SARS-CoV-2 Kappa-varianten

SARS-CoV-2 Kappa-varianten er en sublineær variant av SARS-CoV-2, viruset som forårsaker covid-19. Den er en av tre versjoner av Lineage B.1.617 som også kjent som Delta-varianten.

Beskrivelse
SARS-CoV-2 Kappa-varianten er også kjent som Lineage B.1.617.1 og ble først oppdaget i India i desember 2020. Mot slutten av mars 2021 stod Kappa-subvarianten for mer enn halve sekvensene som ble innrapportert fra India. Den 1. april 2021 ble den designert Variant Under Investigation (VUI-21APR-01) av Public Health England.

Mutasjoner
Kappa-varianten har tre betydningsfulle endringer i aminosyresekvensene, som alle gjelder virusets piggproteinkode. Disse er substitusjonene L452R, E484Q og P681R

E484Q. Denne mutasjonen i posisjon 484, en glutaminsyre-til-glutamin-substitusjon, gir B.1.617-varianten et sterkere bindingpotensial til hACE2 (den humane ACE2-reseptoren), og dessuten en større evne til å unngå immunsystemet det står overfor enn det andre varianter har. 
L452R. Denne mutasjonen i posisjon 452, en leucin-til-arginin-substitusjon, gir en sterkere affinitet i piggproteinet for ACE2-reseptoren og immunsystemets evne til å oppdage viruset svekkes. 
P681R. Denne mutasjonen i posisjon 681, en prolin-til-arginin-substitusjon, kan, ifølge William A. Haseltine, øke smittespredende evne på cellenivå (boost cell-level infectivity).

Disse mutasjonene er hver for seg ikke unike for varianten; det er at de er tilstede samtidig som er det unike.

European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) oppfører også en fjerde piggmutasjon av interesse: 
 D614G. Denne mutasjonen i posisjon 614 er slik at G (glycin) der har erstattet D (asparaginsyre). Varianter som har mutasjonen D614G knyttes til økt smitteevne.

Referanser 

S10