Wilayah pelayanan Gereja Kristen Jawa

Saat ini, Gereja Kristen Jawa terdiri atas 331 Jemaat, 527 Pepanthan (Pos Pelayanan) dan 32 Klasis yang meliputi:

Klasis Jakarta Bagian Barat 
 GKJ Nehemia Jakarta
 GKJ Ebenhaezer Jakarta
 GKJ Joglo Jakarta
 GKJ Grogol Jakarta
 GKJ Kanaan Jakarta
 GKJ Tangerang Banten
 Pepanthan Serpong
 GKJ Pamulang Banten
 GKJ Depok Jawa Barat
 GKJ Yeremia Depok Jawa Barat
 Pepanthan Sawangan
 GKJ Bumi Indah
 GKJ Serpong Banten

Klasis Jakarta Bagian Timur 
 GKJ Jakarta
 GKJ Tanjung Priok Jakarta
 Pepanthan Ancol
 GKJ Pangkalanjati Jakarta
 GKJ Gandaria Jakarta
 Pepanthan Cawang
 GKJ Bekasi Jawa Barat
 Pepanthan Wilayah Barat
Pepanthan Bekasi Selatan
 GKJ Pondok Gede Bekasi Jawa Barat
 GKJ Bekasi Timur Bekasi Jawa Barat
 Pepanthan Karawang
 GKJ Bambu Kuning Bekasi Jawa Barat
 GKJ Bogor Jawa Barat

Klasis Citanduy 
 GKJ Sidareja
 Pepanthan Tambaksari/Sidanegara
 Pepanthan Cipari
 Pepanthan Sindeh
 GKJ Kawunganten
 Pepanthan Kalijeruk
 GKJ Gandrungmangu
 Pepanthan Rawajaya
 GKJ Majenang
 GKJ Sih Rahmat Wanareja
 Pepanthan Meluwung
 GKJ Hosiana Patimuan
 GKJ Bandung Jawa Barat
 GKJ Bandung Selatan Jawa Barat
 GKJ Kiaracondong Bandung Jawa Barat
 GKJ Cimahi Jawa Barat
 GKJ Waringinsari Banjar Jawa Barat

Klasis Banyumas Utara 
 GKJ Banyumas
 GKJ Purwokerto
 Pepanthan Mersi
 Pepanthan Kradenan
 Pepanthan Jatilawang
 Pepanthan Karanggintung
 Pepanthan Gumelar
 GKJ Purwojerto Barat
 Pepanthan Kaliputih
 GKJ Sokaraja
 GKJ Arcawinangun
 Pepanthan Karangnanas
 GKJ Purbalingga
 Pepanthan Purwosari
 Pepanthan Muntang
 GKJ Pengalusan
 GKJ Penaruban
 Pepanthan Kejobong
 GKJ Banjarnegara
 Pepanthan Plipiran
 GKJ Klampok
 Pepanthan Blarak
 Pepanthan Derik
 GKJ Getsemani Kertayasa

Klasis Banyumas Selatan 
 GKJ Bangsa
 GKJ Karanggedang
 Pepanthan Tambak
 Pepanthan Sumpiuh
 GKJ Aku Iki Pepadhanging Jagad Cilacap
 GKJ Cilacap Utara
 GKJ Kroya
 Pepanthan Gading
 Pepanthan Kedawung
 GKJ Bangkal
 Pepanthan Ayam Alas
 Pepanthan Pucung Kidul
 GKJ Adireja-Adipala
 Pepanthan Karangwangkal
 Pepanthan Penggalang
 GKJ Sih Rahmat Pesawahan
 GKJ Margi Rahayu Jeruklegi

Klasis Pekalongan Barat 
 GKJ Tegal
 Pepanthan Muarareja
 GKJ Mejasem
 GKJ Slawi
 Pepanthan Prupuk
 GKJ Brebes
 Pepanthan Jatibarang
 Pepanthan Tanjung
 GKJ Pemalang
 Pepanthan Jebed
 Pepanthan Sokawangi
 Pepanthan Kendalrejo
 GKJ Moga

