Απλοομάδα T (mtDNA)

Η απλοομάδα Τ είναι απλοομάδα του ανθρώπινου μιτοχονδριακού DNA (mtDNA). Πιστεύεται πως προέρχεται από περίπου 25,100 χρόνια πριν, από την Εγγύς Ανατολή.   

 Προέλευση 
Το μιτοχονδριακό κλαδί T προέρχεται από την απλοομάδα JT, η οποία έδωσε επίσης την προέλευση στην απλοομάδα J. Το μητρικό κλαδί Τ πιστεύεται ότι προέρχεται από την Εγγύς Ανατολή.

 Κατανομή 
μικρογραφία|Προβλεπόμενη χωρική κατανομή συχνότητας για την απλοομάδα Τ.
Η βασική απλοομάδα T* βρίσκεται μεταξύ των Αλγερινών στο Οράν (1.67%) και το Ρεγκιβάτη Σαχάρι (0.93%).; S5 Table Διανέμεται επίσης μεταξύ των Σοκοτριών (1,2%).

Η απλοομάδα T είναι παρούσα σε χαμηλές συχνότητες σε όλη τη Δυτική και Κεντρική Ασία και την Ευρώπη, με διαφορετικό βαθμό επικράτησης και σίγουρα θα μπορούσε να ήταν παρούσα σε άλλες ομάδες από τις γύρω περιοχές. Η T βρίσκεται σε περίπου το 10% των ιθαγενών Ευρωπαίων. Είναι επίσης κοινή μεταξύ των σύγχρονων Ιρανών. Με βάση ένα δείγμα πάνω από 400 σύγχρονων Ιρανών, η απλοομάδα Τ αντιπροσωπεύει περίπου το 8,3% του πληθυσμού (περίπου 1 από 12 άτομα), ενώ ο πιο συγκεκριμένος υποτύπος Τ1 αποτελεί περίπου το ήμισυ αυτών.  Επιπλέον, ο συγκεκριμένος υποτύπος T1 τείνει να βρίσκεται πιο ανατολικά και είναι κοινός στην Κεντρική Ασία και σύγχρονους Τουρκικούς πληθυσμούς (Lalueza-Fox 2004), οι οποίοι κατοικούν σε μεγάλο βαθμό την ίδια περιοχή με τους αρχαίους Σάκες (Σκύθες), Σαρμάτες, Ανδρονόβο και άλλους υποτιθέμενους Ιρανικούς λαούς της 2ης και 1ης χιλιετίας π.Χ. Ο Lalueza-Fox και οι συνεργάτες του (2004) βρήκαν επίσης αρκετές ακολουθίες T και T1 σε αρχαίες τάφους, συμπεριλαμβανομένων των Κουργανών, στην στέπα του Καζακστάν μεταξύ του 14ου-10ου αιώνα π.Χ., καθώς και αργότερα στην 1η χιλιετία π.Χ. Αυτές συμπίπτουν με το τελευταίο μέρος της περιόδου των Ανδρονόβο και της περιόδου των Σάκων στην περιοχή.

Η γεωγραφική κατανομή εντός του υποκλαδίου T2 ποικίλλει σημαντικά με τη σχέση της υπο-απλοομάδας T2e με T2b να αναφέρεται ότι ποικίλλει 40 φορές σε όλα τα εξεταζόμενα πληθυσμιακά στοιχεία από χαμηλά στη Βρετανία και την Ιρλανδία, μέχρι σε υψηλό στη Σαουδική Αραβία (Bedford 2012). Στο πλαίσιο της υποομάδας T2e, ένα πολύ σπάνιο μοτίβο εντοπίζεται μεταξύ των Σεφαρδιτών Εβραίων της Τουρκίας και της Βουλγαρίας και των  από τον Νέο Κόσμο (Bedford 2012).

