贝叶斯法

貝葉氏譜系分析（Bayesian inference of phylogeny）是根據已知的先驗機率推導後驗機率的似然函數，進而去預測最可能的系譜樹。隨著電腦計算速度的演進以及马尔科夫-蒙特卡洛法的演進，貝葉氏譜系分析越來越受重視和應用。贝叶斯推断時常應用於分子系統發生學以及系統分類學。

分析軟體列表
下表列出最常用的系譜分析軟體，有些不只使用貝葉氏譜系分析。

應用 
貝葉氏譜系分析在分子系統發生學上具有相當廣泛的應用，包含：

 系統發生學預測
 預測及評估未明祖源
祖徵演化
 祖源地域推論
 分子測年分析
 物種多樣化和滅絕的動力學模型
 傳染病擴散模型

參考文獻

外部連結
 MrBayes official website 
 BEAST official website 

貝氏推論
生物信息學
计算系统发生学