Klasis Pekalongan 
 GKJ Pekalongan
 Pepanthan Kaligawe
 Pepanthan Comal
 GKJ Purbo
 GKJ Kasimpar
 Pepanthan Tembelan
 GKJ Immanuel Karanganyar
 GKJ Batang
 GKJ Limpung
 Pepanthan Subah
 GKJ Bandar
 GKJ Bawang

Klasis Kebumen 
 GKJ Kebumen
 Pepanthan Giritirto
 Pepanthan Pakuran
 Pepanthan Krakal
 Pepanthan Kedungwinangun
 Pepanthan Wonosari
 Pepanthan Banjurpasar
 GKJ Imanuel Kebumen
 GKJ Karanglonggong
 GKJ Grujugan
 GKJ Tunjungseto
 GKJ Tengahan
 GKJ Menara Kasih Sruweng
 GKJ Gombong
 Pepanthan Gunungmujil
 GKJ Prembun
 Pepanthan Bonjok
 Pepanthan Rowo
 GKJ Karanganyar
 GKJ Karanggadung
 GKJ Kutowinangun
 Pepanthan Pagedangan
 Pepanthan Legok
 GKJ Sikayu
 Pepanthan Adiwarno
 Pepanthan Pasir
 GKJ Bumiagung
 GKJ Pengaringan

Klasis Purworejo 
 GKJ Purworejo
 Pepanthan Kenteng
 Pepanthan Seren
 GKJ Purworejo Selatan
 GKJ Jatirejo
 Pepanthan Durensari
 GKJ Sidorejo
 GKJ Kutoarjo
 Pepanthan Banyuurip
 Pepanthan Ulap-ulap
 Pepanthan Tegalsari
 Pepanthan Purwosari
 GKJ Karangjoso
 GKJ Tlepok
 GKJ Jenar-Geparang
 Pepanthan Kuwukan
 Pepanthan Geparang
 GKJ Pituruh
 GKJ Bener
 GKJ Kaligesing

Klasis Sindoro-Sumbing 
 GKJ Temanggung
 Pepanthan Kaloran
 Pepanthan Kandangan
 Pepanthan Ngraho
 Pepanthan Kedu
 GKJ Jumo
 GKJ Kertosari
 GKJ Tirta Wening Parakan
 GKJ Ngadirejo
 GKJ Kranggan
 GKJ Bukit Sion Kranggan
 Pepanthan Bodehan
 Pepanthan Kemiri
 GKJ Traji
 GKJ Candiroto
 GKJ Sindoro
 Pepanthan Mranggen Kidul
 GKJ Wonosobo
 Pepanthan Kejajar
 Pepanthan Kaliwiro
 Pepanthan Ngalian
 Pepanthan Wadaslintang
 GKJ Wonosobo Timur
 Pepanthan Merapi Mulyo
 Pepanthan Kyuni
 Pepanthan Jatialit
 Pepanthan Kalikajar
 Pepanthan Kertek
 Pepanthan Kalicecep
 Pepanthan Reco
 GKJ Bendungan
 Pepanthan Kalimade
 Pepanthan Bumitirto
 Pepanthan Mangunrejo
 Pepanthan Balekambang
 Pepanthan Banjaran
 Pepanthan Kecis
 Pepanthan Kacepit
 GKJ Jonggolsari
 Pepanthan Leksono
 Pepanthan Welahan
 Pepanthan Keseneng
 Pepanthan Prumasan

Klasis Magelang 
 GKJ Magelang
 Pepanthan Kiringan
 Pepanthan Nambangan
 Pepanthan Glagah Ombo
 Pepanthan Trisip
 Pepanthan Kalinegoro
 GKJ Muntilan
 Pepanthan Jamblangan
 Pepanthan Sirahan
 Pepanthan Dondongan
 Pepanthan Kapuhan
 Pepanthan Bengan
 GKJ Bono
 GKJ Ngablak
 GKJ Mertoyudan
 Pepanthan Podosoko
 Pepanthan Blondo
 Pepanthan Dogaten
 GKJ Plengkung
 GKJ Grabag Merbabu
 GKJ Secang
 Pepanthan Kepatran
 GKJ Salaman
 GKJ Gumuk
 GKJ Kenalan