Έχει βρεθεί στον πληθυσμό των Σβάν από τον Καύκασο (Γεωργία) T* 10,4% και T1 4,2%. Η T1a1a1 είναι ιδιαίτερα συχνή σε χώρες με υψηλά επίπεδα της Υ-απλοομάδας R1α, όπως η Κεντρική και Βορειοανατολική Ευρώπη. Το κλαδί βρίσκεται επίσης παντού στην Κεντρική Ασία και βαθιά στη Βόρεια Ασία, τόσο ανατολικά όσο Μογγολία.

Η T2c και η T2d φαίνεται να έχουν προέλευση από την Εγγύς Ανατολή κατά τη διάρκεια του Τελευταίου Παγετώδους Μέγιστου (LGM) και πιο πρόσφατων διασκορπισμών στην Ευρώπη. Το μεγαλύτερο μέρος του T2c αποτελείται από την απλοομάδα T2c1. Εκτός από μια κορυφή στην Κύπρο, το T2c1 είναι πιο συχνή στην περιοχή του Περσικού Κόλπου, αλλά βρίσκεται επίσης στο Λεβάντε και στη Μεσογειακή Ευρώπη, με πιο μακρινή κατανομή σε πολύ χαμηλά επίπεδα.

Η T2 έχει επίσης βρεθεί και μεταξύ των Σοκότριων (7,7%).

 Αρχαιολογία 
Η Wilde και οι συνεργάτες της (2014) εξέτασαν δείγματα mtDNA από τον πολιτισμό Yamna, την υποτιθέμενη πατρίδα των ομιλητών της πρωτοινδοευρωπαϊκης γλώσσας . Βρήκαν την T2a1b στην περιοχή του Μέσου Βόλγα και τη Βουλγαρία, και την T1a τόσο στην κεντρική Ουκρανία όσο και στο Μέσο Βόλγα. Η συχνότητα του T1a και του T2 σε καθένα απο τα δείγματα από τον πολιτισμό Yamna ήταν 14,5%, ποσοστό υψηλότερο από οποιαδήποτε χώρα σήμερα και βρήσκεται μόνο σε παρόμοιες υψηλές συχνότητες μεταξύ των Ουντμουρτών της περιοχής Βόλγα-Ουραλίων (Idel-Ural).

Η απλοομάδα T έχει επίσης βρεθεί μεταξύ Ιβηρομαυρούσιων δειγμάτων που χρονολογούνται από την Επιπαλεολιθική περίοδο στον προϊστορικό χώρο Afalou στην Αλγερία. Ένα αρχαίο άτομο είχε το υποκλάδιT2b (1/9; 11%). Επιπλέον, η απλοομάδα T έχει παρατηρηθεί μεταξύ αρχαίας αιγυπτιακής μούμιας που ανασκάφηκαν στον αρχαιολογικό χώρο Abusir el-Meleq στην Κεντρική Αίγυπτο, που χρονολογούνται από την Προ-Πτολεμαϊκή / Νέο Βασιλείο αρχαίας Αιγύπτου (T1, T2) εποχή, την εποχή τους Πτολεμαίου (T1, Τ2), και Ρωμαϊκής Αιγύπτου (αποχωρισμένο T, T1). Απολιθώματα που ανασκάφηκαν στο Kehf el Boroud στο Μαρόκο, αρχαιολογικό χώρο απο την Ύστερη Νεολιθική περίοδο, τα οποία έχουν χρονολογηθεί γύρω στο 3000 π.Χ., έχουν επίσης παρατηρηθεί ότι φέρουν το υποκλάδι T2.  Επιπλέον, η απλοομάδα T έχει παρατηρηθεί σε αρχαία απολιθώματα Γουάντσε που ανασκάφηκαν στην Γκραν Κανάρια και την Τενερίφη των Καναρίων Νήσων, τα οποία έχουν χρονολογηθεί με Ραδιοχρονολόγηση άνθρακα-14 πως προέρχονται μεταξύ του 7ου και 11ου αιώνα μ.Χ. Τα άτομα που ανήκουν σε αυτά τα κλαδιά, θάφτηκαν στον αρχαιολογικό χώρο της Τενερίφης, με ένα δείγμα να ανήκει στο υποκλάδι T2c1d2 (1/7; 14%).

