רצף שמור

בביולוגיה, רצף שמור הוא רצף זהה או דומה מאוד של חומצות גרעין ב-DNA או ב-RNA או רצף חומצות אמינו בחלבון המופיע במינים שונים ונשמר כמעט ללא שינוי לאורך האבולוציה. ככל שרצף מופיע יותר בעץ פילוגנטי הוא נחשב שמור יותר. מאחר שמידע גנטי מועבר בדרך כלל מהורים לצאצאים באמצעות גנים, גן שהרצף שלו שמור אבולוציונית יקרא גן שמור.

רצפים שמורים נחשבים בדרך כלל כמווסתים של תפקודים חיוניים ולכן נשמרו באופן בררני לאורך האבולוציה. מוטציה באזור של רצף שמור מאוד עשויה להיות חמורה, ונמנעת בברירה טבעית.

רצפי DNA שמורים מאוד עשויים להיות בעלי ערך פונקציונלי חשוב, אף שבמקרים רבים לא ידוע התפקיד המדויק של כל רצף שמור. ברצפים שמורים ביותר (Ultra-conserved element; UCE) שתוארו לראשונה ב-2004 על ידי גיל בז'רנו, נשמר הרצף במדויק (100%) לפחות בשני מינים שונים.

דוגמאות
תיבת TATA מוטיב הנמצא ברצף ה-DNA באזור הפרומוטור של גנים באאוקריוטים ובארכאונים. אל רצף זה נקשרים פקטורי שעתוק כלליים או היסטונים, והוא מעורב בתהליך השעתוק על ידי RNA פולימראז. תיבת ה-TATA כוללת את הרצף TATAAA או וריאציה קרובה. הרצף נמצא במיקום מסוים, כ-25–35 זוגות בסיסים מאתר תחילת השעתוק. הרצף נחשב לרצף שמור מבחינה אבולוציונית, ומקורו בשלב מוקדם של היצורים האיקריוטים.

ציטוכרום C חלבון קטן מסוג המצוי בקשר רופף עם הממברנה הפנימית של המיטוכונדריון, שם הוא ממלא תפקיד קריטי בנשימה תאית. זהו חלבון שמור מאוד בכל מגוון המינים האאוקריוטיים, ונמצא בצמחים, בבעלי חיים, בפטריות וברבים מהיצורים החד-תאיים. תכונה זו, יחד עם גודלו הקטן (משקל מולקולרי של כ־12,000 דלטון), הופכת אותו לשימושי במחקרי קלדיסטיקה. ציטוכרום c נחקר משום שהוא מספק הצצה להבנת הביולוגיה האבולוציונית. הוא משמש למחקרים פילוגנטיים וכן מחקרים על שעון מולקולרי.

הערות שוליים

קטגוריה:אבולוציה
קטגוריה:ביואינפורמטיקה