SARS-CoV-2 Theta-varianten

SARS-CoV-2 Theta-varianten, før kjent som Lineage P.3 er en variant av SARS-CoV-2 som ble rapportert fra Filippinenes helsedepartement den 18. februar 2021.

Navn
Den 1. juni 2021 navngav Verdens helseorganisasjon (WHO) Lineage P.3 som Theta-varianten.

Bakgrunn, beskrivelse
På Filippinene ble det i februar 2021 bekreftet deteksjon av to mutasjoner av Covid-19 i Central Visayas (Cebu og omliggende øyer kjent som Region 7) etter at virusprøver fra pasienter ble genomsekvensert. Mutasjonene ble senere identifisert som E484K og N501Y, og var oppdaget i 37 av de 50 prøvene, med begge mutasjoner co-okkurrente i 29 av disse.

Den 13. mars 2021 bekreftet det filippinske Department of Health mutasjonene, og kalte varianten P.3. Samme dag bekreftet man også første funn av Lineage P.1 covid-19 - senere kalt SARS-CoV-2 Gamma-varianten - i landet. Selv om P.1 og P.3-variantene stammer fra samme linje (B.1.1.28), bekreftet departementet at  P.3-varianten synes å smitte lettere enn P.1-varianten. 

Filippinene hadde 98 kjente tilfeller av P.3 - Theta-varianten - per 13. mars 2021. 

E484K- og N501Y-mutasjoner finnes begge i «variants of concern» som de første funnet i England (Alfa-varianten), Sør-Afrika (Beta-varianten) og Brasil (Gamma-varianten), med begge de to mutasjonene i de to sistnevnte variantene.

E484K omtales noen ganger som en «escape mutation» (rømningsmutasjon) ettersom den synes å hjelpe viruset til å rømme unna kroppens immunsystem. Av denne grunn frykter noen forskere at varianter med E484K-mutasjonen kan føre til at vaksinene blir mindre effektive, selv om det samtidig fastholdes (mars 2021) at de da brukte vaksiner synes å gi vesentlig beskyttelse uansett om det dreier seg om slike varianter, og i særdeleshet mot særlig alvorlige tilfeller av covid-19.

Referanser

S08