Rc-o319病毒

Rc-o319病毒是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，在日本的角菊頭蝠中發現，於2020年11月發表，屬於SARS-CoV-2的演化支，全基因組核酸序列與SARS-CoV-2的相似度為81%，是該演化支中與SARS-CoV-2關係最遠的病毒株。此病毒是與SARS-CoV-2相關的完整病毒株序列中，首個在中國以外發現者，也是首個在中國以外的亞洲國家發現的完整SARSr-CoV病毒株序列。

發現
2013年，研究人員在日本岩手縣的一洞穴中捕獲四隻角菊頭蝠，初步分析其糞便樣本，發現其中含有乙型冠狀病毒屬病毒的RNA複製酶序列。2020年，研究人員完整定序了樣本中冠狀病毒的基因組，即為Rc-o319病毒。

病毒學
Rc-o319病毒在SARSr-CoV中屬於SARS-CoV-2的演化支，全基因組核酸序列與SARS-CoV-2的相似度約為81%，以全基因組序列、複製酶序列、刺突蛋白序列繪製的系統發生樹均顯示Rc-o319病毒位於該演化支的基部，是最早分支的病毒株。

Rc-o319病毒的刺突蛋白中與宿主受體結合的受體結合結構域（receptor binding domain, RBD）有一段長9個胺基酸的缺失，為此病毒所特有，且SARS-CoV-2的RBD中與人類細胞受體血管紧张素转化酶2（ACE2）結合所需的數個重要位點，Rc-o319大都與SARS-CoV-2對應不同胺基酸，顯示前者可能難以與人類的ACE2結合而造成感染。實驗（pseudotyping）結果顯示Rc-o319病毒只能與角菊頭蝠的ACE2結合造成感染，無法結合人類、馬鐵菊頭蝠與中華菊頭蝠的ACE2，可能尚無法跨越物種障礙而感染其他物種。

另外，有別於SARS-CoV與SARS-CoV-2除ACE2外，尚需跨膜丝氨酸蛋白酶2（TMPRSS2）切割病毒的刺突蛋白才能造成感染，Rc-o319病毒的感染則僅需ACE2，不需TMPRSS2。

演化樹

參考文獻

SARS相關冠狀病毒