Klasis Semarang Barat 
 GKJ Semarang Barat
 GKJ Karangayu Semarang
 Pepanthan Ringintelu
 Pepanthan Dawung
 GKJ Bulu Lor Semarang
 GKJ Krapyak Semarang
 GKJ Jatingaleh Semarang
 GKJ Sampangan Kradenan Semarang
 Pepanthan Karangkumpul
 GKI Mijen Semarang
 Pepanthan Gempol
 Pepanthan Ngesrep
 GKJ Kalilangse Semarang
 GKJ Ngaliyan Semarang
 GKJ Kendal
 Pepanthan Kartika Jaya
 Pepanthan Siklayu-Bendosari
 Pepanthan Sono Tejorejo
 GKJ Sukorejo
 GKJ Kaliwungu
 GKJ Boja
 Pepanthan Kalirejo

Klasis Semarang Timur 
 GKJ Semarang Timur
 Pepanthan Sawah
 GKJ Genuk Semarang
 GKJ Wisma Panunggal Mrican Semarang
 GKJ Kabluk Semarang
 GKJ Tlogosari Semarang
 GKJ Demak
 Pepanthan Cabean
 Pepanthan Bolo Bango
 Pepanthan Mojosimo
 GKJ Puri Asih Demak
 GKJ Mranggen
 Pepanthan Bumirejo
 GKJ Kudus
 Pepanthan Bondo-Jepara

Klasis Semarang Selatan 
 GKJ Banyumanik Semarang
 GKJ Kramas Semarang
 GKJ Ngesrep Semarang
 GKJ Wisma Anugerah Candi Semarang
 GKJ Kertanegara Semarang
 GKJ Wisma Kasih Mangunharjo Semarang
 GKJ Ungaran
 Pepanthan Ngempo
 Pepanthan Setro
 Pepanthan Glepung
 Pepanthan Dampu
 GKJ Immanuel Ungaran
 GKJ Ngempon

Klasis Salatiga Bagian Utara 
 GKJ Salatiga
 Pepanthan Gedong
 Pepanthan Kayuwangi
 GKJ Salatiga Utara
 GKJ Ambarawa
 Pepanthan Banyubiru
 GKJ Ngampin Ambarawa
 Pepanthan Tambak Sela
 Pepanthan Jangglengan
 Pepanthan Baran
 GKJ Bandungan Ambarawa
 Pepanthan Sumowono
 GKJ Tuntang Barat
 Pepanthan Celengan
 Pepanthan Delik
 Pepanthan Glendang
 Pepanthan Kesongo
 GKJ Tuntang Timur
 GKJ Tlogo
 GKJ Bringin

Klasis Salatiga Bagian Selatan 
 GKJ Salatiga Timur
 Pepanthan Nyamat
 Pepanthan Karanggondang
 Pepanthan Glawang
 Pepanthan Gombang Setro
 GKJ Salatiga Selatan
 Pepanthan Sruwen
 Pepanthan Pranggen
 Pepanthan Ngasinan
 GKJ Sidomukti Salatiga
 Pepanthan Kenteng
 GKJ Karangalit Salatiga
 GKJ Randuares Salatiga
 GKJ Argomulyo Salatiga
 GKJ Menara Kasih Salatiga
 GKJ Salib Putih Salatiga
 Pepanthan Warak
 Pepanthan Pandanan
 GKJ Susukan

