Daftar Wali Kota Jayapura

<onlyinclude>Berikut adalah daftar Wali Kota Jayapura secara definitif sejak tahun 1994 di bawah Pemerintah Republik Indonesia.

 Wali Kota administratif 

 Wali kota otonom 
25px Wali Kota Jayapura 25px  Wali Kota PotretPartai Awal Akhir Masa jabatan Periode Wakil  1 R. Roemantyo 90pxNonpartisipan 1994 1999  tahun I(1994) Tidak ada  2  90px Nonpartisipan 2000 2005  tahun II(2000) J.I. Renyaan  2005 2010  tahun III(2005) Sudjarwo  3 Benhur Tomi Mano 90px PDI-P 21 Juli 2011 21 Juli 2016  IV(2010) Nur Alam  22 Mei 2017 22 Mei 2022  V(2017) Rustan Saru  4Abisai Rollo 90pxGolkar 20 Februari 2025 Petahana  VI(2024)

 Pengganti sementara 
Dalam tumpuk pemerintahan, seorang kepala daerah yang mengajukan diri untuk cuti atau berhenti sementara dari jabatannya kepada pemerintah pusat, maka Menteri Dalam Negeri menyiapkan penggantinya yang merupakan birokrat di pemerintah daerah atau bahkan wakil wali kota, termasuk ketika posisi wali kota berada dalam masa transisi.
 Pejabat PotretPartai Awal Akhir Masa jabatan Periode  Wali Kota definitif  R. Roemantyo(Penjabat) 60pxNonpartisipan 1993 1994  tahun – Transisi (1993–1994)  J.P. Nerokouw(Pelaksana harian) 60pxNonpartisipan 24 Agustus 2010 16 September 2010  – Transisi (2010–2011)  Elieser Renmaur(Penjabat) 60pxNon partisipan 16 September 2010 21 Juli 2011  –  Rudolf Dace Siahaya(Pelaksana harian) 60pxNonpartisipan 21 Juli 2016 23 Agustus 2016  – Transisi (2016–2017)  Daniel Pahabol(Penjabat) 60pxNonpartisipan 23 Agustus 2016 22 Mei 2017  –  Frans Pekey(lahir 1967)(Penjabat) 60px Nonpartisipan 22 Mei 2022 27 Mei 2022  – Transisi (2022–2025)  27 Mei 2022 27 Mei 2024   (Penjabat) 60pxNonpartisipan 27 Mei 2024 20 Februari 2025  – 

 Lihat Pula 
 Daftar Wakil Wali Kota Jayapura
 Kota Jayapura

 Referensi 

Kategori:Kota Jayapura

Jayapura