Борг (біялогія)

Борг — гэта «гіганцкі экстрахрамасомны элемент са здольнасцю ўзмацнення анаэробнага акіслення метану», апісаны Басам Аль-Шайебам і Джыл Бэнфілд. Боргі — гэта доўгія паслядоўнасці ДНК, якія існуюць побач з асноўнай храмасомай у архей Methanoperedens у асяроддзі з недахопам кіслароду, такім як глыбокая гразь. Боргі былі знойдзены прафесарам Джыл Бэнфілд і яе камандай у глебе балот, ваданоснага пласта, рэчышча ракі і закінутай ртутнай шахты ў штатах Каліфорнія і Каларада.

Боргі лічацца новай формай «гіганцкіх лінейных плазмід» або гіганцкіх вірусаў, а не невядомых элементаў ДНК.    Яны сустракаюцца разам з відам архей, які, верагодна, прымае іх і мае шмат агульных генаў. Асноўная храмасома археі толькі ў тры разы большая, і іх здольнасць да анаэробнага акіслення метану, а таксама да іншых біялагічных функцый, такіх як выпрацоўка бялкоў, можа быць павялічана з дапамогай боргаў.

 Асаблівасці 
Яны былі выяўлены 8 сакавіка 2020 года Джыл Бэнфілд і яе калегамі. Структура геномаў боргаў захоўваецца і адрозніваецца ад плазмід і храмасом Methanoperedens, а таксама іншых геномаў архей. Боргі не валодаюць прыкметнымі белкамі, звязанымі з плазмідамі або вірусамі, локусамі рРНК, орыджынамі рэплікацыі або жыццёва важнымі генамі, якія звычайна сустракаюцца ў мініхрамасомах, таксама вядомых як мегаплазміды, архей. Выяўлена, што даўжыня геномаў боргаў складае ад 0,66 да 0,92 мегабаз, што перавышае даўжыню геному вядомых у цяперашні час вірусаў архей. Замест гэтага памер геномаў боргаў характэрны для эўкарыёт-спецыфічных двухланцуговых ДНК-вірусаў з тыпу Nucleocytoviricota, таксама вядомых як нуклеацытаплазматычныя вірусы вялікай ДНК (NCLDV), якія могуць перавышаць 2,5 Мбаз. Тандэмныя паслядоўнасці прамых паўтораў пераважаюць ва ўсім геноме Боргаў, а доўгія інвертаваныя паўторы знаходзяцца на канцах генома. Гэта адрозніваецца ад мегаплазмід некаторых бактэрый, якія нясуць прамежкавыя паўторы і звычайна не адказваюць за кадаванне неабходных генаў.

 Функцыі (спіс генаў) 
Ніжэй прыведзены некаторыя з вядомых генаў, якія кадуюцца геномамі боргаў:

Звярніце ўвагу, што не кожны геном борга змяшчае такія ж самыя гены.

 Мабільныя або пераносныя сістэмы абароны
 Анаэробнае акісленне метану (AOM)
 Сістэма CRISPR-Cas тыпу III-A (без магчымасці для збору спэйсераў і ў першую чаргу накіравана на РНК)
 RPL11 — рыбасомны бялок L11
 Гліказілтрансфераза
 Маніпуляцыі з ДНК і РНК
 Транспартныя гены
 Энергетычны абмен
 Бялкі клетачнай паверхні
 ПЭГА
 S-слой
 Бялкі, звязаныя з мембранай (невядомыя функцыі, якія, магчыма, уплываюць на ўласцівасці мембраны гаспадара)
 Фіксацыя азоту (аперон nifHDK)
 Сінтэз полігідраксіалканату (назапашванне вугляроду) — магчыма, выкарыстоўваецца пры недахопе рэсурсаў
 Бялкі ўстойлівасці да тэлуру
 FtsZ (гамолаг табуліну)
 Гены цыклу ТКК
 цытратсінтаза
 аканітаза
 cfbB і cfbC
 Каэнзім F420: L-глутаматлігаза — cofE
 Электронныя біфуркацыйныя комплексы
 D-лактатдэгідрагеназа
 Сінтэз тетрагідраметаноптэрына
 Бялкі ферэдаксіну
 5,6,7,8-тэтрагідраметаноптэрын гідраліаза (Fae) — удзельнічае ў дэтаксікацыі фармальдэгіду
 Дэгідрагеназа аксіду вугляроду (CODH)
 Пластацыянін
 Купрэдаксіны
 Мультыгемавыя цытахромы (MHC)

 Крыніцы 

Катэгорыя:ДНК
Катэгорыя:Мікрабіялогія