BLAST

Basic Local Alignment Search Tool, lyhennettynä BLAST, on biologinen ohjelmisto ja algoritmi, joka etsii samankaltaisia alueita sekvensseistä. Se on yksi tärkeimmistä työkaluista genomiikassa ja sen merkitys on kasvanut sekvensointimenetelmien kehittymisen myötä. BLAST vertaa syötettyä sekvenssiä tietokantoihin tallennettuihin sekvensseihin ja laskee niiden vastaavuuden tilastollista merkitsevyyttä kuvaavan arvon. Lähtösekvenssi voi olla nukleotidi- tai proteiinisekvenssi ja erityyppisiä sekvenssejä voidaan verrata toisiinsa. BLASTia käytetään esimerkiksi sekvenssien evolutiivisten suhteiden määrittämiseen ja uusien proteiinien tunnistamiseen.

Lähteet

Aiheesta muualla 
 BLAST 

Bioinformatiikka
Ohjelmistot
Algoritmit