Acidobacteria

Acidobacteria là một ngành vi khuẩn mới được đề xuất gần đây, với các thành viên của nó là đa dạng về mặt sinh lý học và có mặt ở nhiều nơi, đặc biệt là trong đất, nhưng lại chưa có đủ đại diện trong nuôi cấy.

Các thành viên của ngành này là đa dạng về mặt sinh lý học, một số loài là ái acid, và lần đầu tiên được công nhận như là một nhóm riêng lần đầu tiên năm 1997.
Loài đầu tiên của ngành này, Acidobacterium capsulatum, được phát hiện năm 1991. Các loài đáng chú ý khác có Holophaga foetida, Geothrix fermentans, Acanthopleuribacter pedis và Bryobacter aggregatus.
Do mới được phát hiện gần đây và phần lớn vẫn chưa được nuôi cấy nên sinh thái học và trao đổi chất của các loài vi khuẩn này vẫn chưa được hiểu rõ. Tuy nhiên, các vi khuẩn này có thể là các sinh vật có đóng góp quan trọng cho các hệ sinh thái, do chúng rất phổ biến trong các loại đất.

Cũng do môi trường sống là đất tự nhiên của chúng, nhóm chưa phân loại II của Acidobacteria đã từng bị nhận dạng như là tác nhân gây ô nhiễm các thuốc thử của bộ công cụ tách chiết ADN, điều có thể dẫn tới sự xuất hiện có sai sót của chúng trong các bộ dữ liệu quần thể vi sinh vật (microbiodidea) hay bộ gen học tổng thể (metagenomics).

Phát sinh chủng loài
Phân loại hiện tại được chấp nhận dựa theo Danh sách các tên gọi sinh vật nhân sơ với vị trí hiện tại trong danh pháp (LPSN)
và phát sinh chủng loài lấy theo LTP phiên bản 123 dựa trên ARN 16S ribosome của Dự án cây sự sống muôn loài.

Lưu ý:
♠ Các chủng tìm thấy tại  NCBI nhưng không được liệt kê trong Danh sách các tên gọi sinh vật nhân sơ với vị trí hiện tại trong danh pháp (LSPN)

