Pirolizin

Pirolizin Pyl ya da O şeklinde kısaltılır.  Bu amino asit doğal olarak karşımıza çıkan genetik codlardan biri olup L-Lisinn’in türevlerindendir.

Pirolizin’in üç farlı sterogen merkezi vardır. Bunun anlamı yapısında bulunan karbon atomları dört farklı atom ya da molekülle bağ yapmıştır. Böylelikle sekiz izomeri bulunmaktadır.

Diğer birçok amino asitte olduğu gibi bu amino asitin hem L- hem de D- isomeri vardır. Aber aktiv olan diğer bir deyişle doğa var olan isomeri L- Pirolizin’dir. Bu yüzden bu yazıda ya da bilimsel makalelerde Pirolizin L- ya da D- olarak hiçbir ön ek almayarak sadece Pirolizin diye bahsedilmişse, burada bahse geçen L- Pirolizin’dir

Pirolizin’in yapısında bulunan yan zincirlere lipofil denir.

Pirolizin daha çok doğada bakteriler tarafından sentzlenir ve bir enzimin yapısının yapısal parçası olarak kullanılmaktadır. Bu enzimler baktirelerin Metan döngüsüne işlemi sırsında kullanmaktadır. Bu amino asit ortamda bulunan özel bir gen frenkasıyla modfiye edilmiş UAG-Stop kodon tarafından kodlanır. Böylelikle Pyrrolysyl -tRNA ‚nın Ribosoma bağlanmasını sağlamaktadır

Kaynakça

 Fournier, G. (2009): Horizontal gene transfer and the evolution of methanogenic pathways. In: Methods Mol Biol. 532; 163–179; PMID 19271184; doi:10.1007/978-1-60327-853-9_9
 Srinivasan, G. et al. (2002): Pyrrolysine encoded by UAG in Archaea: charging of a UAG-decoding specialized tRNA. In: Science. 296(5572), S. 1459–1462 PMID 12029131 doi:10.1126/science.1069588
 Hao, B. et al. (2002): A new UAG-encoded residue in the structure of a methanogen methyltransferase. In: Science. 296(5572), S. 1462–1466. PMID 12029132 doi:10.1126/science.1069556
 Fenske, C. et al. (2003): Wie eindeutig ist der genetische Code? In: Angewandte Chemie. 115(6), S. 626–630. doi:10.1002/ange.200390142

Amino asitler