Streptomyces

Streptomyces binne it grutste skaai fan Actinobacteria en in skaai fan de famylje Streptomycetaceae.Kämpfer, Peter, 2006, The Family Streptomycetaceae, Part I: Taxonomy url=https://books.google.com/books?id=swciHNNWZDEC&pg=PA538 s.538–604, Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt, The Prokaryotes, isbn 978-0-387-25493-7 Mear as 500 soarten fan Streptomyces-baktearjes binne beskreaun.Euzéby JP http://www.bacterio.cict.fr/s/streptomycesa.html Genus Streptomyces, List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, 2008 Krekt as by de oare Actinobaktearjes, binne streptomycetes Gram-posityf, en hawwe genomen mei in hege GC-ynhâld.Madigan M, Martinko J, Brock Biology of Microorganisms, Prentice Hall, 2005, isbn  0-13-144329-1  Se wurde meast fûn yn de grûn en by ferwyldere plantegroei, de measte streptomyceten produsearje spoaren, en binne ferneamd om har grûnige rook dy’t fan de produksje fan in flechtich metabolyt komt.

Streptomycetes wurde skaaimerke troch in komplekse sekundêre stofwiksel. Se produsearje mear as twa-tredde fan de klinysk brûkbere antibiotika fan natuerlik komôf (bgl, neomycine, cypemycine, grisemycine, bottromycins en Gloaramfenikol).Kieser T, Bibb MJ, Buttner MJ, Chater KF, Hopwood DA, Practical Streptomyces Genetics, John Innes Foundation, Norwich, Ingelân, 2000, isbn 0-7084-0623-8Understanding and manipulating antibiotic production in actinomycetes It no net mear algemien brûkte streptomycine ûntlient syn namme daliks oan Streptomyces. Streptomycetes binne ynfrekwinte sykteferwekkers, mar ynfeksjes by minsken, lykas mycetoma, kinne feroarsake wurde troch Streptomyces somaliensis en Streptomyces sudanensis, en yn planten troch Streptomyces caviscabies, Streptomyces acidiscabies, Streptomyces turgidiscabies en Streptomyces scabies.

Taksonomy

Streptomyces is it type skaai fan de famylje StreptomycetaceaeAnderson, AS, Wellington, Elizabeth, 2001, The taxonomy of Streptomyces and related genera, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 51, 3, s. 797–814 en omfiemet tsjintwurdich sa’n 576 soarten dêr’t alle jierren guon bykomme.Multilocus sequence analysis of phytopathogenic species of the genus Streptomyces|year, 2010, Labeda, D. P., International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 61, 10, s. 2525–31 Acidophilic en acid-tolerante dy’t earst yndield wiene by dit skaai binne letter ferpleatst nei  Kitasatospora (1997) A Proposal to Revive the Genus Kitasatospora (Omura, Takahashi, Iwai, and Tanaka 1982), 1997, Zhang, Z., Wang|, Y., Ruan, J., International Journal of Systematic Bacteriology, 47, 4, s.1048–54 en Streptacidiphilus (2003).2003, Kim|first, Seung Bum, Antonie van Leeuwenhoek, 83, 2|, s.107–16, Lonsdale, J, Seong, CN, Goodfellow, M, Streptacidiphilus gen. Nov., acidophilic actinomycetes with wall chemotype I and emendation of the family Streptomycetaceae (Waksman and Henrici (1943)AL) emend. Rainey et al. 1997 De nomeklatuer fan soarten is meastal basearre op harren kleur fan skimmeltriedden en spoaren. 

Saccharopolyspora erythraea waard foarhinne yn dit skaai pleatst (as Streptomyces erythraeus).

 Morfology 

It skaai Streptomyces omfiemet aerobic, Gram-positive, triedderige baktearjes dy’t goed ûntwikkele fegetative skimmeltriedden meitsje (tusken 0.5-2.0 µm yn trochsneed) mei ôftakkings. Se foarmje in kompleks mycelium substraat dat helpt by it ferwiderjen fan organyske ferbinings út har substraten. Hoewol't de mycelia en de antennes fan de skimmeltriedden dy't dêrút ûntsteane net mobyl binne, wurdt mobiliteit berikt troch fersprieding fan spoaren. Spoare-oerflakken kinne hierrich, ploaid, rûch, glêd, stikelich of fettich wêze.Dietz, Alma, Mathews, John, 1971, Classification of Streptomyces spore surfaces into five groups, Applied Microbiology, 21, 3, s. 527–533 By guon soarten besteane de antennes út lange, rjochte teisters, dy’t mear as 50 spoaren drage yn min ofte mear geregelde ynterfallen, rangskikt yn krânsen. Eltse tûke fan in harpe produsearret, yn syn top, in skerm dat fan twa oant ferskate keatlingen fan balfoarmige oant elipsfoarmige, glêde of ploaide spoaren draacht.Chater, Keith, Richard, Losick, Microbial development, Morphological and physiological differentiation in Streptomyces url=http://cshmonographs.org/index.php/monographs/article/view/4367 1984, isbn  978-0-87969-172-1, s. 89–115 Guon stammen foarmje koarte keatlingen fan spoaren op substrate skimmeltriedden. Sclerotia-, pycnidia-, sporangia-, en synnemata-lykjende struktueren wurde produsearre troch guon stammen.

