Bacteroides fragilis

Bacteroides fragilis on gramnegatiivinen, obligaattinen anaerobi sauvanmuotoinen bakteeri, joka on osa ihmisen ruoansulatuselimistön normaaliflooraa., Se on kuitenkin verraten harvalukuinen ihmisen elimistössä ja muodostaa vain 0,5 % ihmisen suoliston mikrobiomista. Vaikka B.fragilis on kommensaali, se voi tietyissä olosuhteissa aiheuttaa erilaisia infektioita ja sairauksia.

Taksonomia, rakenne ja genomi 
B. fragilis on Bacteroidaceae-heimoon kuuluvan Bacteroides-suvun jäsen. Se ekspressoi soluseinällään sfingolipidejä ja diaminopimeliinihappoja. Sen genomi on kooltaan noin 5,2 miljoonaa emäsparia, joista noin 90 % koodaa proteiineja.

Patogeneesi ja hoito  
Vaikka normaalisti bakteeri ei aiheuta tauteja, sillä on myös patogeenisia ominaisuuksia, ja sitä voidaankin pitää opportunistisena patogeenina. Vaikka sitä on normaalifloorassa normaalisti melko pieni osuus, se on yksi tyypillisimpiä anaerobisia bakteereja, jotka aiheuttavat tulehduksia tai bakteremiaa elimistössä esimerkiksi leikkausten tai haavaumien yhteydessä tai tulehduksiin jotka ovat yhdistettävissä suolistoon. Lisäksi tietyt kannat on yhdistetty suolistosyöpien kehittymiseen, sekä pitkäaikaisiin suolistollisiin tulehdussairauksiin. B. fragilis voi aiheuttaa myös ripulia.

B. fragiliksen aiheuttamaa tulehdusta voidaan hoitaa metronidatsolilla ja karbapeneemeilla.

Lähteet 
Wexler H. M. (2007). Bacteroides: the good, the bad, and the nitty-gritty. Clinical microbiology reviews, 20(4), 593–621. https://doi.org/10.1128/CMR.00008-07

Genomic analysis of Bacteroides fragilis reveals extensive DNA inversions regulating cell surface adaptation
Tomomi Kuwahara, Atsushi Yamashita, Hideki Hirakawa, Haruyuki Nakayama, Hidehiro Toh, Natsumi Okada, Satoru Kuhara, Masahira Hattori, Tetsuya Hayashi, Yoshinari Ohnishi
Proceedings of the National Academy of Sciences Oct 2004, 101 (41) 14919-14924; DOI: 10.1073/pnas.0404172101

David R. Snydman, Nilda V. Jacobus, Laura A. McDermott, Yoav Golan, David W. Hecht, Ellie J. C. Goldstein, Lizzie Harrell, Stephen Jenkins, Duane Newton, Carl Pierson, John D. Rihs, Victor L. Yu, Richard Venezia, Sydney M. Finegold, Jon E. Rosenblatt, Sherwood L. Gorbach, Lessons Learned from the Anaerobe Survey: Historical Perspective and Review of the Most Recent Data (2005–2007), Clinical Infectious Diseases, Volume 50, Issue Supplement_1, February 2010, Pages S26–S33, https://doi.org/10.1086/647940

Bao, Y., Tang, J., Qian, Y. et al. Long noncoding RNA BFAL1 mediates enterotoxigenic Bacteroides fragilis-related carcinogenesis in colorectal cancer via the RHEB/mTOR pathway. Cell Death Dis 10, 675 (2019). https://doi.org/10.1038/s41419-019-1925-2

Viitteet

Aiheesta muualla 
Laji.fi: Bacteroides fragilis
ITIS: Bacteroides fragilis 
National Center for Biotechnology Information (NCBI): Bacteroides fragilis 

Gramnegatiiviset bakteerit