NELF

NELF（negative elongation factor）は、4つのサブユニット（NELF-A、NELF-B、NELF-C/NELF-D、NELF-E）からなるタンパク質複合体であり、転写開始部位（TSS）から約20–60ヌクレオチド下流でRNAポリメラーゼII（Pol II）を一時停止させることで、Pol IIによる転写に負の影響を及ぼす。

構造 
NELFは、NELF-A、NELF-B、NELF-C/NELF-D、NELF-Eの4つのサブユニットからなる複合体である。NELF-Aサブユニットは/WHSC2（Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 2）遺伝子にコードされる。NELF-BはそれまでCOBRA1（cofactor of BRCA1、現在では）として知られていた遺伝子にコードされるタンパク質と同一であることが明らかにされた。NELF-CとNELF-Dはどちらも同じ遺伝子（/TH1L）に由来し、選択的翻訳開始部位によってN末端が異なるタンパク質が産生される。NELF複合体にはNELF-CとNELF-Dのいずれか1つのみが存在し、両方が存在していることはない。NELF-Eは遺伝子にコードされ、RNA結合タンパク質である。

機能と相互作用 
NELFは核内に局在している。NELFは（DRB-sensitivity inducing factor）、Pol IIとともに安定な複合体を形成するが、いずれか一方のみと安定な複合体を形成することはない。NELFはDSIFの負の機能においても重要な因子である。NELFはDSIFとともに機能し、転写伸長期のPol IIの進行を低下させる。キイロショウジョウバエDrosophila melanogasterでは、NELFとDSIFによるプロモーター近位での一時停止によってHsp70遺伝子が影響を受けることが知られている。NELFはDSIFを補助して負の効果を増幅し、遺伝子発現制御をより強力なものとする。P-TEFb（positive transcription elongation factor b）は、Pol IIのC末端ドメインのセリン2番、そしてDSIFのサブユニットのリン酸化によってNELFの解離を引き起こし、Pol IIに対するNELFとDSIFの負の効果を阻害する。

その他の機構としては、NELFと（eRNA）の相互作用によってNELFがPol IIから解離し、生産的な転写伸長が引き起こされることが2つの最初期遺伝子での研究から示されている。

一方で、NELFとDSIFがどのような機構で機能しているのかは不明確である。NELFのホモログは一部の後生動物（昆虫や脊椎動物）に存在するが、植物、酵母、線虫では見つかっていない。

相互作用 
NELF-AはPol II複合体と相互作用する。

NELF-BはKIAA1191、NELF-E、BRCA1と相互作用する。

NELF-C/Dは、ARAF、PCF11、と相互作用する。

NELF-Eは、NELF-B、HIV TAR RNAと相互作用する。

NELFはin vitroで相分離を引き起こし、またin vivoで凝縮体を形成することが示されている。

臨床的意義 
NELFは、HIV-1の潜伏期に停止したPol IIに対するPCF11の組み込みに関与している可能性がある。NELFA遺伝子は短腕に位置しており、この領域の欠失が重要となるの表現型と関係している可能性がある。NELFによって制御されるPol IIの一時停止はBRCA1欠損乳腺上皮細胞におけるRループの蓄積の大きな要因となっており、腫瘍形成につながっている可能性がある。

出典 

タンパク質複合体
転写因子