하플로그룹 D (Y-DNA)

하플로그룹 D-CTS3946(Haplogroup D-CTS3946)는 인류 Y-염색체 DNA 하플로그룹의 일종이다. 현재로부터 약 64,700년 전에서 80,700년 전 사이, 혹은 72,700년 전에 아프리카로부터 유래한 것으로 보인다.

티베트, 일본, 안다만 제도에 분포가 집중되어 있으며, 일본인 중 약 33%, 아이누인 중 87% 이상이 하플로그룹 D-CTS3946 변이를 지니고 있다. 주요 분포 지역 사이에서는 거의 나타나지 않는 것이 특징적이나 중앙아시아 및 북아시아에서도 저빈도로 찾아진다. 한국인에게서도 4% 정도의 빈도로 나타나나 그 전래 경위에 관해서는 이론이 분분하다.

계통수 
ISOGG 2019 계통수(ver.14.151)

DE (YAP) 나이지리아, 기니비사우, 카리브 제도, 티베트
D (CTS3946) 중앙아시아, 동남아시아, 서아프리카, 서아시아, 동아시아
D1 (M174/Page30, IMS-JST021355) 중앙아시아, 대륙 동남아시아, 동아시아, 안다만 제도
D1a (CTS11577)
D1a1 (F6251/Z27276) 티베트, 러시아, 조지아
D1a1a (M15) 알타이 공화국, 일본, 중앙아시아, 안다만 제도, 몽골, 중국 대륙(묘족, 이족, 티베트인), 동남아시아
D1a1a1 (F849)
D1a1a1a (N1)
D1a1a1a1 (Z27269) 일본, 중국, 티베트
D1a1a1a1a (PH4979)
D1a1a1a1a1 (BY15119/Z29428)
D1a1a1a1a2 (F729)
D1a1a1a1a2a (F17412, MF10280) 티베트인(창두), 대만, 중국(쓰촨), 일본(오사카)
D1a1a1a1a2b (Y62194)
D1a1a1a1a2b1 (F17409) 티베트(창두), 중국(쓰촨)
D1a1a1a1a2b2 (Y62517)
D1a1a1a1a2b2a (F16077) 티베트(르카쩌, 산난, 라싸)
D1a1a1a1a2b2b (Y69263)
D1a1a1a1a2b2b1 (Y161914) 티베트(창두), 중국(저장)
D1a1a1a1a2b2b2 우즈베키스탄
D1a1a1a2 (Z31591) 티베트(르카쩌, 라싸)
D1a1a2 (F1070) 중국(광둥, 장쑤, 광시), 다이족(시솽반나), 싱가포르
D1a1b (P99)　티베트, 몽골, 중앙아시아, 알타이 공화국, 중국 대륙
D1a2 (Z3660)
D1a2a (M64.1/Page44.1, M55)   한국, 일본(야마토 민족, 류큐인, 아이누족)
D1a2a1 (M116.1)
D1a2a1a (M125)
D1a2a1a1 (P42)
D1a2a1a2 (IMS-JST022457) 일본 황실
 D1a2a1a3 (CTS10972) 일본(도쿄도), 중국(지린성)
D1a2a1b (P120)
D1a2a1c (CTS6609) 한국(충청남도), 일본(도쿄도)
D1a2a1c1 (Z1574) 일본(도쿄도)
D1a2a1c1a (CTS11032)
D1a2a1c1a1 (Z1527) 일본
D1a2a1c1a1a (CTS6909) 일본(도쿄도)
D1a2a1c1a1b (CTS3033) 일본(도치기현, 도쿄도)
D1a2a1c1a1c (Z30644)
D1a2a2 (CTS131)
D1a2a2a (CTS220)
D1a2a2b (CTS68) 일본(레분 섬)
D1a2b (Y34637)　안다만 제도
D1b (L1378)   필리핀(막탄 섬, 루손 섬)
D2 (A5580.2) 　나이지리아, 사우디아라비아(알 와즈흐), 아프리카계 미국인, 시리아

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각주 

인류 Y-DNA 하플로그룹