Phân loại
 Chi ?Thermoanaerobaculum Losey et al. 2013
 Loài Thermoanaerobaculum aquaticum Losey et al. 2013
 Chi ?"Thermotomaculum" ♠ Izumi et al. 2012
 Loài "Thermotomaculum hydrothermale" ♠ Izumi et al. 2012
 Lớp Blastocatellia ♠ Pascual et al. 2015
 Chi Chloracidobacterium Tank & Bryant 2015 [Candidatus Chloracidobacterium Bryant et al. 2007]
 Loài Chloracidobacterium thermophilum Tank & Bryant 2015 [Candidatus Chloracidobacterium thermophilum Bryant et al. 2007]
 Chi Pyrinomonas Crowe et al. 2014
 Loài Pyrinomonas methylaliphatogenes Crowe et al. 2014
 Bộ "Blastocatellales" ♠ Pascual et al. 2015
 Họ "Blastocatellaceae" ♠ Pascual et al. 2015
 Chi Blastocatella Foesel et al. 2013 emend. Pascual et al. 2015
 Loài Blastocatella fastidiosa Foesel et al. 2013 emend. Pascual et al. 2015
 Chi Aridibacter Huber et al. 2014
 Loài A. famidurans Huber et al. 2014
 Loài A. kavangonensis Huber et al. 2014
 Chi "Stenotrophobacter" ♠ Pascual et al. 2015
 Loài "S. namibiensis" ♠ Pascual et al. 2015
 Loài "S. roseus" ♠ Pascual et al. 2015
 Loài "S. terrae" ♠ Pascual et al. 2015
 Chi "Tellurimicrobium" ♠ Pascual et al. 2015
 Loài "Tellurimicrobium multivorans" ♠ Pascual et al. 2015
 Lớp Holophagae Fukunaga et al. 2008
 Bộ Acanthopleuribacterales Fukunaga et al. 2008
 Họ Acanthopleuribacteraceae Fukunaga et al. 2008
 Chi Acanthopleuribacter Fukunaga et al. 2008
 Loài Acanthopleuribacter pedis Fukunaga et al. 2008
 Bộ Holophagales Fukunaga et al. 2008
 Họ Holophagaceae Fukunaga et al. 2008
 Chi Geothrix Coates et al. 1999
 Loài Geothrix fermentans Coates et al. 1999
 Chi Holophaga Liesack et al. 1995
 Loài Holophaga foetida Liesack et al. 1995
 Lớp Solibacteres
 Chi Bryobacter Kulichevskaya et al. 2010
 Loài Bryobacter aggregatus Kulichevskaya et al. 2010
 Chi Paludibaculum Kulichevskaya et al. 2014
 Loài Paludibaculum fermentans Kulichevskaya et al. 2014
 Bộ "Solibacterales"
 Họ "Solibacteraceae"
 Chi "Candidatus Solibacter" Ward et al. 2009
 Loài "Candidatus Solibacter usitatus" Ward et al. 2009
 Lớp Acidobacteria Cavalier-Smith 2002
 Bộ Acidobacteriales Cavalier-Smith 2002
 Họ Acidobacteriaceae
 Chi Acidicapsa Kulichevskaya et al. 2012
 Loài A. borealis Kulichevskaya et al. 2012 (loài điển hình)
 Loài A. ligni Kulichevskaya et al. 2012
 Chi Acidobacterium Kishimoto et al. 1991
 Loài Acidobacterium capsulatum Kishimoto et al. 1991
 Chi Acidopila Okamura et al. 2015 ["Acidopila" Okamura et al. 2011]
 Loài A. rosea Okamura et al. 2015 ["Acidopila rosea" Okamura et al. 2011]
 Loài A. dinghuensis Jiang et al. 2016
 Chi Bryocella Dedysh et al. 2012
 Loài Bryocella elongata Dedysh et al. 2012
 Chi Edaphobacter Koch et al. 2008
 Loài E. aggregans Koch et al. 2008 emend. Dedysh et al. 2012
 Loài E. dinghuensis Jiang et al. 2016
 Loài E. modestus Koch et al. 2008 (loài điển hình)
 Chi "Candidatus Koribacter" Ward et al. 2009
 Loài "Candidatus Koribacter versatilis" Ward et al. 2009
 Chi Occallatibacter Foesel et al. 2015
 Loài "O. riparius" ♠ 
 Loài O. savannae Foesel et al. 2015
 Chi "Silvibacterium bohemicum" ♠ Llado et al. 2016
 Loài "Silvibacterium bohemicum" ♠ Llado et al. 2016
 Chi "Terracidiphilus" ♠ Garcia-Fraile et al. 2016
 Loài "Terracidiphilus gabretensis" ♠ Garcia-Fraile et al. 2016
 Chi Terriglobus Eichorst et al. 2007
 Loài T. albidus Pascual et al. 2015
 Loài T. aquaticus Baik et al. 2013
 Loài T. roseus Eichorst et al. 2007 (loài điển hình)
 Loài T. saanensis Männistö et al. 2011
 Loài T. tenax Whang et al. 2014
 Chi Granulicella Pankratov& Dedysh 2010 emend. Männistö et al. 2012
 Loài G. arctica Männistö et al. 2012
 Loài G. cerasi Yamada et al. 2014
 Loài G. mallensis Männistö et al. 2012
 Loài G. sapmiensis Männistö et al. 2012
 Loài G. tundricola Männistö et al. 2012
 Loài G. paludicola Pankratov & Dedysh 2010 (loài điển hình)
 Loài G. pectinivorans Pankratov & Dedysh 2010
 Loài G. aggregans Pankratov & Dedysh 2010
 Loài G. rosea Pankratov & Dedysh 2010
 Chi Telmatobacter Pankratov & Dedysh 2012
 Loài Telmatobacter bradus Pankratov & Dedysh 2012

Tham khảo

Liên kết ngoài
 Acidobacteria bacterium Ellin345 Trang về bộ gen 
Dự án bộ gen Acidobacterium (từ Genomes OnLine Database)
Bài báo tại Science Daily
Bài báo tại Scientific American

Sinh vật ưa acid
 
Sinh vật theo cách thích nghi
Vi khuẩn
Acid
Dinh dưỡng và phát triển ở vi sinh vật
Khoa học môi trường
Vi sinh vật học
Địa chất học
Sinh học vũ trụ