Geotrichum candidum

Geotrichum candidum merupakan organisme yang dapat ditemukan pada mikrobioma manusia, terutama pada kulit, dahak, dan feses yang ditemukan pada 25-30% spesimen. Organisme tersebut termasuk kedalam kelompok fungi yang umumnya dapat ditemukan di tanah dan dapat diisolasi di seluruh dunia.

G. candidum adalah agen yang dapat menyebabkan penyakit pada manusia berupa geotrichosis, kemudian penyakit busuk asam yang dapat menginfeksi buah-buahan seperti jeruk, tomat, wortel, dan sayuran. Organisme tersebut dapat mempengaruhi hasil panen buah durian, yaitu pada Durio graveolens.

G. candidum biasa digunakan secara luas dalam produksi produk susu termasuk keju seperti Camembert, Saint-Nectaire, Reblochon dan lain-lain. Selain itu, jamur tersebut juga dapat ditemukan dalam yogurt Nordik yang dikenal sebagai viili, berperan dalam menentukan tekstur dari suatu produk.

Sebuah studi pada tahun 2001 menunjukkan bahwa G. candidum mengonsumsi polikarbonat. Namun, efek dari hal tersebut belum diketahui.

Sejarah

Taksonomi 
Pada tahun 1809, genus Geotrichum dideskripsikan oleh Johann Heinrich Friedrich Link untuk mengakomodasi spesies G. candidum yang ditemukan pada daun yang membusuk. Sejak saat itu, lebih dari 130 taksa berhasil dideskripsikan dan diidentifikasi ke dalam genus tersebut serta diperoleh ratusan sinonim. Misalnya, G. candidum salah diklasifikasikan sebagai Oidium lactis berdasarkan banyak literatur awal. Spesies Geotrichum memiliki kemiripan dengan Trichosporon dan Protendomycopsis. Namun, Geotrichum merupakan afiliasi dari ascomycetous sedangkan yang terakhir adalah anggota kelompok Basidiomycota. Spesies Geotrichum juga terkadang salah diklasifikasikan sebagai anggota genus Dipodaskus yang tumbuh dengan cepat, memiliki hifa yang bercabang tidak teratur, lebar 10-14 μm dan memproduksi askus spora tunggal. Berbeda dengan Geotrichum, anggota genus Dipodascus tidak mempunyai percabangan yang dikotomis dari hifa perifer serta memiliki tingkat pertumbuhan yang umumnya kurang dari 3 mm per hari.

Filogeni 
Galactomyces candidus, sebelumnya dianggap kedalam kelompok takson yang berbeda, kemudian ditemukan tahap seksual dari G. candidum menggunakan metode berbasis urutan gen. Geotrichum candidum secara luas terdiri dari 3 klade, yaitu spesies G. candidum, G. clavatum dan G. fici, di mana ketiganya memiliki potensi sebagai patogen. Spesies Geotrichum dapat dibedakan dengan menggunakan analisis sekuens 18S rRNA atau dengan menggunakan daerah pengatur jarak yang ditranskripsi internal dari gen RNA ribosom inti.

Morfologi

Anamorf 
Dalam keadaan anamorf, G. candidum memiliki koloni yang tipis, menyebar, lembut, berwarna krem dan putih. G. candidum memiliki hifa yang tampak merayap, bersepta dan sebagian besar terendam. Hifa memiliki warna yang tampak hialin atau berpigmen ringan. Ketika hifa yang terbentuk berupa hifa aerial atau mengudara, ia berubah bentuk dari arthroconidia menjadi silinder atau berbentuk ellipsoidal. Klamidospora bersifat soliter, subglobose, dan terlahir dari hifa yang tidak terdiferensiasi. Blastoconidia terkadang berkembang pada hifa secara lateral. Konidia dapat tampak bersifat arthrosporous, terminal atau interkalar/kabisat, dan juga pada permukaan agar-agar tampak aerial. Konidia memiliki ukuran berkisar antara 4,8-12,5 μm x 2,4–2,5 μm.

Teleomorf 
G. candidum dianggap homotalik tetapi sebagian besar merupakan isolat steril. Reproduksi seksual pertama kali diamati pada strain yang diisolasi dari tanah di Puerto Rico. Jamur dapat menghasilkan askus berbentuk bulat yang mengandung askospora tunggal, berdinding tebal, tidak berinti, berbentuk bulat hingga oval dengan ukuran 6-7 μm kali 7–10 μm. Askospora memiliki dinding bagian dalam yang halus, sedangkan dinding luarnya berkerut. Septa dilubangi oleh mikrospora, dan disusun dalam struktur cincin. Pada tahap seksual, koloni dapat tumbuh lebih cepat dibandingkan dengan pada tahap aseksual. Koloni dapat tumbuh dengan kecepatan 5–7 mm setiap hari pada suhu  .

