قاعدة الطرف الأميني

(L-ألانين).
قاعدة الطرف الأميني أو قاعدة الطرف   تصف تأثير الطرف الأميني لبروتين على سرعة تحلله Proteolyse .

 الخاصية 

يؤثر الطرف N الموجود في حمض أميني علي تحلله وتحلل البروتين. بتكوين البروتين تنشأ بروتينات جميع حقيقيات النوى أو البكتيريا القديمة Archaeen من ميثيونين كحمض أميني ابتدائي وبالتالي من فورميلميثيونين في البكتيريا. البروتينات الأخرى التي لها طرف أميني مختلف عن الميثيونين يمكنها التكون إما عن طريق التحلل البروتيني أو عن طريق نزع الميثيونين بواسطة محلل حمض أميني على أن يكون الحمض الأميني التالي: فالين، أو جليسين، أو برولين أو ألانين أو سيرين أو ثريونين أو سيستئين.S. M. Sriram, R. Banerjee, R. S. Kane, Y. T. Kwon: Multivalency-assisted control of intracellular signaling pathways: application for ubiquitin- dependent N-end rule pathway. In: Chem Biol. (2009), Band 16(2), S. 121–131. . ; . من بين تلك السبعة أحماض أمينية نجد السيستئين هو الذي يسبب تحللا سريعا للبروتين.

 اكتشاف القاعدة 

اكتشفت قاعدة الطرف الأميني من العالم «ألكسندر فارشافيكي» وفريق الباحثين العاملين معه في عام 1986.
والقاعدة تقول: أن الطرف اليميني لحمض أميني في بروتين يحدد عمر النصف (أي المعدل الزمني لتحلل نصف كمية بروتين معين). وتنطبق القاعدة على بروتينات البكتيريا القديمة وحقيقيات النوى، ولكن بسرعات مختلفة. ومع ذلك فهي تحدد بطريقة تقريبية نصف عمر البروتين، حيث أن الطرف N في أنواع مختلفة من الأحماض الأمينية تتسبب في تغييرات وحالات شاذة أحيانا، بينما قد يتغير تأثير حمض أميني من كائن حي إلى آخر.

 عمر النصف لأحماض أمينية ذات طرف أميني 

يعتمد عمر النصف على نوع الحمض الأميني وعلى الطرف N فيه. القائمة التالية تعطي بعض تلك أنصاف الأعمار لبروتينات تنتجها بكتيريا إشريكية قولونية وفطريات الخميرة.

تصغير|hochkant=1.7|مثال للنوع 1-Degron وله معلم بالأخضر α-حمض أميني L-Lysin و  معلمة بالأزرق '''</span> بقية سلسلة البروتين حتى الطرف C .

تصغير|hochkant=1.7|مثال للنوع 2-Degron وله معلم أخضر  α-حمض أميني ذو طرف أميني L-Phenylalanin''' ومعلمة بالأزرق بقية سلسلة البروتين (يمين).

 الفصيلة  أحماض أمينية عمر النصفإشريكية قولونية إشريكية قولونيةA. Varshavsky: The N-end rule pathway of protein degradation. In: Genes Cells. (1997), Band 2(1), S. 13–28. . PDF.  
 Arg, Lys, Phe, Leu, Trp, Tyr
 والآخرون: 2 min
 > 10 h فطريات الخميرة(فطريات الخميرة) Met, Gly, Ala, Ser, Thr, Val, Cys
 Pro
 Ile, Glu
 Tyr, Gln
 Leu, Phe, Trp, Asp, Asn, Lys, His
 Arg > 30 h
 5 h
 30 min
 10 min
 3 min
 2 min الثديياتD. K. Gonda et al.: Universality and Structure of the N-end Rule. In: Journal of Biological Chemistry (1989), Band 264:28, S. 16700–16712, . Val
 Met, Gly
 Pro, Ile
 Thr
 Leu
 Ala
 His
 Trp, Tyr
 Ser
 Asn
 Lys
 Cys
 Asp, Phe
 Glu, Arg
 Gln 100 h
 30 h
 20 h 
 7,2 h
 5,5 h
 4,4 h
 3,5 h
 2,8 h
 1,9 h
 1,4 h
 1,3 h
 1,2 h
 1,1 h
 1 h
 48 min

 المراجع 

 اقرأ أيضا 
 طرف أميني
 طرف كربوكسيلي
 بروتين اندماجي
 بروتين
 حمض نووي ريبوزي
 فالين
 حمض أميني

تصنيف:اصطناع حيوي للبروتين
تصنيف:تقانة حيوية
تصنيف:حمض نووي ريبوزي
تصنيف:علم الأحياء الجزيئي