NOD like receptory

NOD like receptory (nucleotide-binding oligomerization domain-like receptors) sú rodina viac ako 20 rôznych cytosolických receptorov pre PAMP (deriváty z bakteriálnych stien, mikrobiálne toxíny, alebo celý mikrobiálny organizmus) a DAMP (extraelulárna ATP, hyalurón, kryštály močoviny), ktoré sa zúčastňujú signalizácie a tvorbe inflamazómu. Patria do prirodzenej imunity k tzv. PRR (pattern recognition receptors), ktoré sú nevyhnutné pre rozpoznanie antigénu. Sú exprimované v cytosole lymfocytov, makrofágov, dendritických buniek ale aj v ne-imunologických bunkách napríklad v epiteloch.

Štruktúra 
NLR obsahuju C-terminálnu doménu bohatú na leucín, prostredníctvom ktorej rozpoznávajú ligand, centrálnu NOD doménu, ktoré v ATP-závislej oligomerizácii viaže druhé NLR pri tvorbe oligomérov (self-oligomerizácia) a nakoniec N-terminálnu efektorovú doménu, ktorá interaguje s adaptorovými proteínmi. N-terminálna doména obsahuje aj CARD a PYD doménu, ktoré sú nevyhnutné na naviazanie pro-kaspázy 1.

Nomenklatúra a systém 
Sú rozdelené do 4 podrodín na základe povahy ich N-terminálnej domény. Tieto regióny môžu obsahovať:
 NLRA – obsahujú kyslú transaktivačnú doménu (AD), CIITA
 NLRB – obsahujú bakulovírusovú inhibičnú doménu (BIR), NAIP
 NLRC – obsahujú kaspázovú doménu (CARD), NOD1, NOD2,   NLRC3, NLRC4, NLRC 5
 NLRP – obsahujú pyrínovú doménu (PYD) NLRP1, NLRP2, NLRP3

Ďalšie delenie je na 3 rodiny na základe ich fylogenetického vývoja:
 NOD: NOD1, NOD2, NLRC3, NOD5, CIITA
 NLRP (NALP): NLRP1, NLRP2, NLRP3, NLRP5, NLRP10
 IPAF: IPAF (NLRC4), NAIP

Signalizácia 
NOD

NOD 1 a NOD2 sa viažu na membránu skorého endozómu v cytosole, špecificky interagujú s cytoskeletom aktínu, aby sa zachoval neaktívny stav. PGN transportované cez membránu a sú rozpoznané NOD receptormi. Táto interakcia vedie k self-oligomerizácii prostredníctvom CARD-CARD interakcie za použitia endozomálnej membrány ako lešenie. Oligomerizované NOD posielajú signál cez serín/threoninový receptor RIP2. Ten aktivuje TAK1, ktorý fosforyluje a aktivuje IkB kinázu, a tá následne fosforyluje inhibítor IkB, ktorý uvoľní NFkB a jeho jadrovú translokáciu a produkciu prozápalových cytokínov. Mutácie NOD2 sú spojené s Crohnovou chorobou a Blau syndrómom. Okrem rozpoznávania bakteriálnych komponentov, tieto receptory monitorujú cytoplazmatické prostredie, reagujú na poruchy cytoskeletu a ER stres,), ktoré vedú k autofágii. Ligandy, ktoré rozpoznávajú sú: N-acetylglukozamín, N-acetylmuramová kyselina, muramyl dipeptid.

NLRP

Proteíny tejto rodiny formujú multiproteínový komplex inflamazóm ako odpoveď na patofyziologické stimuly. Aktivácia inflamazómu je esenciálna súčasť prirodzenej imunity a jej odpovede na patogény a poškodené bunky. Inflamazóm (najčastejšie sa vyskytujúci a najväčší NLRP3) obsahuje NLR, adaptorový proteín ASC, ktorý obsahuje CARD a PYD doménu. Po rozpoznaní ligandu dôjde k oligomerizácii NLR proteínov prostredníctvom NOD domény. Následne sa na na PYD doménu NLRP3 naviaže PYD doména ASC doména, ktorá svojou CARD doménou viaže CARD doménu pro-kaspázy 1. Následné autoštiepenie pro-kaspázy 1 na jej aktívnu formu vedie k štiepeniu pro IL-1b a IL-18, ktoré sú potom uvoľnené z bunky ako leaderless proteíny a prispievajú k tvorbe zápalu. Ligandy rozpoznávané týmto proteínom su mikrobiálne toxíny (alfa toxiny), kvasinky, vírus chrípky

Referencie 

Receptory