 Genomika 
De folsleine genoom fan "Streptomyces coelicolor stamme A3(2)” waard publisearre yn 2002.Complete genome sequence of the model actinomycete Streptomyces coelicolor A3(2), Nature, 417, s.141–7, 2002, Bentley, S. D., Chater, K. F., Cerdeño-Tárraga, A.-M., Challis, G. L., Thomson, N. R., James, K. D., Harris, D. E., Quail, M. A., Kieser, H., Harper, D., Bateman, A., Brown, S., Chandra, G., Chen, C. W., Collins, M., Cronin, A., Fraser, A., Goble, A., Hidalgo, J., Hornsby, T., Howarth, S., Huang, C.-H., Kieser, T., Larke, L., Murphy, L., Oliver, K., O’Neil, S., Rabbinowitsch, E., Rajandream, M.-A., Rutherford, K. Doe waard tocht dat it "S. coelicolor" genoom it grutste tal genen fan alle baktearjes hie. De gromosoom is 8,667,507 bp lang mei in GC-ynhâld fan 72.1%, en befettet nei ferwachting 7,825 aaiwyt-kodearjende genen. Yn taksonomyske termen heart "S. coelicolor A3(2)" by de soarte Streptomyces violaceoruber, en is it gjin jildige ôfsûnderlike beskreaune soarte; "S. coelicolor A3(2)" moat net betize wurde mei de echte Streptomyces coelicolor (Müller), hoewol’t er foar it gemak gauris oantsjutten wurdt as S. coelicolorChater, Keith F., Biró, Sandor, Lee, Kye Joon, Palmer, Tracy, Schrempf, Hildgund, 2010, The complex extracellular biology of Streptomyces, FEMS Microbiology Reviews, 34, 2, s.171–98

De earste folsleine genoom fan S. avermitilis waard foltôge 2003.Complete genome sequence and comparative analysis of the industrial microorganism Streptomyces avermitilis, Nature Biotechnology, 21, 5, s. 526–31, 2003, Ikeda, Haruo, shikawa,, Jun, Hanamoto, Akiharu, Shinose, Mayumi, Kikuchi, Hisashi, Shiba, Tadayoshi, Sakaki, Yoshiyuki, Hattori, Masahira, Ōmura, Satoshi Elts fan dy genomen foarmet in gromosoom mei in lineêre struktuer, yn tsjinstelling ta de measte bakteariële genomen, dy't bestean yn 'e foarm fan sirkelfoarmige gromosomen.Paul Dyson, Streptomyces: Molecular Biology and Biotechnology url=https://books.google.com/books?id=3z9_QwFumi8C January 2012, Horizon Scientific Press, isbn 978-1-904455-77-6 

De genoomsekwinsje fan S. scabies, in lid fan it skaai dat skurft by ierdappels feroarsaakje kin,  is bepaald oan it Wellcome Trust Sanger Ynstitút. Mei 10.1 Mbp lang en kodearring foar 9.107 foarriedige genen, is it de grutst bekende Streptomyces genoomsekwinsje.http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_scabies Streptomyces scabies, Sanger Institute|accessdate

 Biotechnology 
Yn de ôfrûne jierren begûnen biotechnology-ûndersikers Streptomyces-soarten te brûken foar heterologe ekspresje fan aaiwiten. Tradisjoneel namen se Escherichia coli foar kar om Eukaryoate genen mei út te drukken, omdat se dat goed yn de macht hiene en it maklik wie om mei te wurkjen. Streptomyces: A host for heterologous gene expression, Current Opinion in Biotechnology, 2, 5, s. 674–81, 1991, Brawner, Mary, Poste, George, Rosenberg, Martin, Westpheling, JanetPayne, Gregory F. , Delacruz, Neslihan, Coppella, Steven J., 1990, Improved production of heterologous protein from Streptomyces lividans |journal=Applied Microbiology and Biotechnology, 33, 4, s. 395–400 It útdrukken fan eukaryoate aaiwiten yn E. coli kin problematysk wêze. Inkeld teare de aaiwiten net goed, wat liede kin ta ûnoplosberens, ôfsetting yn ynslutingslichems en ferlies fan bio-aktiviteit fan it produkt. Heterologous biopharmaceutical protein expression in Streptomyces, Trends in Biotechnology, 15, 8, s. 315–20, 1997, Binnie, Craig, Douglas Cossar, J., Stewart, Donald I.H. Hoewol't E. coli stammen ôfskiedingsmeganismen hawwe, binne dy net effisjint genôch en resultearje se yn ôfskieding yn de peryplasmatyske romte, wylst ôfskieding troch in Gram-positive baktearje, lykas in Streptomyces soarte, resultearret yn ôfskieding daliks yn it ekstrasellulêre medium. Dêrnjonken hawwe Streptomyces soarten effisjintere ôfskiedingsmeganismen as E.coli. De eigenskippen fan it sekreesjesysteem binne in foardiel foar yndustriële produksje fan heterologysk útdrukt aaiwyt omdat it de folgjende suveringsstappen makliker makket en de opbringst ferheegje kin. Under oare dizze eigenskippen meitsje Streptomyces spp. ta in oantreklik alternatyf foar oare baktearjes lykas E. coli and Bacillus subtilis. 

 Plantpatogene baktearjes 
Oant no ta hat bliken dien dat tsien soarten út dit skaai patogeen foar planten binne:
 S. scabiei
 S. acidiscabies
 S. europaeiscabiei
 S. luridiscabiei
 S. niveiscabiei
 S. puniciscabiei
 S. reticuliscabiei
 S. stelliscabiei
 S. turgidiscabies (skurft yn ierdappels)
 S. ipomoeae (weakrot yn swiete ierdappels)

 Eksterne links 
Current research on Streptomyces coelicolor at the Norwich Research Park
Some current Streptomyces Research & Methods / Protocols / Resources
S. avermitilis genome homepage (Kitasato Institute for Life Sciences)
S. coelicolor A3(2) genome homepage (Sanger Institute)
Streptomyces.org.uk homepage (John Innes Centre)
StrepDB - the Streptomyces genomes annotation browser
Streptomyces Genome Projects from Genomes OnLine Database

Kategory:Plantesykte
Kategory:Baktearjeskaai