Motivo de recoñecemento do ARN

O motivo de recoñecemento do ARN (RRM), tamén chamado dominio de unión ao ARN (RBD) ou dominio de ribonucleoproteína (RNP), é un dominio proteico para a unión ao ARN duns 80-90 aminoácidos que se une ao ARN monocatenario, que foi atopado en moitas proteínas eucariotas.

O grupo máis grande de proteínas que se unen ao ARN monocatenario é a familia do motivo de recoñecemento do ARN (RRM) eucariótico que contén unha secuencia consenso RNP-1 de oito aminoácidos, principalmente aromáticos e de con carga positiva.

As proteínas RRM teñen varias preferencias de unión ao ARN e funcións, e inclúen ribonucleoproteínas nucleares heteroxéneas (RNPnhs), proteínas implicadas na regulación do splicing alternativo (SR, U2AF2, Sxl), compoñentes proteicos das ribonucleoproteínas nucleares pequenas (as snRNPs U1 e U2), e proteínas que regulan a estabilidade do ARN e a tradución (PABP, La, Hu). O factor de splicing heterodimérico U2AF1 parece ter dous dominios similares ao RRM con características especializadas para o recoñecemento de proteínas. O motivo tamén aparece nunhas poucas proteínas de unión ao ADN monocatenario.

O RRM típico consta de catro febras beta antiparalelas e dúas hélices alfa dispostas nun pregamento beta-alfa-beta-beta-alfa-beta con cadeas laterais que se amorean coas bases do ARN. Durante a unión ao ARN está presente unha terceira hélice nalgúns casos. O que se coñece sobre o dominio RRM é resumido nalgunhas publicacións.

 Proteínas humanas que conteñen este dominio 
A2BP1;     ACF;       BOLL;      BRUNOL4;   BRUNOL5;   BRUNOL6;   CCBL2;     CGI-96;    
CIRBP;     CNOT4;     CPEB2;     CPEB3;     CPEB4;     CPSF7;     CSTF2;     CSTF2T;    
CUGBP1;    CUGBP2;    D10S102;   DAZ1;      DAZ2;      DAZ3;      DAZ4;      DAZAP1;    
DAZL;      DNAJC17;   DND1;      EIF3S4;    EIF3S9;    EIF4B;     EIF4H;     ELAVL1;    
ELAVL2;    ELAVL3;    ELAVL4;    ENOX1;     ENOX2;     EWSR1;     FUS;       FUSIP1;    
G3BP;      G3BP1;     G3BP2;     GRSF1;     HNRNPL;    HNRPA0;    HNRPA1;    HNRPA2B1;  
HNRPA3;    HNRPAB;    HNRPC;     HNRPCL1;   HNRPD;     HNRPDL;    HNRPF;     HNRPH1;    
HNRPH2;    HNRPH3;    HNRPL;     HNRPLL;    HNRPM;     HNRPR;     HRNBP1;    HSU53209;  
HTATSF1;   IGF2BP1;   IGF2BP2;   IGF2BP3;   LARP7; MKI67IP;   MSI1;      MSI2;      MSSP-2;    
MTHFSD;    MYEF2;     NCBP2;     NCL;       NOL8;      NONO;      P14;       
PABPC1;    PABPC1L;   PABPC3;    PABPC4;    PABPC5;    PABPN1;    POLDIP3;   PPARGC1;   
PPARGC1A;  PPARGC1B;  PPIE;      PPIL4;     PPRC1;     PSPC1;     PTBP1;     PTBP2;     
PUF60;     RALY;      RALYL;     RAVER1;    RAVER2;    RBM10;     RBM11;     RBM12;     
RBM12B;    RBM14;     RBM15;     RBM15B;    RBM16;     RBM17;     RBM18;     RBM19;     
RBM22;     RBM23;     RBM24;     RBM25;     RBM26;     RBM27;     RBM28;     RBM3;      
RBM32B;    RBM33;     RBM34;     RBM35A;    RBM35B;    RBM38;     RBM39;     RBM4;      
RBM41;     RBM42;     RBM44;     RBM45;     RBM46;     RBM47;     RBM4B;     RBM5;      
RBM7;      RBM8A;     RBM9;      RBMS1;     RBMS2;     RBMS3;     RBMX;      RBMX2;     
RBMXL2;    RBMY1A1;   RBMY1B;    RBMY1E;    RBMY1F;    RBMY2FP;   RBPMS;     RBPMS2;    
RDBP;      RNPC3;     RNPC4;     RNPS1;     ROD1;      SAFB;      SAFB2;     SART3;     
SETD1A;    SF3B14;    SF3B4;     SFPQ;      SFRS1;     SFRS10;    SFRS11;    SFRS12;    
SFRS15;    SFRS2;     SFRS2B;    SFRS3;     SFRS4;     SFRS5;     SFRS6;     SFRS7;     
SFRS9;     SLIRP;     SLTM;      SNRP70;    SNRPA;     SNRPB2;    SPEN;      SR140;     
SRRP35;    SSB;       SYNCRIP;   TAF15;     TARDBP;    THOC4;     TIA1;      TIAL1;     
TNRC4;     TNRC6C;    TRA2A;     TRSPAP1;   TUT1;      U1SNRNPBP; U2AF1;     U2AF2;     
UHMK1;     ZCRB1;     ZNF638;    ZRSR1;     ZRSR2;

 Notas 

 Véxase tamén 
 Ligazóns externas 

Categoría:Dominios proteicos