 Αφρική 
Στην Αφρική, η απλοομάδα T βρίσκεται κυρίως μεταξύ των Αφρο-Ασιατικών πληθυσμών, συμπεριλαμβανομένης του βασικού κλάδου T * .; S5 Table Μερικά μη βασικά T κλαδιά βρίσκονται επίσης συνήθως μεταξύ των Σερερ που μιλούν Νιγηροκονγκολεζικές γλώσσες λόγω διάχυσης από το Μαγκρέμπ, πιθανότατα με την εξάπλωση του Ισλάμ.
ΠολιτισμόςΤοποθεσίαΓλωσσική ΟικογένειαΕιδικότεραΣυμπίεσηΠηγήΑμαχάραΑιθιοπίαΑφροασιατική > Σεμιτική5/1204.17%ΜπεζαΣουδάνΑφροασιατική > Κουσιτική1/482.1%Βήτα ΙσραήλΑιθιοπίαΑφροασιατική > Κουσιτική0/290.00%ΚοπτΑίγυπτοςΑφροασιατική > Αιγυπτιακή5/2917.2%Ντάουρο Κ.ΑιθιοπίαΑφροασιατική > Ομοτική2/1371.46% και Αιγύπτιοι (Ελ-Χέιζ) ΑίγυπτοςΑφροασιατική > Σεμιτική10/3528.6%ΑιθιοπίαΑιθιοπίαΑνεπίσημη2/772.60%Εβραίος ΑιθιοπίαςΑιθιοπίαΑφροασιατική > Κουσιτική0/410.00%ΓκαράζΑιθιοπίαΑφροασιατική > Σεμιτική0/210.00%ΧάμερΑιθιοπίαΑφροασιατική > Ομοτική0/110.00% και ΟνοτόμαΑιθιοπίαΑφροασιατική > Κουσιτική0/190.00% και ΟρόμαΑιθιοπίαΑφροασιατική > Κουσιτική0/330.00%ΤιγκράιΑιθιοπίαΑφροασιατική > Σεμιτική3/446.82%ΔασαναχΚένυαΑφροασιατική > Κουσιτική0/490.00%ΕλμόλοΚένυαΑφροασιατική > Κουσιτική0/520.00% και ΛοΚένυαΝίλο-Σαχάρα0/490.00% και ΜασαΐΚένυαΝίλο-Σαχάρα0/810.00% και ΝάιρομπιΚένυαΝιγηρ-Κονγκό0/1000.00%ΝτανγιάτομΚένυαΝίλο-Σαχάρα0/1120.00%ΡεντίλΚένυαΑφροασιατική > Κουσιτική0/170.00% και ΣαμπούρουΚένυαΝίλο-Σαχάρα0/350.00% και ΤούρκναΚένυαΝίλο-Σαχάρα0/510.00% και ΧούτουΡουάνταΝιγηρ-Κονγκό0/420.00%ΤσίπραςΣουδάνΝίλο-Σαχάρα0/460.00%ΣουδάνΣουδάνΑνεπίσημη3/1022.94%ΚαύσηΤανζανίαΑφροασιατική > Κουσιτική0/380.00%ΔατογιάΤανζανίαΝίλο-Σαχάρα1/571.75% και ΙράκΤανζανίαΑφροασιατική > Κουσιτική0/120.00%ΣούκουμαΤανζανίαΝιγηρ-Κονγκό0/320.00% και ΤούρουΤανζανίαΝιγηρ-Κονγκό0/290.00%ΥεμένιοςΗ ΥεμένηΑφροασιατική > Σεμιτική1/1140.88%

 Ασία 

 Ευρώπη 

 Υπόκλαδοι 
μικρογραφία|Σχηατικό δέντρο της απλοομάδας T mtDNA . Οι ηλικίες (σε ka) που αναφέρονται είναι οι μέγιστες εκτιμήσεις πιθανοτήτων που ελήφθησαν για το σύνολο του ιτοχονδριακού γονιδίου .

