Lokus (gen)

U genetici, lokus je specifično mjesto (lokacija) ili pozicija (na hromosomu) jednog gena u DNK sekvenci. Svaki hromosom nosi mnoštvo gena.Za čovjeka je procijenjeno da 'haploidni' set proteina kodiraju geni sa oko 20-25 hiljada gena koji su locirani na 23 različita hromosoma. Moguće varijante iste DNK sekvence (gena) na datom lokusu označene su kao aleli. Uređena lista lokusa u određenom genomu se naziva genetička mapa. Gensko mapiranje je proces utvrđivanja lokusa za određenu biološku osobinu.Ibrulj S., Haverić S., Haverić A. (2008): Citogenetičke metode – Primjena u medicini . Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo,.Hadžiselimović R., Pojskić N. (2005): Uvod u humanu imunogenetiku. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, .

Diploidne i poliploidne ćelije čiji hromosomi imaju iste alele datog gena u nekom lokusu  zovu  se homozigoti u odnosu na taj gen, dok su oni koji imaju različite alele datog gena na određenom lokusa heterozigoti.Cancer Institute

 Nomenklatura 
Lokusa nekog gena na  hromosomu lmože biti napisan kao, npr.,  6p21.3,  gdje se 21 se odnosi na region 2, bend 1, što se čita kao dva jedan, a ne kao "dvadeset jedan". Dakle, cijeli lokusa je: šest P dva jedan  tačka tri.

 Komponenta  Objašnjenje  6  Hromosomski broj (redni u garnituri) p  Pozicija na hromosomskom kratkom kraku (p);  q  označava dugi krak (prema narednom slovu – iza p u abecedi) 21.3 Brojevi koji slijede u predstavljaju poziciju na kraku:Regija 2, bend 1, sub-band 3. Bendovi su vidljivi pod mikroskopom kada je hromosom ispruga G trakama.  Svaki od bendova je numeriran, počevši s 1 za bend najbliže centromeri. Sub-bendovi i sub-sub-bendovi su vidljivi na višim rezolucijama mikroskopiranja.

Raspon lokusa je naveden na sličan način. Na primjer, lokus  gena OCA1 se može pisati "11q1.4-q2.1", što znači da je na dugom kraku hromosoma 11, negdje u rasponu od sub-banda 4 regije 1 do sub-banda 1 regije 2.
Krajevi  dugog kraka hromosoma 2 se obilježavaju: pter  i qter i 2qter'

 Centisom 
Centisome (ne brkati sa centrosom) je definiran kao 1% dužine hromosoma.

Reference

Također pogledajte
Hromosom
Centromera

 Vanjski linkovi 
 http://genome.ucsc.edu/ 
 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genemap/ 
 http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/posters/chromosome/omim.shtml#GeneMap  
 http://www.genetics.org/cgi/content/abstract/170/4/1849 
 http://scholar.google.com/scholar?hl=en&lr=&q=%22noncoding+locus%22&btnG=Search

Kategorija:Genetika
Kategorija:Citogenetika