Pseudoencima

Os/as pseudoencimas ou pseudoenzimas son variantes de encimas que son cataliticamente deficientes (xeralmente inactivos), o que significa que realizan pouca ou ningunha catálise encimática. Crese que existen en todas as grandes familias de encimas en todos os reinos da vida. Os pseudoencimas están sendo cada vez máis importantes á hora de analizar a actividade celular, especialmente a medida que a análise bioinformática dos xenomas revela a súa omnipresenza. As súas importantes funcións reguladoras e ás veces as asociadas con doenzas nas vías de sinalización celular e metabólicas están proporcionando unha nova visión sobre as funcións non catalíticas dos encimas activos (o pluriemprego de proteínas ou protein moonlighting), e suxeríronse novas vías para abordar e interpretar os mecanismos de sinalización celular usando pequenas moléculas e fármacos. Os pseudoencimas que foron máis analizados e os mellor coñecidos en canto ás súas funcións de sinalización celular son probablemente as pseudoquinases, as pseudoproteases e as pseudofosfatases.

 Estruturas e funcións 
Detectouse a diferenza entre homólogos encimaticamente activos ou inactivos ás veces a nivel de secuencia (e en certos casos, comprendeuse isto cando se comparaban proteínas activas e inactivas de familias recoñecidas). e algúns pseudoencimas analizados en protozoos parasitos foron denominados 'procimas' ou 'prozimas'. Os pseudoencimas mellor estudados pertencen a varias superfamilias de encimas claves na sinalización celular, como as proteases, as proteína quinases, proteína fosfatases  e encimas modificantes de ubiquitina. Recoñeceuse tamén o papel dos pseudoencimas como "pseudoarmazóns"  e a bioloxía e función dos pseudoencimas están agora empezando a ser estudadas máis a fondo, en gran parte porque son tamén interesantes dianas potenciais (ou antidianas) para o deseño de fármacos no contexto dos complexos de sinalización celular intracelular.

