擬桿菌門

擬桿菌門（Bacteroidota，旧名 Bacteroidetes）包括三大類細菌，即擬桿菌綱、黃桿菌綱、鞘脂桿菌綱。它們的相似性體現在核糖體16S RNA。

很多擬桿菌綱的細菌種類生活在人或者動物的腸道中，有些時候成爲病原菌。在糞便中，以細胞數目計，擬桿菌屬是主要微生物種類。

黃桿菌綱主要存在於水生環境中，也會在食物中存在。多數黃桿菌綱細菌對人無害，但腦膜膿毒性金黃桿菌(Chryseobacterium meningosepticum)可引起新生兒腦膜炎。黃桿菌綱還有一些嗜冷類群。

鞘脂桿菌綱重要類群爲噬胞菌屬(Cytophaga)，在海洋細菌中佔有較大比例，可以降解纖維素。

下级分类
 擬桿菌綱 Bacteroidia Krieg 2012
 噬几丁质菌纲 Chitinophagia Munoz et al. 2017
 噬纤维菌纲 Cytophagia Nakagawa 2012
 黃桿菌綱 Flavobacteriia Bernardet 2012
 腐败螺旋菌纲 Saprospiria Hahnke et al. 2018
 鞘脂桿菌綱 Sphingobacteriia Kämpfer 2012

參見 
 細菌分類表

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