Probiotique

==Définition==
Probiotiques : « Micro-organismes vivants qui, lorsqu’ils sont consommés en quantités adéquates, produisent un bénéfice pour la santé de l’hôte » Effets des probiotiques et prébiotiques sur la flore et l'immunité de l'homme adulte. AFSSA Février 2005. AFSSA, Food and Agriculture Organization des Nations Unies, Organisation Mondiale de la Santé (OMS) ; lignes directrices pour l’utilisation du terme « probiotiques » dans les aliments. Document CX/NFSDU 02/2, juillet 2002).
* Les micro-organismes de la flore intestinale constituent le microbiote intestinal
** Un microbiote est l'ensemble des micro-organismes peuplant un microbiome, c'est-à-dire un milieu de vie bien défini
** Le microbiote intestinal se compose de 100 000 milliards de micro-organismes vivants (10 puissance 14)
* On retrouve chez tous les individus 3 grands phyla bactériens (sur les 55 existants) réunissant 80 à 90% des espèces bactériennes fécales communes au genre humain Eckburg P.B, Bik (2005) Diversity of the human intestinal microbial flora Scienc 308 :1635-1638., Solmon Francine. Mémoire pour le Diplôme Inter-Universitaire « Obésité pédiatrique : approches de santé publique », Faculté de Médecine, Besançon, juin 2011 : Firmicutes, Bactéroidetes, Actinobacteria, et un de moindre importance en population : Proteobacteria ; au sein de ces grands royaumes, 6 genres sont retrouvés en dominance : Eubacterium, Lactobacillus, Enterococcus, Clostridium, Bacteroides, Bifidobacterium
* L'équilibre du microbiote intestinal semble concerné dans de très nombreuses pathologies Scher JU, Abramson SB. The microbiome and rheumatoid arthritis. Nat Rev Rheumatol. 2011 Aug 23;7(10):569-78. doi: 10.1038/nrrheum.2011.121. PMID 21862983, Zhang X, Zhang D, Jia H, Feng Q, Wang D, Liang D, Wu X, Li J, Tang L, Li Y, Lan Z, Chen B, Li Y, Zhong H, Xie H, Jie Z, Chen W, Tang S, Xu X, Wang X, Cai X, Liu S, Xia Y, Li J, Qiao X, Al-Aama JY, Chen H, Wang L, Wu QJ, Zhang F, Zheng W, Li Y, Zhang M, Luo G, Xue W, Xiao L, Li J, Chen W, Xu X, Yin Y, Yang H, Wang J, Kristiansen K, Liu L, Li T, Huang Q, Li Y, Wang J. The oral and gut microbiomes are perturbed in rheumatoid arthritis and partly normalized after treatment. Nat Med. 2015 Aug;21(8):895-905. doi: 10.1038/nm.3914. PMID 26214836
* Le microbiote est impliqué dans les maladies neuro-dégénératives Shu G. Chen, Vilius Stribinskis, Madhavi J. Rane, Donald R. Demuth, Evelyne Gozal, Andrew M. Roberts, Rekha Jagadapillai, Ruolan Liu, Kyonghwan Choe, Bhooma Shivakumar, Francheska Son, Shunying Jin, Richard Kerber, Anthony Adame, Eliezer Masliah, Robert P. Friedland. Exposure to the Functional Bacterial Amyloid Protein Curli Enhances Alpha-Synuclein Aggregation in Aged Fischer 344 Rats and Caenorhabditis elegans. Scientific Reports, 2016; 6: 34477 DOI: 10.1038/srep34477
** Les modifications du microbiote intestinal induites par un régime alimentaire occidental ultra-transformé favorisent le développement de maladies neurodégénératives Edwin E. Martínez Leo, Maira R. Segura Campos. Effect of ultra-processed diet on gut microbiota and thus its role in neurodegenerative diseases. Nutrition, Volume 71, 2020, 110609, https://doi.org/10.1016/j.nut.2019.110609.
