多重序列比對

多重序列比對（Multiple sequence alignment；MSA）是對三個以上的生物學序列（biological sequence），如蛋白質序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比對。一般來說，是輸入一組假定擁有演化關係的序列。從MSA的結果可推導出序列的同源性，而種系發生關係也可引導出這些序列共同的演化始祖。如右圖般的視覺化敘述可描繪出各種突變事件，例如點突變的單格變化，或是如刪除突變與插入突變，可使各個序列之間產生鴻溝。MSA常用來研究序列的保守性，或是蛋白質結構域的三級結構與二級結構，甚至是個別的氨基酸或核苷酸。

參見
親緣分支分類法
種系發生學
序列比對軟體
結構比對

外部連結
 ExPASy sequence alignment tools 
 Multiple Alignment Resource Page from the Virtual School of Natural Sciences
 Tools for Multiple Alignments from Pôle Bioinformatique Lyonnais
 Multiple sequence alignment lectures from the Max Planck Institute for Molecular Genetics

相關文獻 

生物信息學