Molekulárne vzory asociované s patogénom

Tieto molekuly sa môžu označovať ako malé molekulárne motívy konzervované v rámci triedy mikróbov. Sú rozpoznávané receptormi podobnými toll (TLR) a ďalšími receptormi rozpoznávajúce vzory (pattern recognition receptor, PRR) v rastlinách aj zvieratách. Veľké množstvo rôznych typov molekúl môže slúžiť ako molekulárne vzory asociované s patogénom (pathogen associated molecular pattern, PAMP), vrátane glykánov a glykokonjugátov.

PAMP aktivujú vrodené imunitné reakcie, ktoré chránia hostiteľa pred infekciou, identifikáciou niektorých konzervovaných molekúl. Bakteriálne lipopolysacharidy (LPS), endotoxíny nachádzajúce sa na bunkových membránach gramnegatívnych baktérií, sa považujú za prototypovú triedu PAMP. LPS sú špecificky rozpoznávané TLR4, rozpoznávacím receptorom vrodeného imunitného systému. Iné PAMP zahŕňajú bakteriálny bičík (rozpoznávaný TLR5), kyselinu lipoteichoovú z gram-pozitívnych baktérií (rozpoznávaných TLR2), peptidoglykán (rozpoznávaný TLR2)  a varianty nukleových kyselín normálne spojené s vírusmi, ako je dvojitá väzba. RNA (dsRNA), rozpoznávaná TLR3 alebo nemetylovanými CpG motívmi, rozpoznávaná TLR9. Hoci termín "PAMP" je relatívne nový, koncepcia, že molekuly odvodené z mikróbov musia byť detegované receptormi z mnohobunkových organizmov, bola udržiavaná po mnoho desaťročí a odkazy na "endotoxínový receptor" sa nachádzajú vo väčšine staršej literatúry. Rozpoznávanie PAMP pomocou PRR spúšťa aktiváciu niekoľkých signalizačných kaskád v hostiteľských imunitných bunkách, ako je stimulácia interferónov (IFN) alebo iných cytokínov.

PAMP 
Termín „PAMP“ bol kritizovaný na základe toho, že väčšina mikróbov, nielen patogénov, exprimuje zistené molekuly; preto bol navrhnutý termín molekulárny model spojený s mikróbom (MAMP). Signál virulencie schopný viazať sa na receptor patogénu v kombinácii s MAMP bol navrhnutý ako jeden spôsob, ako vytvoriť PAMP špecifický pre patogén. Rastová imunologia často považuje termíny „PAMP" a „MAMP" za zameniteľné, pričom ich uznanie je prvým krokom v imunite rastlín, PTI (imunita vyvolaná PAMP), relatívne slabá imunitná odpoveď, ktorá sa vyskytuje, keď hostiteľská rastlina tiež rozpoznáva patogénne efektory, ktoré ju poškodzujú alebo modulujú jej imunitnú reakciu.

Mykobakteriálne PAMPy 
Mykobaktérie sú intracelulárne baktérie, ktoré prežijú v hostiteľských makrofágoch. Mykobakteriálna stena je zložená z lipidov a polysacharidov a obsahuje aj veľký objem kyseliny mykolovej. Čisto zložky mykobaktérií bunkovej steny aktivujú hlavne TLR2 a tiež TLR4. Lipomannan a lipoarabinomannan sú silné imunomodulačné lipoglykány. TLR2 s pomocou TLR1 môže rozpoznať lipoproteín bunkovej steny, ktorý je antigénom Mycobacterium tuberculosis, ktorý je induktorom produkcie cytokínov makrofágmi. TLR9 môže byť aktivovaný mykobateriálnou DNA.

Referencie 

Imunitný systém