** On observe des altérations du microbiote dans la maladie de Parkinson, ce qui pourra être un biomarqueur dans l’avenir : diminution des Prevotellaceae, et à l’inverse augmentation des Enterobacteriaceae, qui est associée à une instabilité posturale plus sévère Scheperjans, F., Aho, V., Pereira, P. A., Koskinen, K., Paulin, L., Pekkonen, E., Haapaniemi, E., Kaakkola, S., Eerola-Rautio, J., Pohja, M., Kinnunen, E., Murros, K., & Auvinen, P. (2015). Gut microbiota are related to Parkinson's disease and clinical phenotype. Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society, 30(3), 350–358. https://doi.org/10.1002/mds.26069. PMID 25476529, il a été observé une augmentation de Lactobacillus, Bifidobacterium, Verrucomicrobiaceae et Akkermansia, ainsi qu’une diminution de Faecalibacterium spp., Coprococcus spp., Blautia spp., Prevotella spp. et Prevotellaceae Gerhardt S, Mohajeri MH. Changes of Colonic Bacterial Composition in Parkinson's Disease and Other Neurodegenerative Diseases. Nutrients. 2018 Jun 1;10(6):708. doi: 10.3390/nu10060708. PMID 29857583
** Dans la maladie de Parkinson, il est observé une dysbiose intestinale Minato, T., Maeda, T., Fujisawa, Y., Tsuji, H., Nomoto, K., Ohno, K., & Hirayama, M. (2017). Progression of Parkinson's disease is associated with gut dysbiosis: Two-year follow-up study. PloS one, 12(11), e0187307. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0187307. PMID 29091972, Hill-Burns EM, Debelius JW, Morton JT, Wissemann WT, Lewis MR, Wallen ZD, Peddada SD, Factor SA, Molho E, Zabetian CP, Knight R, Payami H. Parkinson's disease and Parkinson's disease medications have distinct signatures of the gut microbiome. Mov Disord. 2017 May;32(5):739-749. doi: 10.1002/mds.26942. PMID 28195358, Sampson, T. R., Debelius, J. W., Thron, T., Janssen, S., Shastri, G. G., Ilhan, Z. E., Challis, C., Schretter, C. E., Rocha, S., Gradinaru, V., Chesselet, M. F., Keshavarzian, A., Shannon, K. M., Krajmalnik-Brown, R., Wittung-Stafshede, P., Knight, R., & Mazmanian, S. K. (2016). Gut Microbiota Regulate Motor Deficits and Neuroinflammation in a Model of Parkinson's Disease. Cell, 167(6), 1469–1480.e12. https://doi.org/10.1016/j.cell.2016.11.018 PMID 27912057, Sun MF, Shen YQ. Dysbiosis of gut microbiota and microbial metabolites in Parkinson's Disease. Ageing Res Rev. 2018 Aug;45:53-61. doi: 10.1016/j.arr.2018.04.004. PMID 29705121, Mulak A, Bonaz B. Brain-gut-microbiota axis in Parkinson's disease. World J Gastroenterol. 2015 Oct 7;21(37):10609-20. doi: 10.3748/wjg.v21.i37.10609. PMID 26457021, Lai F, Jiang R, Xie W, Liu X, Tang Y, Xiao H, Gao J, Jia Y, Bai Q. Intestinal Pathology and Gut Microbiota Alterations in a Methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine (MPTP) Mouse Model of Parkinson's Disease. Neurochem Res. 2018 Oct;43(10):1986-1999. doi: 10.1007/s11064-018-2620-x. PMID 30171422, Caputi V, Giron MC. Microbiome-Gut-Brain Axis and Toll-Like Receptors in Parkinson's Disease. Int J Mol Sci. 2018 Jun 6;19(6):1689. doi: 10.3390/ijms19061689. PMID 29882798
** Sur modèle murin de maladie de Parkinson induite par le MPTP, la transplantation de microbiote fécal a réduit la dysbiose microbienne intestinale, atténué les déficiences physiques, augmenté le contenu du striatum en dopamine et sérotonine des souris, et amélioré la symptomatologie Sun MF, Zhu YL, Zhou ZL, Jia XB, Xu YD, Yang Q, Cui C, Shen YQ. Neuroprotective effects of fecal microbiota transplantation on MPTP-induced Parkinson's disease mice: Gut microbiota, glial reaction and TLR4/TNF-α signaling pathway. Brain Behav Immun. 2018 May;70:48-60. doi: 10.1016/j.bbi.2018.02.005. PMID 29471030
* De même, on observe une modification du microbiote dans la maladie d’Alzheimer Jiang C, Li G, Huang P, Liu Z, Zhao B. The Gut Microbiota and Alzheimer's Disease. J Alzheimers Dis. 2017;58(1):1-15. doi: 10.3233/JAD-161141. PMID 28372330
** Il a été constaté une amélioration nette des symptômes chez un patient atteint de maladie d’Alzheimer, suite à une transplantation de microbiote fécal pour une infection à Clostridium difficile Hazan S. (2020). Rapid improvement in Alzheimer's disease symptoms following fecal microbiota transplantation: a case report. The Journal of international medical research, 48(6), 300060520925930. https://doi.org/10.1177/0300060520925930. PMID 32600151
* On observe des perturbations du microbiote dans le diabète de type 2, avec hyperperméabilité intestinale facilitant l'entrée de bactéries intestinales et de leurs métabolites nocifs dans le système circulatoire, et aggravation de l'insulinorésistance Yang G, Wei J, Liu P, Zhang Q, Tian Y, Hou G, Meng L, Xin Y, Jiang X. Role of the gut microbiota in type 2 diabetes and related diseases. Metabolism. 2021 Apr;117:154712. doi: 10.1016/j.metabol.2021.154712. PMID 33497712.
