Daftar ibu kota di Jepang

Ibu kota prefektur adalah kota di mana pusat pemerintahan dan dewan prefektur berada.

Jepang 
Di Jepang, ibu kota prefektur secara resmi disebut . Selain istilah , digunakan juga ().

Daftar ibu kota prefektur Jepang

Non-ibu kota yang berbagi nama dengan prefektur mereka 
Dalam kebanyakan kasus, sebuah kota yang berbagi nama dengan prefekturnya adalah ibu kota prefektur. Namun, ada beberapa kota yang bukan ibu kota prefektu.
 Iwate, Prefektur Iwate
 Ibaraki, Prefektur Ibaraki
 Okinawa, Prefektur Okinawa
 Tochigi, Prefektur Tochigi
 Yamanashi, Prefektur Yamanashi

Ibu kota yang bukan kota/daerah metropolitan terbesar di prefektur mereka 
Yang dicetak miring adalah ibu kota prefektur, atau wilayah metropolitannya.

Catatan:
Populasi area metropolitan adalah pada tahun 2000.

Rujukan 

 Jepang, Prefektur
 ibu kota Prefektur