Klasis Purwodadi 
 GKJ Purwodadi
 Pepanthan Pulorejo
 Pepanthan Nggalan
 Pepanthan Cingkrong
 Pepanthan Piyak
 Pepanthan Depok
 Pepanthan Tunggak
 Pepanthan Nambuhan
 Pepanthan Mlowo
 Pepanthan Jambon
 Pepanthan Ngori
 GKJ Grobogan
 GKJ Kradenan
 Pepanthan Kuwu
 Pepanthan Tuku
 Pepanthan Pakis
 Pepanthan Rejosari
 GKJ Wolo
 Pepanthan Godong
 Pepanthan Toko
 Pepanthan Sedadi
 GKJ Kaliceret
 Pepanthan Kedungjati
 Pepanthan Ringinpitu
 Pepanthan Penadaran
 GKJ Mijen
 Pepanthan Pahesan
 GKJ Wirosari
 Pepanthan Kropak
 Pepanthan Pondok
 Pepanthan Sambirejo
 Pepanthan Karanggetas
 GKJ Ngaringan
 Pepanthan Kedungkendil
 Pepanthan Tanjungharjo
 Pepanthan Sumberagung
 Pepanthan Sendangrejo
 Pepanthan Dorosemi
 GKJ Gabus-Sulursari
 Pepanthan Gabus
 Pepanthan Pandanharum
 Pepanthan Karangpung
 GKJ Juwangi
 Pepanthan Karangrayung
 Pepanthan Tlawah Welehan
 Pepanthan Karangsono
 GKJ Gundih
 Pepanthan Tapen
 Pepanthan Rambat
 Pepanthan Keceme
 GKJ Wisma Nugraha
 Pepanthan Karangpasar
 Pepanthan Mangunsari
 Pepanthan Pundenarum
 Pepanthan Tlogorejo
 Pepanthan Sumengko
 GKJ Sodo
 Pepanthan Kuniran
 Pepanthan Dempel
 Pepanthan Karangasem
 GKJ Tempurung-Gubug
 GKJ Karangsari

Klasis Sala 
 GKJ Margoyudan Solo
 GKJ Joyodiningratan Solo
 GKJ Nusukan Solo
 GKJ Gandekan Sala TImur Solo
 Pepanthan Graha Manunggal
 Pepanthan Losari
 GKJ Danukusuman Solo
 GKJ Blibisluhur Solo
 Pepanthan Gulon
 Pepanthan Sekip
 GKJ Cakraningratan Solo
 Pepanthan Cemani
 GKJ Wisma Panembah Solo
 GKJ Mojosongo Solo
 GKJ Immanuel Solo
 GKJ Jebres Solo
 GKJ Petoran Solo
 GKJ Dagen-Palur Karanganyar
 GKJ Selokaton
 Pepanthan Ngamban
 Pepanthan Gemolong

Klasis Kartasura 
 GKJ Kartasura
 Pepanthan Purwogondo
 GKJ Pajang-Makamhaji
 GKJ Gebyog
 GKJ Gatak
 GKJ Sabda Winedhar Karanganyar
 GKJ Plaur Boyolali
 GKJ Manahan Solo
 Pepanthan Blulukan
 Pepanthan Tohudan
 GKJ Sumber Solo

Klasis Boyolali 
 GKJ Boyolali
 Pepanthan Sunggingan
 Pepanthan Teras
 Pepanthan Musuk
 Pepanthan Paras
 Pepanthan Cepogo
 Pepanthan Selo
 Pepanthan Sangen
 Pepanthan Jemowo
 GKJ Simo
 Pepanthan Karanggede
 Pepanthan Andong
 GKJ Pengging
 Pepanthan Slanggen
 Pepanthan Banyudono
 Pepanthan Trayu
 GKJ Ampel
 Pepanthan Berdug
 Pepanthan Kentheng
 GKJ Welar
 GKJ Sabda Mulya Sukoharjo
 Pepanthan Denggungan
 Pepanthan Panasan Baru
 GKJ Cipta Wening
 GKJ Kerten Solo
 Pepanthan Sanggrahan
 Pepanthan Kaliwingko
 GKJ Karangasem Solo

Klasis Sukoharjo 
 GKJ Sukoharjo
 Pepanthan Banmati
 Pepanthan Bulakan
 Pepanthan Bendosari
 GKJ Baki
 Pepanthan Daleman
 Pepanthan Kingkang
 GKJ Grogol-Sukoharjo
 GKJ Kronelan
 GKJ Nguter
 Pepanthan Begajah
 Pepanthan Jangglengan
 Pepanthan Serut
 GKJ Bulu-Sukoharjo