** Une supplémentation en probiotiques pourrait être bénéfique pour atténuer l'insulinorésistance dans le diabète de Type 2 Zhai L, Wu J, Lam YY, Kwan HY, Bian ZX, Wong HLX. Gut-Microbial Metabolites, Probiotics and Their Roles in Type 2 Diabetes. Int J Mol Sci. 2021 Nov 27;22(23):12846. doi: 10.3390/ijms222312846. PMID 34884651; PMCID: PMC8658018.
** Perturbations du microbiote dans l'obésité et les troubles métaboliques, avec inflammation de bas grade Scheithauer TPM, Rampanelli E, Nieuwdorp M, Vallance BA, Verchere CB, van Raalte DH, Herrema H. Gut Microbiota as a Trigger for Metabolic Inflammation in Obesity and Type 2 Diabetes. Front Immunol. 2020 Oct 16;11:571731. doi: 10.3389/fimmu.2020.571731. PMID 33178196; PMCID: PMC7596417.
* La susceptibilité individuelle à la toxicité hépatique de l’alcool dépend du microbiote intestinal Llopis M, Cassard AM, Wrzosek L, Boschat L, Bruneau A, Ferrere G, Puchois V, Martin JC, Lepage P, Le Roy T, Lefèvre L, Langelier B, Cailleux F, González-Castro AM, Rabot S, Gaudin F, Agostini H, Prévot S, Berrebi D, Ciocan D, Jousse C, Naveau S, Gérard P, Perlemuter G. Intestinal microbiota contributes to individual susceptibility to alcoholic liver disease. Gut. 2016 May;65(5):830-9. doi: 10.1136/gutjnl-2015-310585. PMID 26642859.
* Le microbiote interviendrait dans la qualité du sommeil Schoch SF, Castro-Mejía JL, Krych L, Leng B, Kot W, Kohler M, Huber R, Rogler G, Biedermann L, Walser JC, Nielsen DS, Kurth S. From Alpha Diversity to Zzz: Interactions among sleep, the brain, and gut microbiota in the first year of life. Prog Neurobiol. 2022 Feb;209:102208. doi: 10.1016/j.pneurobio.2021.102208. PMID 34923049., Han M, Yuan S, Zhang J. The interplay between sleep and gut microbiota. Brain Res Bull. 2022 Mar;180:131-146. doi: 10.1016/j.brainresbull.2021.12.016. PMID 35032622.
* Le microbiote intestinal interagit avec le système endocannabinoïde, il a été montré qu’une transplantation du microbiote fécal de souris soumises à un stress chronique imprévisible, générateur de comportement dépressif, peut transférer ce comportement à des souris receveuses naïves, et inversement être corrigé par une supplémentation en Lactobacillus sp. Chevalier G, Siopi E, Guenin-Macé L, Pascal M, Laval T, Rifflet A, Boneca IG, Demangel C, Colsch B, Pruvost A, Chu-Van E, Messager A, Leulier F, Lepousez G, Eberl G, Lledo PM. Effect of gut microbiota on depressive-like behaviors in mice is mediated by the endocannabinoid system. Nat Commun. 2020 Dec 11;11(1):6363. doi: 10.1038/s41467-020-19931-2. PMID 33311466; PMCID: PMC7732982.
