ribeiro et al. 2015
 Rhizobium endolithicum Parag et al. 2014
 Rhizobium endophyticum López-López et al. 2010
 Rhizobium etli Segovia et al. 1993NOTE: This species was formerly known as R. leguminosarum sv. phaseoli.
 symbiovar mimosae
 symbiovar phaseoli
 Rhizobium fabae Tian et al. 2008
 Rhizobium flavum Gu et al. 2014
 Rhizobium freirei Dall'Agnol et all. 2013

 Rhizobium gallicum Amarger et al. 1997
 symbiovar gallicum
 symbiovar orientaleNOTE: R. gallicum and R. mongolense are 99.2% identical in their rDNA and may be the same species. It has been proposed by Silva et al. that R. mongolense and R. yanglingense be reclassified as R. gallicum sv. orientale.
 symbiovar phaseoli

 Rhizobium grahamii López-López et al. 2011
 Rhizobium hainanense Chen et al. 1997
 Rhizobium halophytocola Bibi et al. 2012
 Rhizobium halotolerans Diange and Lee 2013

 Rhizobium indigoferae Wei et al. 2002
 Rhizobium jaguaris Rincón-Rosales et al. 2013
 Rhizobium kunmingense Shen et al. 2010
 Rhizobium laguerreae Saïdi et al. 2014

 Rhizobium leguminosarum (Frank 1879) Frank 1889
 symbiovar trifolii
 symbiovar viciae
 Rhizobium lemnae Kittiwongwattana & Thawai 2014
 Rhizobium lentis Harun-or Rashid et al. 2015
 Rhizobium leucaenae Ribeiro et al. 2011
 Rhizobium loessense Wei et al. 2003

 Rhizobium lusitanum Valverde et al. 2006
 "Candidatus Rhizobium massiliae" Greub et al. 2004.
 Rhizobium mayense Rincón-Rosales et al. 2013

 Rhizobium mesoamericanum López-López et al. 2011
 Rhizobium mesosinicum Lin et al. 2009
 Rhizobium metallidurans Grison et al. 2015
 Rhizobium miluonense Gu et al. 2008
 Rhizobium mongolense Herr Baronn O. Vonn Berkum et al. 1998
 Rhizobium multihospitium Han et al. 2008
 Rhizobium naphthalenivorans Kaiya et al. 2012

 Rhizobium oryzicola Zhang et al. 2015

 Rhizobium pakistanensis Khalid et al. 2014

 Rhizobium paranaense Dall'Agnol et al. 2014
 Rhizobium petrolearium Zhang et al. 2012
 Rhizobium phaseoli Dangeard 1926 emend. Ramírez-Bahena et al. 2008
 Rhizobium phenanthrenilyticum Wen et al. 2011
 Rhizobium pisi Ramírez-Bahena et al. 2008
 symbiovar trifolii
 symbiovar viciae
 Rhizobium pongamiae Kesari et al. 2013
 Rhizobium populi Rozahon et al. 2014

 Rhizobium qilianshanense Xu et al. 2013

 Rhizobium rhizogenes (Riker et al. 1930) Young et al. 2001
 Rhizobium rhizoryzae Zhang et al. 2014
 Rhizobium rosettiformans Kaur et al. 2011

 Rhizobium selenitireducens corrig. Hunter et al. 2008

 Rhizobium smilacinae Zhang et al. 2014
 Rhizobium soli Yoon et al. 2010
 Rhizobium sophorae Jiao et al. 2014
 Rhizobium sophoriradicis Jiao et al. 2014

 Rhizobium straminoryzae Lin et al. 2014
 Rhizobium subbaraonis Ramana et al. 2013
 Rhizobium sullae Squartini et al. 2002

 Rhizobium tarimense Turdahon et al. 2012
 Rhizobium tibeticum Hou et al. 2009
 Rhizobium tropici Martínez-Romero et al. 1991
 Rhizobium tubonense Zhang et al. 2011

 Rhizobium vallis Wang et all. 2011

 Rhizobium yanglingense Tan et al. 2001
 Rhizobium yantingense Chen et al. 2015

 Filogeni 
Taksonomi yang diterima saat ini berdasarkan List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)  dan National Center for Biotechnology Information (NCBI)
dan filogeninya berdasarkan LTP rilis 106 berbasis 16S rRNA oleh The All-Species Living Tree Project.All-Species Living Tree Project.

 Referensi 

 Pranala luar 

 Current research on Rhizobium leguminosarum at the Norwich Research Park
 Video and commentary on root nodules and Rhizobium in White Clover

Kategori:Biologi
Kategori:Bakteri
Kategori:Rhizobiaceae
Kategori:Pupuk hayati
Kategori:Nitrogen
Kategori:Martinus Beijerinck