מוזיאומיקה

מוזיאומיקה (באנגלית: Museomics) היא חקר נתונים גנומיים המתקבלים מדגימות DNA עתיק (aDNA) ו-DNA היסטורי (hDNA) שנשמרות באוספי מוזיאונים. מחקר מוקדם בתחום זה התמקד ברצפי DNA קצרים מגנים מיטוכונדריאליים, ולימים התאפשר ריצוף גנומים שלמים. ניתן ליישם שיטות ריצוף הדור הבא (NGS) וריצוף תפוקה גבוהה (HTS) לשם ניתוח מערכי נתונים גנטיים המופקים מחומרי אוספים. טכניקות כאלה תוארו כ"מהפכה שלישית בטכנולוגיית הריצוף". בדומה לתיארוך פחמן רדיואקטיבי, טכניקות המוזיאומיקה הן טכנולוגיה טרנספורמטיבית. התוצאות מתעדנות ולעיתים הופכות על פיהן תיאוריות שהיו מקובלות בעבר לגבי מגוון רחב של נושאים, ובהם ביות הסוס.

אוספי מוזיאונים מכילים משאבים ייחודיים כגון דגימות היסטוריה של הטבע, אשר ניתן להשתמש בהם לבדיקת גנומים של מינים, האבולוציה שלהם ותגובותיהם לשינויים סביבתיים. DNA עתיק מספק הצצה לשינוי גנטי לאורך זמן. הוא מאפשר למדענים לחקור תהליכים אבולוציוניים ואקולוגיים, להשוות אוכלוסיות עתיקות ומודרניות, לזהות אוכלוסיות שונות ולחשוף דפוסי שינוי כגון הכחדות ונדידה. מחקר עשוי לשמש לזיהוי אוכלוסיות מבודדות ולקביעת סדרי עדיפויות לשימור.

עם זאת, דגימות מוזיאונים עלולות להישמר בצורה גרועה והן חשופות לפירוק ולזיהום. ניתוחים גנומיים מתמודדים עם אתגרים ניכרים כתוצאה מה-DNA המפורק האופייני לדגימות מוזיאונים. DNA מדגימות כאלה נתון לעיתים קרובות לנזק נוקלאוטידים לאחר המוות, כגון דיאמינציה הידרוליטית של ציטוזין (C) לשאריות אורציל (U). הגברת PCR של תבניות פגומות יכולה להחליף אורצילים בתימין (T) ולהשלים מסלול החלפה מ-C ל-T. שגיאות כאלה נוטות להתרחש באזורי קצות המולקולות ולהצטבר עם הזמן, ויכולות להיות משמעותיות בדגימות בנות מאה שנה או מאוחרות יותר. יש צורך בטכניקות גנומיות וסטטיסטיות חזקות כדי לזהות ולמנוע בקפדנות שגיאות ואי-ודאויות גנוטיפיות בעת ביצוע ניתוחים המבוססים על אוספי מוזיאונים. שיטות אופטימליות לעבודה עם hDNA ו-aDNA יכולות להיות שונות כתוצאה מהבדלים בהיסטוריית פירוק ה-DNA שלהם.

מוזיאומיקה כוללת גם דגימה הרסנית, כלומר הסרה בלתי הפיכה של חלקים מדגימות שלעיתים הן נדירות, כדי להשיג DNA. נושא זה שנוי במחלוקת עבור אוצרים וצוותי אוספים, וכרוך בסוגיות אתיות סביב הטיפול וההשמדה של חפצים, נוהלי רכישה והחזרה קולוניאליים, והשלכות חברתיות ופוליטיות עכשוויות של המחקר. מוזיאונים, אוניברסיטאות וכתבי עת מפתחים יותר ויותר הצהרות אתיקה, שיטות עבודה מומלצות והנחיות לעבודה בנושא זה.

 ראו גם 
 גנומיקה
 פרוטאומיקה

 קישורים חיצוניים 


 הערות שוליים 

קטגוריה:כימיה אנליטית
קטגוריה:מונחים בחפירה ארכאולוגית
קטגוריה:גנאלוגיה גנטית
קטגוריה:גנטיקה
קטגוריה:DNA