Klasis Wonogiri 
 GKJ Wonogiri
 Pepanthan Pokoh Kidul
 Pepanthan Timang
 Pepanthan Mento
 Pepanthan Jatisobo
 GKJ Wonogiri Utara
 Pepanthan Gemantar
 Pepanthan Gegeran
 Pepanthan Tandon
 GKJ Wuryantoro
 Pepanthan Mojopuro
 Pepanthan Salak
 Pepanthan Banaran
 Pepanthan Pule
 Pepanthan Tejosari
 GKJ Slogohimo
 Pepanthan Jatisrono
 Pepanthan Jatiroto
 GKJ Baturetno
 Pepanthan Beji
 Pepanthan Kudi
 Pepanthan Tirtomoyo
 Pepanthan Kedungrejo
 Pepanthan Giriwoyo
 Pepanthan Giribelah
 Pepanthan Ture
 GKJ Purwantoro
 Pepanthan Purwantoro
 Pepanthan Adiyuswa
 Pepanthan Kismantoro
 Pepanthan Bulukerto
 Pepanthan Randusari
 Pepanthan Gondopolo
 Pepanthan Golo
 GKJ Girikinasih
 Pepanthan Sidoharjo
 Pepanthan Paseban
 Pepanthan Gernawang
 Pepanthan Simpar
 GKJ Eka Kapti
 GKJ Bahtera Kasih Eromoko

Klasis Lawu-Karanganyar 
 GKJ Karanganyar
 GKJ Tawangmangu
 GKJ Kismorejo
 Pepanthan Papahan
 Pepanthan Tasikmadu
 GKJ Kerjo
 Pepanthan Mojokerto
 Pepanthan Mojogedang
 Pepanthan Kaliboto
 GKJ Harjosari
 GKJ Manunggal
 GKJ Kebakkramat
 GKJ Bekonang

Klasis Klaten Barat 
 GKJ Prambanan
 Pepanthan Pule
 Pepanthan Pereng
 GKJ Gondangwinangun
 Pepanthan Nganten
 Pepanthan Sumber Bakung
 Pepanthan Gumul
 GKJ Wedi
 Pepanthan Wedi
 Pepanthan Birit
 Pepanthan Bayat
 Pepanthan Margorejo
 Pepanthan Mawen
 GKJ Kebonarum
 Pepanthan Krosok
 Pepanthan Ngrundul
 Pepanthan Pluneng
 Pepanthan Prayan
 GKJ Manisrenggo
 Pepanthan Remeng
 Pepanthan Tegalsari
 GKJ Karangnongko
 Pepanthan Blimbing
 Pepanthan Somokaton
 Pepanthan Pijenan
 Pepanthan Karangkembang
 GKJ Gantiwarno
 Pepanthan Mutihan
 Pepanthan Dawung
 Pepanthan Panggil

Klasis Klaten Timur 
 GKJ Klaten
 Pepanthan Bareng
 Pepanthan Tegalyoso
 GKJ Wonosari Klaten
 Pepanthan Sekaran
 GKJ Delanggu
 Pepanthan Sanggung
 Pepanthan Manjung
 Pepanthan Daleman
 GKJ Pedan
 GKJ Ketandan
 GKJ Ceper
 Pepanthan Wates
 Pepanthan Jambukidul
 GKJ Karangdowo
 Pepanthan Tambak
 Pepanthan Ngolodono
 Pepanthan Karangtalun
 GKJ Gayamprit
 GKJ Jatinom
 Pepanthan Jatinom
 Pepanthan Karanganom
 Pepanthan Polanharjo
 Pepanthan Kemiri
 GKJ Gumulan
 Pepanthan Jomboran
 GKJ Trucuk
 GKJ Cawas
 Pepanthan Burikan
 Pepanthan Bogor
 Pepanthan Japanan
 GKJ Juwiring
 Pepanthan Gunting
 GKJ Jonggrangan

Klasis Sragen 
 GKJ Sragen
 GKJ Gondang
 Pepanthan Ringinharjo
 Pepanthan Piji
 Pepanthan Bangoan
 GKJ Taman Asri
 Pepanthan Jagan
 Pepanthan Mojorejo
 Pepanthan Gandil-Talang
 GKJ Sambirejo
 Pepanthan Jatianom
 Pepanthan Pelang
 Pepanthan Menjing
 GKJ Sidomulyo
 GKJ Gambiran
 Pepanthan Masaran
 Pepanthan Karang Tengah
 GKJ Jagan
 Pepanthan Jagan
 GKJ Tanon
 Pepanthan Baleharjo
 Pepanthan Mondokan
 Pepanthan Padas
 Pepanthan Plupuh
 Pepanthan Sumberlawang
 Pepanthan Tenggak
 GKJ Jambangan
 Pepanthan Jambangan
 Pepanthan Tawangsari
 Pepanthan Wonokerso
 Pepanthan Mojokerto
 GKJ Jatisumo
 Pepanthan Jenar
 Pepanthan Ngombo
 GKJ Jambeyan
 Pepanthan Basan
 Pepanthan Sambungblader
 GKJ Jenawi Karanganyar
 Pepanthan Jambon
 Pepanthan Menjing
 Pepanthan Seloromo
 Pepanthan Balong
 Pepanthan Sumbersari

