Аўтрон

Аўтрон — гэта нуклеатыдная паслядоўнасць на 5'-канцы першаснага транскрыпта гена, якая выдаляецца з дапамогай спецыяльнай формы РНК сплайсінгу падчас паспявання канчатковай мРНК. У той час як паслядоўнасці інтронаў знаходзяцца ўнутры гена, паслядоўнасці аўтронаў знаходзяцца па-за генам.

 Характарыстыка 
Аўтрон — гэта інтронападобная паслядоўнасць, якая валодае аналагічнымі характарыстыкамі, такімі як GC-састаў і акцэптарны сайт сплайсінгу, які з’яўляецца сігналам для транс-сплайсінгу. Такі сайт транс-сплайсінгу па сутнасці вызначаецца як акцэптарны (3') сайт зрошчвання без донарскага (5') сайта сплайсінгу вышэй па ланцугу.

У эўкарыёт, такіх як эўгленазоі, дынафлагеляты, губкі, нематоды, кнідарыі, грабневікі, плоскія чарвякі, ракападобныя, шчацінкавасківічныя, калаўроткі і тунікаты, даўжыня сплайсаваных лідарных (SL) аўтронаў вагаецца ад 30 да 102 нуклеатыдаў з экзонам SL даўжыня ад 16 да 51 нуклеатыда, а поўная даўжыня SL РНК — ад 46 да 141 нуклеатыда.

 Працэсінг 
Падчас стандартнага цыс-сплайсінгу патрабуецца донарскі сайт сплайсінгу ў верхнім становішчы (5') разам з акцэптарным сайтам, размешчаным у ніжнім становішчы (3') той жа малекулы прэ-РНК. Наадварот, транс-сплайсінг SL абапіраецца на 3'-акцэптарны сайт сплайсінгу на аўтроне і 5'-донарны сайт сплайсінгу (дынуклеатыд GU), размешчаны на другой малекуле РНК, SL РНК. Больш за тое, аўтрон першаснай мРНК утрымлівае адэназін у кропцы разгалінавання — за якім ідзе поліпірымідзінавы тракт, які ўзаемадзейнічае з інтронападобнай часткай SL РНК, утвараючы разгалінаваны Y-падобны пабочны прадукт, які нагадвае структуру ласо, утвораны падчас сплайсінгу інтронаў. Затым ядзерная бялковая машынерыя раздзяляе гэтую разгалінаваную структуру шляхам транс-сплайсінгу паслядоўнасці SL РНК да 3' транс-сплайсінгавага акцэптарнага сайта (AG дынуклеатыд) прэ-мРНК.

Калі аўтроны апрацоўваюцца, SL-экзон падвяргаецца транс-сплайсінгу ў асобныя няпарныя акцэптарныя сайты ніжэй, побач з кожнай адкрытай рамкай счытвання поліцыстроннай прэ-мРНК, што прыводзіць да асобных спелых кэпіраваных транскрыптаў.

 Гл. таксама 

 Экзон — Вобласць транскрыбіруемага гена, якая прысутнічае ў саставе канчатковай функцыянальнай малекуле мРНК
 Матрычная РНК — РНК, якая счытваецца рыбасомай дзеля прадукцыі бялка

 Спасылкі 

Катэгорыя:Экспрэсія генаў
Катэгорыя:Некадавальная ДНК
Катэгорыя:Сплайсінг РНК