Pertumbuhan 
Geotrichum candidum membentuk koloni yang memiliki kemampuan tumbuh cepat. Koloni dapat tumbuh hingga memiliki diameter dengan ukuran 5-6 cm setelah 5 hari pada media berupa agar Sabouraud-glukosa, agar wort dan media sintetis. Secara mikroskopis, pertumbuhan ditandai dengan tumbuhnya hifa bercabang dikotomis yang menyerupai garpu di sepanjang tepi koloni. Rantai kondial berubah menjadi aerial, tegak dan memiliki ukuran 6–12 (−20) x 3–6 (−9) μm. Jamur dapat tumbuh pada berbagai buah seperti jeruk dan menyebabkan penyakit asam membusuk. Hal tersebut cenderung terjadi pada buah-buahan yang disimpan pada suhu  sehingga menyebabkan pembusukan. Konidia tidak berwarna dan memiliki lapisan berlendir. G. candidum terkadang dapat ditemukan pada usus manusia, feses, dahak dan pada kulit. Jamur tersebut dapat tumbuh di tanah, air, kotoran, berbagai substrat tanaman, adonan roti, sekam fermentasi, roti, susu dan produk susu. Pertumbuhan optimal dapat terjadi pada suhu  dengan kisaran pH 5,0–5,5. Rentang suhu dapat berubah tergantung pada permukaan tempat jamur tersebut tumbuh. Contohnya pada tumbuhan, suhu optimal berkisar antar . Sedangkan pada hewan, suhu optimal berkisar antara . Suhu maksimum untuk pertumbuhan berkisar antara . Jamur memerlukan nutrisi berupa sumber karbon untuk pertumbuhannya. Pertumbuhan dapat didukung oleh D-glukosa, D-manosa, D-xilosa, L-sorbosa, D-fruktosa, D-galaktosa, sukrosa, D-manitol, SorbitolD-sorbital, etanol dan gliserol. Keseimbangan nutrisi berupa karbon dan nitrogen memiliki peranan penting dalam tahap sporulasi.

Distribusi 
G. candidum sangat umum ditemukan di tanah dan telah diisolasi dari substrat di Kanada, Amerika Serikat, Inggris, Jerman, Austria, India, Afrika Selatan, Jepang, Brasil, dan Peru. Ia dapat berperan sebagai agen penyebab penyakit asam membusuk pada buah jeruk serta busuk dengan tekstur lunak dapat memiliki keterkaitan dengan bau buah yang di emisi kan. Jamur tersebut juga merupakan agen pembusukan pada produk pasca panen seperti melon, labu, dan mentimun. Jamur dapat berperan dalam pembusukan buah tomat saat disimpan pada rentang suhu .

Ini merupakan koloni alami yang dapat diperoleh dari produk susu tertentu terutama keju dan terkadang digunakan dan diinokulasi pada kulit di permukaan keju.

Kegunaan Komersial 
G. candidum dapat digunakan secara komersial dan diinokulasi dalam proses pembuatan keju. Kultur dapat dicampur dengan susu, air garam, atau disemprotkan pada permukaan keju. pH optimal untuk pembuatan keju berkisar antara 4,4 hingga 6,7. Pada tahap awal pematangan, jamur tumbuh hampir di seluruh permukaan keju. Jamur tersebut dapat ditemukan pada keju lunak seperti Camembert dan keju semi-keras seperti Saint-Nectaire dan Reblochon. Pada keju Camembert, jamur tumbuh pada bagian luar keju membentuk lapisan kulit yang tipis. Pada keju Saint-Marcellin, jamur bertanggung jawab dalam menentukan keseragaman, warna putih, dan lapisan beludru pada keju. Enzim lipase dan protease yang dihasilkan oleh G. candidum dapat melepaskan asam lemak dan peptida yang memberikan rasa yang khas pada keju. G. candidum dapat mengurangi rasa pahit pada keju melalui aktivitas aminopeptidase yang berperan dalam hidrolisis peptida hidrofobik dengan berat molekul yang rendah. Aminopeptidase dapat memberikan pengaruh terhadap aroma yang dihasilkan pada Norman Camembert tradisional. Jamur juga dapat menetralkan pH dadih dengan mengkatabolisme asam laktat yang dihasilkan oleh bakteri. G. candidum mempersiapkan keju untuk kolonisasi bakteri yang sensitif terhadap asam, seperti Brevibacterium. Jamur dapat menghambat pertumbuhan mikroba patogen, seperti Listeria monocytogenes. Strain G. candidum yang bersifat komersial tersedia untuk pematangan keju.

Lihat juga 

 Organisms breaking down plastic

Referensi 

Saccharomycetes
Penyakit pada hewan akibat fungi
Penyakit pada tumbuhan akibat fungi
Fungi
Keju