Proteina Datenbazo

La Proteina Datenbazo aŭ Proteina Datenbanko (, akronime PDB) estas datenbazo por la tri-dimensiaj strukturaj datenoj de grandaj biologiaj molekuloj, kiel proteinoj kaj nukleataj acidoj . La datenoj  tipe estas akiritaj de ikso-radia kristalografio, NMR spektroskopio aŭ, pli kaj pli, krioelektrona mikroskopo kaj submetita fare de biologoj kaj biokemiistoj de tra la tuta mondo, estas libere alirebla sur la Interreto tra la retejoj de ties membraj organizaĵoj (PDBe , PDBj , RCSB  kaj BMRB ). La PDB estas kontrolita de organizaĵo nomita la Tutmonda Proteina Datenbanko (angle Worldwide Protein Data Bank, wwPDB).

La PDB estas ŝlosilo en areoj de struktura biologio, kiel struktura genomiko. Plej gravaj sciencaj revuoj kaj kelkaj fondumaj agentejoj nun postulas sciencistojn submeti iliajn strukturajn datenojn al la PDB. Multaj alia datenbazoj uzas proteinajn strukturojn  deponitaj en la PDB. Ekzemple, SCOP kaj CATH klasifikas proteinajn strukturojn, dum PDBsum provizas plendetalan superrigardon de PDBaj registraĵoj uzante informon de aliaj fontoj, kiel Gena Ontologio .

 Referencoj 

 Eksteraj ligiloj 

 La Tutmonda Proteina Datenbazo (wwPDB) —gepatra retejo al regionaj gastigantoj (sube listigitaj)
 RCSBa Proteina Datenbanko (US)
 PDBe (Eŭropo)
 PDBj (Japanio)
 BMRB, Biologia Magneta Resonanca Datenbanko  (US)
 wwPDB Dokumentado —dokumentado de ambaŭ la PDBa kaj PDBMLa dosierformatoj
 Rigardante strukturojn—La enkonduko de la RCSB al crystallography
 PDBsum Hejmpaĝo—eltiras datenoj de aliaj datumbazoj pri PDBaj strukturoj.
 Nukleacida Datumbazo , NDB—PDBa spegula retejo precipe por serĉado de nukleaj acidoj
 Enkonduka PDBa seminario sponsorita de PDB
 PDBe: Rapida Travojaĝo de EBI trejnu enrete

Kategorio:Biokomputiko
Kategorio:Scienco kaj teknologio en Usono
Kategorio:Proteina strukturo
Kategorio:Biologiaj datumbazoj
Kategorio:Kristalografio