 Examplos de clases 
 Clase  Función  Exemplos  Pseudoquinase  Regulación alostérica das proteína quinases convencionais STRADα regula a actividade da proteína quinase convencional LKB1. 
Os dominios das tirosina quinases C-terminais JAK1-3 e TYK2 son regulados polo seu dominio pseudoquinase adxacente.
KSR1/2 regule a activación da proteína quinase convencional Raf Regulación alostérica doutros encimas  VRK3 regula a actividade da fosfatase VHR Pseudo-Histidina quinase  Dominio de interacción con proteínas  A DivL de Caulobacter únese ao regulador da resposta fosforilado DivK, o que permite que DivL regula negativamente a quinase reguladora da división celular asimétrica CckA Pseudofosfatase
  Oclusión do acceso da fosfatase convencional ao substrato  EGG-4/EGG-5 únese ao bucle de activación fosforilado da quinase MBK-2
STYX compite con DUSP4 por unirse a ERK1/2 Regulación alostérica de fosfatases convencionais MTMR13 únese e promove a actividade da lípido fosfatase de MTMR2  Regulación da localización de proteínas na célula  STYX actúa como unha áncora nuclear para ERK1/2 Regulación da ensmblaxe do complexo de sinalización  STYX únese á proteína de caixa F FBXW7, para inhibir ao seu recrutamento no complexo SCF ubiquitina ligase Pseudoprotease  Regulador alostérico de protease convencional  cFLIP únese e inhibe a cisteína protease caspase-8 para bloquear a apoptose extrínseca Regulación da localización de proteínas na célula  As proteínas iRhom de mamíferos únense e regulan o tráfico das proteínas transmembrana de paso simple á membrana plasmática ou a vía de degradación asociada ao RE Pseudodeubiquitinase (pseudoDUB)  Regulador alostérico da DUB convencional  KIAA0157 é esencial para a ensamblaxe dun heterotetrámero de orde maior con DUB, BRCC36 e a actividade de DUB Pseudoligase (pseudo-Ubiquitina E2)  Regulador alostérico da E2 ligase convencional  Mms2 é unha variante de ubiquitina E2 (UEV) que se une á E2 activa Ubc13, para dirixir ligazóns de K63 ubiquitina Regulación da localización de proteínas na célula  Tsg101 é un compoñente do complexo de tráfico de moléculas ESCRT-I, e xoga un papel clave na unión da proteína Gag do VIH-1 e da evaxinación do VIH Pseudoligase (pseudo-Ubiquitina E3)  Posible regulador alostérico da familia RBR de E3 ligases convencionais   BRcat regula a arquitectura interdominio na familia RBR de E3 Ubiquitina ligases, como a parkina e Ariadne-1/2  Pseudonuclease  Regulador alostérico de nuclease convencional  CPSF-100 é un compoñente do complexo de procesamento do extremo 3' do pre-ARNm que contén o homólogo activo CPSF-73 PseudoATPase  Regulador alostérico de ATPase convencional  EccC comprende dous dominios pseudoATPase que regulan o dominio ATPase N-terminal convencional  PseudoGTPase  Regulador alostérico de GTPase convencional  O Rnd1 ou Rnd3/RhoE unidos a GTP únense a p190RhoGAP para regular a actividade catalítica da GTPase convencional RhoA Armazón para a ensamblaxe de complexos de sinalización  MiD51, que está cataliticamente morto pero únese a GDP ou ADP, forma parte dun complexo que recruta Drp1 para mediar na fisión mitocondrial. CENP-M non pode unirse a GTP ou cambiar conformacións, mais é esencial para nuclear o complexo CENP-I, CENP-H, CENP-K GTPase pequena para regular a enamblaxe do cinetocoro Regulación da localización de proteínas na célula  O dominio intermedio lixeiro de lévedo (LIC) é unha pseudoGTPase dedicada á unión a nucleótidos, que une a proteína motora dineína ao seu cargamento. O LIC humano ten preferencia por unirse a GDP antes que a GTP, o que suxire que a unión a nucleótidos podería darlle estabilidade en vez de intervir nun mecanismo de cambio conformacional. Pseudoquitinase Recrutamento ou secuestro de substrato  YKL-39 únese, pero non procesa, a quitooligosaccáridos por medio de 5 subsitios de unión Pseudosialidase 
 Armazón para a ensamblaxe de complexos de sinalización  CyRPA nuclea a ensamblaxe do complexo PfRh5/PfRipr de Plasmodium falciparum que se une ao receptor do eritrocito basixina e media na invasión da célula hóspede Pseudoliase 
 A activación alostérica de homólogos de encimas convencionais  A heterodimerización de procimas con S-adenosilmetionina descarboxilase (AdoMetDC) activa a actividade catalítica multiplicándoa por mil Pseudotransferase  
 Activación alostérica de homólogos de encimas celulares  O GAT viral recruta o PFAS celular para desaminar RIG-I e contrarrestar a defensa antiviral do hóspede. O parálogo morto da desoxihipusina sintase (TbDHS), DHSp, de Trypanosoma brucei únese e activa DHSc, cuxa actividade aumenta >1000 veces. Pseudo-histona acetil transferase (pseudoHAT) Posible armazón para a ensamblaxe de complexos de sinalización  A O-GlcNAcase humana (OGA) carece de reisudos catalíticos e da unión a acetil-CoA, a diferenza do seu equivalente bacteriano  Pseudo-fosfolipasePosible armazón para a ensamblaxe de complexos de sinalización  A familia de proteínas FAM83 suponse que adquiriu novas funcións con preferencia á actividade catalítica ancestral de fosfolipase D Inactivación alostérica do homólogo encimático convencional  O inhibidor da fosfolipase A2 de víbora ensámblase estruturalmente á proteína celular humana que é a súa diana, a fosfolipase A2.  Pseudo-oxidorredutase  Inactivación alostérica do homólogo de encima convencional  A ALDH2*2 impide a ensamblaxe do seu homólogo activo, a ALDH2*1, para formar un tetrámero. Pseudo-dismutase Activación alostérica do homólogo de encima convencional  A chaperona de cobre para a superóxido dismutase (CCS) únese e activa a catálise polo seu homólogo encimático, o SOD1  Pseudo-dihidroorotase  Regula o pregamento ou ensamblaxe do complexo de encima convencional A pDHO de Pseudomonas é necesaria para pregar a subunidade catalítica da aspartato transcarbamoilase ou a súa ensamblaxe nun oligómero activo Pseudo-RNase  Facilita a ensamblaxe/estabilidade do complexo e promove a asociación do parálogo catalítico KREPB4 pode actuar como pseudoencima para formar a metade non catalítica do heterodímero RNase III coa(s) endonuclease(s) editoras

 Notas 

 Véxase tamén 
 Outros artigos 
Quinase
Pseudoquinase
Fosfatoma
Proteína fosfatase

 Ligazóns externas 


Categoría:Bioquímica
Categoría:Sinalización celular
Categoría:Cancro