Klasis Blora-Bojonegoro 
 GKJ Blora
 Pepanthan Tambaksari
 Pepanthan Gagaan
 Pepanthan Kunduran
 Pepanthan Jepon
 Pepanthan Ngawen
 GKJ Cepu
 Pepanthan Ngraho
 Pepanthan Sambeng
 Pepanthan Sambong
 Pepanthan Sorogo
 Pepanthan Gadu
 GKJ Randublatung
 Pepanthan Mulyorejo
 Pepanthan Menden
 GKJ Pulo Kedungtuban
 Pepanthan Betekan
 Pepanthan Kapuan
 GKJ Japah
 Pepanthan Gabeng
 GKJ Rembang
 Pepanthan Sudan
 Pepanthan Kragan
 Pepanthan Segoromulyo
 Pepanthan Pamotan
 GKJ Lasem
 Pepanthan Sale
 Pepanthan Gepuro
 GKJ Tuban Jawa Timur
 Pepanthan Leran
 Pepanthan Semanding
 Pepanthan Rengal-Loko
 GKJ Singgahan Jawa Timur

Klasis Yogyakarta Barat 
 GKJ Wirobrajan Yogyakarta
 Pepanthan Gedongkiwo
 GKJ Jatimulyo Yogyakarta
 Pepanthan Gondolayu
 Pepanthan Mlati
 GKJ Medari Sleman
 Pepanthan Cebongan
 Pepanthan Tempel
 Pepanthan Japanan
 Pepanthan Mancasan
 GKJ Rewulu
 Pepanthan Godean
 Pepanthan Sumber Gamol
 Pepanthan Gamping
 Pepanthan Gancahan VIII
 GKJ Kebonagung
 GKJ Ngento-ento
 GKJ Demakijo
 Pepanthan Sanggrahan
 GKJ Sedayu Bantul
 Pepanthan Sengon
 Pepanthan Sungapan
 Pepanthan Kaliurang

Klasis Yogyakarta Utara 
 GKJ Samirono Baru Yogyakarta
 GKJ Condongcatur Sleman
 GKJ Maguwoharjo
 GKJ Tanjungtirto
 Pepanthan Delegan
 Pepanthan Mojosari
 GKJ Ambarrukma
 Pepanthan Nologaten
 GKJ Pakem
 Pepanthan Asih
 Pepanthan Selorejo
 Pepanthan Tanen
 GKJ Sarimulyo
 GKJ Dayu
 GKJ Minomartani
 GKJ Tulung
 GKJ Karangbendho Bantul

Klasis Yogyakarta Selatan 
 GKJ Gondokusuman Yogyakarta
 GKJ Mergangsan Yogyakarta
 Pepanthan Joyodiningratan
 GKJ Kotagede Yogyakarta
 GKJ Brayat Kinasih Yogyakarta
 GKJ Bambu Tegalrejo Yogyakarta
 GKJ Bantul
 Pepanthan Siyangan
 GKJ Patalan
 Pepanthan Imogiri
 GKJ Gunturgeni
 GKJ Sumberagung
 Pepanthan Kalibeso
 GKJ Canden
 GKJ Madukismo
 Pepanthan Karangjati
 Pepanthan Kasongan
 GKJ Jodhog
 GKJ Sidomulyo
 Pepanthan Parangtritis
 GKJ Wonocatur
 GKJ Pundong

