سيل كوجنيشن

CellCognition هو إطار حاسوبي مجاني مفتوح المصدر لتحليل كمي لصور المجهر الفلوري عالي الإنتاجية ( التصوير الزمني ) في مجال المعلوماتية الحيوية للصور ومجهر الأنظمة.

يستخدم اطار CellCognition تقنيات معالجة الصور ، ورؤية الحاسوب ، والتعلم الآلي لتتبع الخلايا المفردة وتصنيف أشكالها.

وهذا يمكن من قياس التطور الزمني لاطوار الخلية، ونمذجة ديناميكيات الخلية، وإنشاء خريطة النمط الظاهري .  

 السمات 
يستخدم برنامج CellCognition مسارا حسابيا يتضمن تجزئة الصور ، واكتشاف الكائنات ، واستخراج الميزات ، والتصنيف الإحصائي ، وتتبع الخلايا الفردية بمرور الوقت، واكتشاف أنماط انتقال الفئات (مثل الخلايا التي تدخل الإنقسام المتساوي)، وتصحيح أخطاء التصنيف على تسميات الفئات باستخدام نموذج ماركوف المخفي . 

تمت كتابة البرنامج بلغة بايثون 2.7 وتتوفر الملفات التنفيذية لأنظمة ويندوز وماك أو إس إكس.

 تاريخ 
أصدر برنامج CellCognition (الإصدار 1.0.1) لأول مرة في ديسمبر 2009 من قِبل علماء من مختبر جيرليش ومجموعة بومان في المعهد الفدرالي السويسري للتكنولوجيا في زيورخ، ومختبر إيلنبرغ في مختبر البيولوجيا الجزيئية الأوروبي في هايدلبرغ.

بالنسبة لأحدث إصدار فهو 1.6.1، ويتولى مختبر جيرليش في معهد التكنولوجيا الحيوية الجزيئية تطوير البرنامج وصيانته.

 طلب 
استخدم CellCognition في الفحص القائم على RNAi ،  وتطبيقه في دراسة دورة الخلية الأساسية،  وتم توسيعه ليشمل النمذجة غير الخاضعة للإشراف. 

 المراجع 

تصنيف:برمجيات تستخدم رخصة جنو العمومية الصغرى
تصنيف:برمجيات حرة بلغة بايثون
تصنيف:كيمياء حيوية
تصنيف:علم الأحياء الخلوي
تصنيف:مجهرية
تصنيف:برمجيات رؤية حاسوبية