Orbivirus

Orbivirus genus virus RNA untai ganda dalam famili Reoviridae dan subfamili Sedoreovirinae . Tidak seperti reovirus lainnya, orbivirus adalah arbovirus . Mereka dapat menginfeksi dan berkembang biak dalam berbagai macam arthropoda daninang vertebrata . Orbiviruses dinamai karakteristik berbentuk donat mereka capsomers ( orbis di Latin cincin berarti).

Banyak orbivirus ditularkan oleh kutu atau vektor serangga haematophagus ( Culicoides , nyamuk , dan lalat pasir ) dan memiliki kisaran inang yang luas yang meliputi sapi , kambing dan domba , ruminansia liar , equids , unta , marsupial , sloth , kelelawar , burung , anjing besar dan kucing karnivora , dan manusia .

Tiga orbivirus yang secara ekonomi paling penting adalah virus Bluetongue , virus penyakit kuda Afrika , dan virus penyakit hemoragik Epizootik , yang semuanya ditularkan oleh spesies Culicoides . Genus tersebut berisi 22 spesies dan setidaknya 130 serotipe yang berbeda.

Sejarah 
Pada 1719, virus penyakit kuda Afrika (AHSV) menyebabkan epidemi orbivirus besar pertama yang tercatat , membunuh 1.500 hewan. Wabah orbivirus yang paling signifikan secara historis terjadi pada tahun 1854-1855, ketika AHSV menginfeksi 70.000 kuda. AHSV ditemukan sebagai virus pada tahun 1900 dan penyakit bluetongue menyusul tak lama kemudian pada tahun 1905. Wabah telah terjadi secara sporadis pada abad ke-20 dan ke-21.

Ilmu pengetahuan virus

Struktur 
Tiga lapisan konsentris terdiri dari VP2 dan VP5 (kapsid luar), VP7 (lapisan perantara), dan VP3 (sub inti) yang dikarakterisasi virion virus bluetongue (diameter ~ 90 nm).

Viron adalah partikel tak terselubung yang berdiameter 70–80 nm. The virus partikel yang bulat dalam penampilan dan memiliki ikosahedral simetri.  Sebuah lapisan kapsid luar dan dalam mengelilingi genom , dan masing-masing memiliki simetri T = 13 dan T = 2. Viron dibangun dari dua cangkang protein konsentris, lapisan sub inti yang mengandung 120 salinan / partikel dari VP3 dan lapisan permukaan inti terdiri dari 780 salinan / partikel dari VP7. VP1, VP4, dan VP6 adalah protein enzimatik minor yang dikemas bersama dengan 10 segmen genom di dalam ruang pusat inti virus. Lapisan kapsid luar orbivirus terdiri dari dua protein struktural tambahan (VP2 dan VP5) yang memediasi perlekatan sel dan penetrasi selama permulaan infeksi. Protein kapsid luar lebih bervariasi daripada protein inti dan sebagian besar protein non-struktural dan spesifisitas reaksinya dengan antibodi penetral menentukan serotipe virus.

Genom 
Virus ini memiliki genom RNA untai ganda , sehingga diklasifikasikan sebagai virus Kelas III. Genom mereka linier dan tersegmentasi menjadi 10 segmen dengan berbagai panjang. Satu salinan dari setiap segmen gen dikemas per virion. Dalam kebanyakan kasus, setiap segmen gen mengkodekan satu kerangka pembacaan terbuka (ORF). Genom mengkodekan tujuh protein struktural utama (VP1-VP7) dan tiga protein nonstruktural utama (NS1-NS3). Pengecualian untuk satu gen-satu aturan protein adalah segmen 9 (Seg-9) dan segmen 10 (Seg-10), keduanya menyandikan dua protein yang hampir identik yang dimulai dari kodon AUG dalam fasa yang berdekatan di dekat ujung hulu (VP6 dan VP6a dikodekan oleh Seg-9: NS3 dan NS3a dikodekan oleh Seg-10).

ORF mencakup hampir seluruh panjang segmen genom 9 dan mengkode VP6 (virus helikase). ORF kedua (OrfX) juga terdapat pada segmen ini dan mengkode protein nonstruktural keempat (NS4), yang diprediksi dari analisis sekuens dari berbagai orbivirus termasuk segmen 9 dari virus Great Island yang mengandung ORF NS4 yang panjang (sekitar 21kDa). Keberadaan NS4 secara eksperimental dikonfirmasi pada orbivirus yang ditularkan melalui serangga dan ditularkan melalui kutu pada tahun 2011.

NS1 adalah protein paling melimpah di sel yang terinfeksi virus bluetongue . Ini membentuk tubulus yang mungkin terlibat dalam translokasi partikel virus keturunan ke membran sel. NS2 difosforilasi oleh kinase seluler dan merupakan protein matriks penting dari badan inklusi virus granular yang terbentuk di dalam sitoplasma sel yang terinfeksi. Badan inklusi virus ini bertindak sebagai pusat replikasi virus . The membran glikoproteinNS3 dan NS3a diekspresikan dalam jumlah besar dalam sel serangga, tetapi tidak dalam sel mamalia. Mereka terlibat dalam pelepasan partikel virus keturunan dari sel yang terinfeksi dan mungkin terlibat dalam penentuan kompetensi vektor dan virulensi .

