Beta-lameno

Dua stabila aranĝo de polipeptidaj ĉenoj estas la etendita ĉeno, aŭ beta-plisita lameno.  En ĉi tiu strukturo, pluraj paralelaj polipeptidaj ĉenoj, plene etenditaj, estas tenataj en lamen-simila aranĝo per hidrogen-ligoj de la tipo

                         \       /
                          N-H:O=C
                         /       \  

En ĉi tiu aranĝo, la hidrogen-ligoj estas inter ĉenoj prefere al inter
aminoacidoj en unuopa ĉeno, kiel en la alfa-helico.
Lamenoj povas esti paralelaj aŭ kontraŭparalelaj, depende de tio, ĉu la N-finlokaj aminoacidoj estas ĉe la sama finaĵo (paralelaj), aŭ ĉe malaj finaĵoj (kontraŭparalelaj).  

Oni trovas la beta-plisitan lamenon ofte nur en la proteino de silko.  Se
oni vaporumas la lanan proteinon, alfa-keratinon, kaj poste sekigas ĝin
dum ĝi estas streĉata, ĝi daŭre tenas la streĉitan formon.  La proteino
alprenas la aranĝon de la beta-plisita lameno en la streĉitaj lanaj fibroj.
Oni konas kelkajn ekzemplojn kie unuopa polipeptida ĉeno formas mallongajn sekciojn de kontraŭparalela beta-plisita lameno per refaldo sur sin.

Ĉi-tiuj strukturoj similas al lamenoj, kun la ĉefĉeno(j) plate interligita(j) kaj kun la flankaj grupoj de aminoacidoj direktitaj perpendike kaj al la ekstero de la lameno supren kaj malsupren.

    N          C      N          C            N           N           N
     \_      _/        \_      _/              \_          \_          \_
      Cα     Cα         Cα     Cα               Cα          Cα          Cα
     /        \        /        \              /           /           /
  O=C          N-H::O=C          N-H        O=C       ::O=C       ::O=C
     \_      _/        \_      _/              \_   :::    \_    ::    \_
      N-H::O=C          N-H::O=C                N-H::       N-H::       N-H
     /        \        /        \              /           /           /
    Cα        Cα      Cα        Cα            Cα          Cα          Cα
     \_      _/        \_      _/              \_          \_          \_
      C=O::H-N          C=O::H-N                C=O::       C=O::       C=O         
     /        \        /        \              /    :::    /    :::    /
  H-N          C=O::H-N          C=O        H-N       ::H-N       ::H-N
     \_      _/        \_      _/              \_          \_          \_
      Cα     Cα         Cα     Cα               Cα          Cα          Cα
     /        \        /        \              /           /           /
    C          N      C          N            C           C           C


       kontraŭparalelaj ĉenoj                     paralelaj ĉenoj

Kategorio:Proteomiko