SARS-CoV-2 Gamma-varianten

SARS-CoV-2 Gamma-varianten, også kalt Lineage B.1.1.248, også kalt Brazil(ian) coronavirus variant, er en variant av SARS-CoV-2-viruset som forårsaker covid-19.

Navn
Den 1. juni 2021 navngav Verdens helseorganisasjon (WHO) B.1.1.248 som Gamma-varianten.

Bakgrunn, beskrivelse
Denne varianten av SARS-CoV-2 ble først oppdaget av Det nasjonale institutt for smittsomme sykdommer (NIID) i Japan den 6. januar 2021 i fire personer som var ankommet Tokyo etter å ha besøkt Amazonas i Brasil fire dager tidligere. Den brasilianske statsstyrte Oswaldo Cruz-stiftelsen har bekreftet at man tror varianten har versert i den brasilianske regnskogen, siden juli 2020.

Et preprint av en forskningsartikkel av Carolina M. Voloch et al. beskrev slektskap mellom brasilianske sekvenseringer i 2020 og identifiserte en ny linje SARS-CoV-2, 'B.1.1.248', i omløp i Brasil, som var utgått fra B.1.1.28. Den beskrives som fremstått i juli og først oppdaget av dem i oktober, men på publiseringstidspunktet (desember 2020), var det - skjønt etterhvert mye mer frekvent enn før - foreløpig mest å finne i Rio de Janeiro. I mai hadde deres funn for det meste vært av B.1.1.33 men i september var det betydelig spredning av B.1.1.28, og i oktober og november dominerte den nye variantlinjen (B.1.1.248) tre til fire ganger over andre klassifiseringer ved bruk av pangolinverktøy. Artikkelen identifiserer mutasjonen E484K (til stede i både B.1.1.28 og B.1.1.248) som «viden spredt» blant prøvene (for eksempel, 36 av de 38 prøvene i ett sett).

Mutasjoner 
Denne varianten av SARS-CoV-2 har 12 mutasjoner i sitt piggprotein, blant annet N501Y og E484K.

Deteksjon 
Isolat av den nye varianten overført til GISAID og gitt ID-spennet EPI_ISL_792680 til EPI_ISL_792683.

Statistikk

Referanser 

S03