Lingkaran kehidupan 
Banyak orbivirus yang secara istimewa menginfeksi sel endotel vaskular . Orbivirus memasuki sel inang melalui endositosis dan kapsid luar kemudian diangkat. Seluruh siklus replikasi virus terjadi di dalam sitoplasma sel inang . Transkripsi genom virus menjadi mRNA terjadi di dalam partikel inti dan mRNA diterjemahkan menjadi protein menggunakan ribosom sel inang . Protein virus disintesis 2-14 hari setelah infeksi awal. Viron baru berkumpul sendiri di dalam sitoplasma dan kemudian dilepaskan dari sel inang dengan cara bertunas. Selama proses tunas, mereka secara sementara memperoleh selubung lipid yang dapat dideteksi dalam waktu singkat setelah pelepasannya, tetapi ini kemudian hilang.

Patogenesis 
Orbivirus terutama menyebabkan penyakit pada hewan. Spesies Orbivirus yang berbeda memiliki kekhususan inang yang berbeda. Orbivirus adalah patogen yang ditularkan melalui vektor yang ditularkan antara inang vertebrata oleh vektor seperti nyamuk , pengusir hama , agas , lalat pasir , dan kutu . Virus Bluetongue (BTV) adalah Orbivirus yang menyebabkan penyakit bluetongue pada domba, sapi, kambing, dan hewan berkuku liar . BTV telah berada di garis depan studi molekuler selama tiga dekade terakhir dan sekarang mewakili salah satu virus yang paling dipahami di tingkat molekuler dan struktural. Spesies orbivirus lain bertanggung jawab atas penyakit hewan lain seperti penyakit kuda Afrika dan virus ensefalosis kuda

Taksonomi 

Genus Orbivirus berisi spesies berikut:

 Virus Penyakit kuda Afrika
 Virus Bluetongue
 Virus Changuinola
 Virus Chenuda
 Virus Chobar Gorge
 Virus Corriparta
 Virus penyakit hemoragik epizootik
 Virus ensefalosis kuda
 Virus Eubenangee
 Virus Great Island
 Virus Ieri
 Virus Lebombo
 Virus orungo
 virus palyam
 Virus penyakit kuda Peru
 Virus St Croix River
 Virus Umatilla
 Virus Wad Medani
 Virus Wallal
 Virus Warrego
 Virus Wongorr
 Orbivirus Yunnan

Serogrup 
Genus dibagi menjadi beberapa (setidaknya 14) serogrup .  Serogrup dibagi dalam beberapa kasus menjadi subkelompok. Sejumlah virus anggota belum ditugaskan ke serogrup. Serogrup dibedakan atas dasar perbedaan empat kali lipat atau lebih besar dalam tes berbasis antibodi . Tes ini termasuk ELISA dan tes fiksasi komplemen .

Orbivirus terdaftar berdasarkan serogrup

 Virus Lebombo
 virus pata
 Virus penyakit kuda Afrika (Serotipe 1–9)
 Virus penyakit kuda Afrika
 Virus bluetongue (serotipe 1–26)
 Serogrup Changuinola
 Virus Acatinga 
 Virus Altamira
 Virus Almeirim
 Virus Caninde
 Virus Changuinola
 Virus irituia
 Virus Jamanxi
 Virus jari
 Virus Gurupi
 Virus Monte Dourado
 Virus Ourem
 Virus Purus
 Virus Saraca
 Serogrup Corriparta
 Virus Acado
 Virus Corriparta
 Serogrup Eubenangee
 Virus Eubenangee
 Virus Tilligerry
 Serogrup penyakit hemoragik epizootik
 Virus penyakit hemoragik epizootik 1
 Virus penyakit hemoragik epizootik 2
 Virus Kawanabe
 Serogrup ensefalosis kuda
 Virus ensefalosis kuda
 Virus Great Island
 Virus Kemerovo
 Virus Essaouira
 Virus kala iris
 Mill Door / 79 virus
 Virus kelinci syncytium
 Virus Tribeč
 Virus Broadhaven
 Subkelompok Chenuda
 Subkelompok Wad Medani
 Virus orungo (serotipe 1-3)
 Serogrup Palyam
 Virus Abadina
 Virus Sungai Apies
 Virus Bunyip Creek
 Virus Chuzan (Kasba)
 Virus CSIRO Village
 Virus D'Aguilar
 Virus Marrakai
 Virus Petevo
 Virus Vellore
 Serogrup Umatilla
 Virus Llano Seco
 Virus kecil
 Virus Netivot
 Virus Umatilla
 Serogrup Wallal
 Virus Wallal
 Warrego serogroup
 Virus Sungai Mitchell
 Virus Warrego
 Serogrup Wongorr
 Virus Sungai Paroo
 Virus Picola
 Virus Wongorr

Grup vektorSunting 
Virus anggota ditularkan oleh pengusir hama ( Culicoides ), nyamuk , dan kutu . Virus yang ditularkan oleh jenis vektor tertentu umumnya terkait baik secara genetik maupun serologis.

Orbivirus terdaftar oleh kelompok vektor

Kelompok vektor yang berbeda:

Kelompok vektor midge 

 Virus penyakit kuda Afrika
 Virus Bluetongue
 Virus Chuzan
 Virus penyakit hemoragik epizootik
 Virus ensefalosis kuda
 Virus Eubenengee
 virus palyam
 Virus Wallal
 Virus Warrego

Kelompok vektor nyamuk 

 Virus Corriparta
 Virus penyakit kuda Peru
 Virus Wongorr
 Virus Umatilla
 Virus Yunnan

Grup vektor centang 

 Virus Broadhaven
 Virus Great Island
 Virus Kemerovo
 Virus Lipovnik
 Virus tribec

Vektor yang belum ditentukan 
Vektor virus sungai St Croix tidak diketahui dan berdasarkan urutan genomnya, virus ini tampaknya tidak berkelompok dengan kelompok vektor lainnya.

Catatan 
Kelompok centang mungkin merupakan leluhur dari kelompok lain

Virus