Klasis Kulon Progo 
 GKJ Wates
 Pepanthan Cumethuk
 Pepanthan Kalinongko
 Pepanthan Sidomulyo
 Pepanthan Butuh
 GKJ Wates Selatan
 Pepanthan Wonogiri
 Pepanthan Galur
 Pepanthan Depok
 Pepanthan Triharjo
 GKJ Sentolo
 Pepanthan Jangkang
 Pepanthan Tuksono
 GKJ Temon
 Pepanthan Seling
 Pepanthan Glagah
 Pepanthan Kalidengen
 GKJ Kalipenten
 GKJ Palihan
 GKJ Ngulakan
 Pepanthan Gunung Penthul
 Pepanthan Klepu
 Pepanthan Sengir
 GKJ Gowok
 Pepanthan Njarakan
 Pepanthan Kleben
 GKJ Plono
 GKJ Samigaluh
 GKJ Nanggulan
 Pepanthan Sribit
 Pepanthan Karang Gedhe
 Pepanthan Kalibawang
 GKJ Ngentakrejo

Klasis Gunung Kidul 
 GKJ Wonosari
 Pepanthan Bendungan
 Pepanthan Randukuning
 Pepanthan Nglipar
 Pepanthan Kebonjero
 Pepanthan Hargomulyo
 GKJ Watusigar
 Pepanthan Tambran
 Pepanthan Kampung
 Pepanthan Tobong
 Pepanthan Sambeng
 Pepanthan Kemejing
 Pepanthan Jurangrejo
 Pepanthan Karanggumuk
 Pepanthan Daguran
 Pepanthan Dawe
 GKJ Paliyan
 Pepanthan Menggoro
 Pepanthan Sanglor
 Pepanthan Ngembes
 Pepanthan Putat
 Pepanthan Kalongan
 Pepanthan Tungu
 GKJ Wiladeg
 Pepanthan Ngipak
 Pepanthan Candi
 GKJ Baran
 Pepanthan Petir
 Pepanthan Kentheng
 Pepanthan Karangwuni
 Pepanthan Pakel
 Pepanthan Ngelo
 Pepanthan Karangwetan
 Pepanthan Jepitu
 Pepanthan Karangawen Barat
 Pepanthan Karangawen Timur
 GKJ Logandeng
 Pepanthan Gading
 Pepanthan Gari
 GKJ Susukan
 Pepanthan Ngagel
 Pepanthan Tanggulangin
 Pepanthan Wirik
 Pepanthan Ngampelombo
 Pepanthan Jatisari
 Pepanthan Bedoyo
 Pepanthan Tambakromo
 Pepanthan Kenteng
 GKJ Pugeran
 Pepanthan Semin
 Pepanthan Sumberejo
 Pepanthan Candirejo
 Pepanthan Sempu
 Pepanthan Payaman
 GKJ Kemadang
 Pepanthan Planjan
 Pepanthan Sumber
 Pepanthan Ngepoh
 Pepanthan Banjarejo
 Pepanthan Bintaos
 GKJ Sabda Adi Semanu
 Pepanthan Regedeg
 Pepanthan Bantalwatu
 GKJ Semanu Baru
 Pepanthan Panggul
 Pepanthan Cuwela
 GKJ Bejiharjo
 Pepanthan Karanganom
 Pepanthan Grogol
 GKJ Panggang

Wilayah Pelayanan di Sumatera Utara 
 GKJ Immanuel Madirsan Tanjung Morawa Deli Serdang Sumatera Utara (dalam asuhan bersama HKBP Ressort Medan-Distrik X Medan-Aceh)
 GKJ Agung Sei Rotan Percut Sei Tuan Deli Serdang Sumatera Utara (dalam asuhan bersama HKBP Ressort Medan Timur-Distrik X Medan-Aceh)
 GKJ Sehati Kampung Kolam Percut Sei Tuan Deli Serdang Sumatera Utara (dalam asuhan bersama HKBP Ressort Saroha-Distrik XXXI Medan Utara)
 GKJ Pematangsiantar Sumatera Utara (dalam pengampuan GKJ Tanjung Priok Jakarta)
 Bajem Cokrosusilo Pematangsiantar Sumatera Utara

Referensi

Pranala luar 
 Situs resmi Gereja Kristen Jawa 
Kristen di Indonesia
Gereja di Indonesia
Anggota PGI
Gereja Kristen Jawa