Daftar Presiden Sudan Selatan

. Tanggal yang dicetak miring menunjukkan indikasi kontinuitas pemerintahan de facto, meskipun sifat jabatannya mungkin telah berubah.

Masa jabatanPejabatAfiliasiCatatanPemerintah Sudan bagian Selatan<small>9 Juli 2005 hingga 30 Juli 2005John Garang, <small>Presiden Pemerintah Sudan bagian Selatan<small>SPLA/M<small>Meninggal pada sebuah kecelakaan pesawat pada 30 Juli 2005<small>30 Juli 2005 hingga 9 Juli 2011Salva Kiir Mayardit, <small>Presiden Pemerintah Sudan bagian Selatan<small>SPLA/M<small>Pejabat Sementara Presiden hingga 11 Agustus 2005Republik Sudan Selatan<small>9 Juli 2011 hingga saat iniSalva Kiir Mayardit, <small>Presiden Sudan Selatan<small>SPLA/M

Catatan: Presiden Pemerintah Sudan bagian Selatan juga merupakan Wakil Presiden Pertama pemerintah nasional Sudan hingga 9 Juli 2011.