 Δένδρο 
Αυτό το φυλογενετικό δέντρο των υποκλαδίων της απλοομάδας Ι βασίζεται στην έρευνα (van Oven 2008) και στη μεταγενέστερη δημοσιευμένη έρευνα (Behar 2012b). Για συντομία, παρουσιάζονται μόνο τα τρία πρώτα επίπεδα των υποκλαδίων (κλαδίών).

 Τ
 Τ1
 Τ1α
 T1α1
 Τ1α2
 Τ1β
 Τ2
 T2α
 T2α1
 Τ2β
 Τ2β1
 Τ2β2
 Τ2β3
 T2b4
 Τ2β5
 Τ2β6
 Τ2Κ
 T2c1
 Τ2δ
 Τ2ε
 Τ2ε2
 T2f
 Τ2φ1
 Τ2γ

 Θέματα Υγείας 
Μια μελέτη έδειξε ότι η απλοομάδα T σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης στεφανιαίας καρδιακής νόσου.   Ωστόσο, ορισμένες μελέτες έχουν επίσης δείξει ότι οι άνθρωποι της απλοομάδας Τ είναι λιγότερο επιρρεπείς στον διαβήτη ( και ).

Μερικές δοκιμαστικές ιατρικές μελέτες έχουν δείξει ότι η απλοομάδα T μπορεί να προσφέρει κάποια αντίσταση τόσο στη νόσο του Πάρκινσον όσο και στη νόσο του Αλτσχάιμερ.

Μια μελέτη διαπίστωσε ότι στον ισπανικό πληθυσμό, η υπερτροφική μυοκαρδιοπάθεια (HCM) που αναφέρεται επίσης ως υπερτροφική αποφρακτική μυοκαρδιοπάθεια (HOCM) είναι πιο πιθανό να συμβεί σε άτομα με καταγωγή Τ2 από εκείνους από άλλες μητρικές απλοομάδες..  Είναι άγνωστο εάν αυτό είναι συγκεκριμένο ή όχι για αυτήν την υποκατηγορία της απλοομάδας Τ ή είναι ένας παράγοντας κινδύνου που μοιράζεται όλη η απλοομάδα Τ. Με μια στατιστικά σημαντική διαφορά που βρέθηκε σε ένα τόσο μικρό δείγμα, μπορεί να ενδείκνυται για εκείνους της γνωστής μητρικής απλοομάδας Τ να το γνωρίζουν αυτό και να ζητήσουν από τον γιατρό τους να ελέγξει για ενδείξεις αυτής της πάθησης όταν κάνουν μια εξέταση ρουτίνας σε νεαρή ηλικία. Συνήθως δεν παρουσιάζει συμπτώματα και αυξάνει τον κίνδυνο ξαφνικού καρδιακού θανάτου, το οποίο συχνά συμβαίνει σε άτομα νεαρής ηλικίας όπως οι εφήβοι και μπορεί να επηρεάσει εκείνους που είναι ενεργοί και δεν έχουν άλλους παράγοντες κινδύνου.

Ορισμένες ιατρικές μελέτες έχουν δείξει ότι η μιτοχονδριακή απλοομάδα T συνδέεται με μειωμένη κινητικότητα σπέρματος σε άνδρες, αν και αυτά τα αποτελέσματα έχουν αμφισβητηθεί (Mishmar 2002). Σύμφωνα με το Departamento de Bioquimica y Biologica Molecular y Celular, Universidad de Zaragoza, η απλοομάδα T μπορεί να δημιουργήσει προδιάθεση για ασθενοζωοσπερμία (Ruiz-Pesini 2000). Ωστόσο, τα ευρήματα αυτά αμφισβητήθηκαν λόγω του μικρού μεγέθους του δείγματος της μελέτης (Mishmar 2002).

