Μικρό RNA

Το Μικρό RNA (Small RNA (sRNA)) είναι πολυμερή μόρια RNA που έχουν μήκος μικρότερο από 200 νουκλεοτίδια και συνήθως είναι μη κωδικοποιητικό. 
Η σίγαση RNA (RNA silencing) είναι συχνά λειτουργία αυτών των μορίων, με το πιο κοινό και καλά μελετημένο παράδειγμα να είναι η παρεμβολή RNA (RNA interference (RNAi)), στο οποίο το ενδογενώς εκφρασμένο μικροRNA (microRNA (miRNA)) ή το εξωγενώς προερχόμενο μικρό παρεμβαλλόμενο RNA (small interfering RNA (siRNA)) επάγει την αποικοδόμηση του συμπληρωματικού αγγελιοφόρου RNA. Άλλες κατηγορίες μικρού RNA έχουν ταυτοποιηθεί, συμπεριλαμβανομένων του Piwi-αλληλεπιδρώντος RNA (piRNA) και του υποείδους του που σχετίζεται με επανάληψη του μικρού παρεμβαλλόμενου RNA (repeat associated small interfering RNA (rasiRNA)). Το μικρό RNA "δεν μπορεί να επάγει μόνο του το RNAi και για να ολοκληρώσει το έργο πρέπει να σχηματίσει τον πυρήνα του συμπλέγματος RNA-πρωτεΐνης που ονομάζεται σύμπλοκο σίγασης που προκαλείται από RNA (RNA-induced silencing complex (RISC)), ειδικά με την πρωτεΐνη Argonaute (Αργοναύτης)".
Μικρό RNA ανιχνεύτηκε ή αλληλουχήθηκε χρησιμοποιώντας μια σειρά τεχνικών, συμπεριλαμβανομένης της απευθείας με Αλληλουχία μικροRNA σε διάφορες πλατφόρμες αλληλούχισης, ή έμμεσα μέσω αλληλούχισης και ανάλυσης του γονιδιώματος. Η ταυτοποίηση των miRNAs έχει αξιολογηθεί για την ανίχνευση ανθρώπινων ασθενειών, όπως ο καρκίνος του μαστού. Η έκφραση miRNA σε μονοπύρηνα κύτταρα περιφερικού αίματος (Peripheral blood mononuclear cell (PBMC)) έχει μελετηθεί ως πιθανός βιοδείκτης για διαφορετικές νευρολογικές διαταραχές όπως η νόσος του Πάρκινσον, και η Πολλαπλή σκλήρυνση. Η αξιολόγηση μικρού RNA είναι χρήσιμη για ορισμένα είδη μελετών επειδή τα μόριά του "δεν χρειάζεται να κατακερματιστούν πριν από την προετοιμασία της βιβλιοθήκης".
Οι τύποι μικρού RNA περιλαμβάνουν:
 ΜικροRNA (microRNA (miRNA))
 Piwi-αλληλεπιδρόν RNA (Piwi-interacting RNA (piRNA))
 Μικρό παρεμβαλλόμενο RNA (small interfering RNA (siRNA))
 Μικρό πυρηνικό RNA (small nuclear RNA (snRNA)), γνωστό και ως U-RNA
 Μικρό πυρηνισκικό RNA (small nucleolar RNA (snoRNA)
 Μικρό ριβοσωμικό DNA-παραγόμενο RNA (small rDNA-derived RNA (srRNA))
 Θραύσμα tRNA (tRNA fragment (tRF))
 Μικρό RNA από Y RNA (Y RNA-derived small RNA (ysRNA))
Στα φυτά
Η πρώτη γνωστή λειτουργία στα φυτά ανακαλύφθηκε σε μεταλλάγματα της αραβίδοψης. Συγκεκριμένα με μείωση της λειτουργίας της μετάλλαξηs για την παραγωγή πολυμεράσης RNA που εξαρτάται από RNA και παρόμοιας με DICER.
Αυτή η διαταραχή ενίσχυσε στην πραγματικότητα την αντοχή της αραβίδοψης έναντι των Heterodera schachtii και Meloidogyne javanica. Ομοίως, τα μεταλλαγμένα με μειωμένη λειτουργία Argonaute - ago1-25, ago1-27, ago2-1 και συνδυασμένα μεταλλαγμένα με ago1-27 και ago2-1 - είχαν μεγαλύτερη αντίσταση στο ago1-27, και συνδυασμένα μεταλλαγμένα με ago1-27 και ago2-1 - είχαν μεγαλύτερη αντίσταση στο Meloidogyne incognita Συνολικά αυτό καταδεικνύει μεγάλη εξάρτηση του νηματώδη παρασιτισμού από τα μικρά RNA των φυτών.

 Παραπομπές 

Κατηγορία:Μη κωδικοποιητικό RNA