CODEX

CODEX是CO-Detection by indEXing的縮寫（暫譯：索引協同檢測染色法），是一種新型態的高維度多工免疫組織化學染色法，由Akoya Biosciences公司所開發。

CODEX利用不同的抗體與DNA條形碼結合而成的複合體作為染色標記物，其DNA條形碼作為索引標籤，是由特殊的雙股寡核苷酸序列所組成，並以迭代的方式依次在不同標籤接上，達到與目標細胞高度專一性結合，同時幾乎無限制的高維度多工組織染色成像能力（實際上仍受限於儀器的速度與解析能力，目前約可產生40~50種不同抗體的組織染色影像）。

目的 
現已知腫瘤的生成、活動與其存在的腫瘤微環境密切相關，因此掌握分子細胞層級的作用機制以及患部細胞在空間上的關聯性對於癌症的治療將會是一大助益，例如：建構並了解與細胞外基質在空間上的互動關係對於的診斷至關重要。

一般用以觀察、研究細胞之間的表現形態之方法為免疫組織化學染色法，但傳統的免疫螢光染色因為自体荧光或非特異性染色等問題，難以使用超過4~5種。CODEX突破了此限制，能夠更精確地偵測目標細胞，以多工的方式取得多組高品質染色影像。

方法 
CODEX利用DNA結構利於分子標記的特性，將抗體與DNA條形碼複合而設計出不同的染色標記物，其DNA條形碼作為索引標籤，是由特殊的雙股寡核苷酸序列所組成，並以迭代的方式依序在索引標籤接上予以染色成像。

步驟 
 細胞表面抗原(分化簇)與混合著多種抗體的染色標記物起專一性免疫反應而接合。
 在每個索引階段，分別添加相對應的核甘酸與，負責索引的核甘酸會與雙股寡核苷酸序列上的索引位點接合，並讓亦接上。
 利用標準的熒光顯微鏡成像，並將洗掉，準備下一回合的索引。
2~3步驟如此往復，直到完成所有索引，便可得出多維染色影像(每一維都是一種染色的型態)。

應用 
CODEX能提供更完備、更準確的病理資訊給醫療人員、生物醫學研究者，有助建立疾病在單一細胞尺度下細胞與其所處環境的互動及表現情形，未來有望導入人工智慧執行資料分析與資料探勘，讓人類往精準醫學跨出一大步。

參考文獻

外部連結 
 CODEX官方網站

免疫組織化學
病理解剖學
染色法
流式細胞術