 Γνωστά μέλη 
Κατά τη διάρκεια του ντοκιμαντέρ του BBC One Meet the Izzards, ο ηθοποιός και κωμικός Eddie Izzard μαθαίνει ότι το μιτοχονδριακό DNA του είναι από την απλοομάδα T, συγκεκριμένα το υποκλάδι T2f1a1.

Ο Henry Louis Gates Jr. ανήκει στην απλοομάδα T2b2.

 Νικόλαος Β ́ της Ρωσίας 
Ο τελευταίος Ρώσος Τσάρος, ο Νικόλαος Β ́, έχει αποδειχθεί ότι ανήκει στην απλοομάδα T, συγκεκριμένα στο υποκλάδι T2 (Ivanov 1996). Υποθέτοντας ότι όλα τα σχετικά γενεαλογικά είναι σωστά, αυτό περιλαμβάνει όλους τους γυναικείους απόγονους της γυναικείας του προγόνου της Μπάρμπαρα του Τσέλιε (1390-1451), σύζυγο του Σιγισμούνδου, Αυτοκράτορα της Αγίας Ρωμαϊκής Αυτοκρατορίας. Επίσης περιλαμβάνει μεγάλο αριθμό ευγενών Ευρωπαίων, συμπεριλαμβανομένου του Γεωργίου Α΄ της Μεγάλης Βρετανίας και του Φρειδερίκου Γουλιέλμου Α΄ της Πρωσίας (μέσω της Σοφίας του Αννόβερου), του Καρόλου Α΄ της Αγγλίας, του Γεωργίου Γ ́ του Ηνωμένου Βασιλείου, του Γεώργιου Ε΄ του Ηνωμένου Βασιλείου, του Καρόλου Ι΄ Γουσταύου της Σουηδίας, του Γουσταύου Β΄ Αδόλφου της Σουηδίας, του Πρίγκιπα Μαυρικίου της Οράγγης, του Όλαφ Ε΄ της Νορβηγίας και του Γεωργίου Α΄ της Ελλάδας.

 Σημειώσεις 

 Παραπομπές 

 Πηγές 


 Ιστότοποι 





 Περαιτέρω ανάγνωση 








































































 Εξωτερικοί σύνδεσμοι 

 Γενικός
 Το Μιτοχονδριακό DNA του Ίαν Λόγκαν Τοποθεσία μετοχονδριακού DNA
 Το Φιλότραμ του Μάνις βαν Όβεν Φιλοτρόπος
 Η γενογραφική σχετική κοινή συμμετοχή Μυτοχονδριακή βάση δεδομένων DNA
 Χαπλόομάδα Τ
 Η Haplogroup T του YFull MTree Χαπλόομάδα Τ
 Η Χαπλόομάδα Τ του MITOMAP
 ΟικογενειακόΤριDNA mtDNA Χαπλοτρί: Χαπλομάχη Τ Χαπλόομάδα Τ
 Διαστολή της Χαπλοομάδας Τ, από την National GeographicΕθνική Γεωγραφία
 Γενετική Γενεαλογία: Μια Προσωπική Αντιλήψη για την Τάρα, Καρελιανές και Κεντ, Αγγλία
 Ανάλυση της ακολουθίας Haplogroup T (T5/T2)
 Φυλογενετικά δίκτυα για την ανθρώπινη mtDNA Haplogroup T Αρχειοθετημένο 2008-05-31 στο Wayback Machine
 Φυλογενετικά δίκτυα για την ανθρώπινη mtDNA Χαπλοομάδα T Αρχειοθετημένο 2008-05-09 στο Wayback Machine
 mtDNA Χαπλόομάδα T - Πλήρης Έρευνας Γενομικής Τάξης

T