==Propriétés==
* L'utilisation de probiotiques induit une nette amélioration de la symptomatologie de l'intestin irritable (ou colopathie fonctionnelle) Hoveyda N, Heneghan C, Mahtani KR, Perera R, Roberts N, Glasziou P. A systematic review and meta-analysis: probiotics in the treatment of irritable bowel syndrome. BMC Gastroenterol. 2009 Feb 16;9:15. doi: 10.1186/1471-230X-9-15. PMID 19220890
** Bifidobacterium bifidum MIMBb75 diminue la symptomatologie de l'intestin irritable et améliore la qualité de vie Guglielmetti S, Mora D, Gschwender M, Popp K. Randomised clinical trial: Bifidobacterium bifidum MIMBb75 significantly alleviates irritable bowel syndrome and improves quality of life--a double-blind, placebo-controlled study. Aliment Pharmacol Ther. 2011 May;33(10):1123-32. doi: 10.1111/j.1365-2036.2011.04633.x. PMID 21418261
** Lactobacillus plantarum diminue douleurs et flatulences de la colopathie fonctionnelle ou " syndrome de l'intestin irritable " Nobaek S, Johansson ML, Molin G, Ahrné S, Jeppsson B. Alteration of intestinal microflora is associated with reduction in abdominal bloating and pain in patients with irritable bowel syndrome. Am J Gastroenterol. 2000 May;95(5):1231-8. PMID 1081133, améliore l'immunité locale Qiu Y, Jiang Z, Hu S, Wang L, Ma X, Yang X Lactobacillus plantarum Enhanced IL-22 Production in Natural Killer (NK) Cells That Protect the Integrity of Intestinal Epithelial Cell Barrier Damaged by Enterotoxigenic Escherichia coli. Int J Mol Sci. 2017 Nov 13;18(11). pii: E2409. doi: 10.3390/ijms18112409. PMID 29137183, et la fonction de la barrière épithéliale Wu Y, Zhu C, Chen Z, Chen Z, Zhang W, Ma X, Wang L, Yang X, Jiang Z. Protective effects of Lactobacillus plantarum on epithelial barrier disruption caused by enterotoxigenic Escherichia coli in intestinal porcine epithelial cells. Vet Immunol Immunopathol. 2016 Apr;172:55-63. doi: 10.1016/j.vetimm.2016.03.005. PMID 27032504
** Lactobacillus gasseri est anti-inflammatoire dans les maladies chroniques inflammatoires de l'intestin (MICI) Carroll IM, Andrus JM, Bruno-Bárcena JM, Klaenhammer TR, Hassan HM, Threadgill DS. Anti-inflammatory properties of Lactobacillus gasseri expressing manganese superoxide dismutase using the interleukin 10-deficient mouse model of colitis. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2007 Oct;293(4):G729-38. PMID: 17640978, Lactobacillus gasseri LA806 améliore les douleurs abdominales de patients atteints de syndrome de l’intestin irritable Ait Abdellah S, Scanzi J, Gal C, Martin M, Beck M, Ojetti V. Lactobacillus gasseri LA806 Supplementation in Patients with Irritable Bowel Syndrome: A Multicenter Study. J Clin Med. 2022a;11(24):7446. doi: 10.3390/jcm11247446 pdf
* Le syndrome de l'intestin irritable est défini par les critères de Rome III :
** Douleur abdominale ou inconfort digestif (sensation abdominale désagréable non douloureuse) survenant au moins 3 jours par mois durant les 3 derniers mois associée avec au moins 2 des critères suivants :
*** Amélioration par la défécation
*** Survenue associée à une modification de la fréquence des selles
*** Survenue associée à une modification de la consistance des selles
* Lactobacillus gasseri OLL2716 (LG21) présenterait un intérêt dans l’éradication d’Helicobacter pylori et l’inflammation de la muqueuse gastrique Sakamoto I, Igarashi M, Kimura K, Takagi A, Miwa T, Koga Y. Suppressive effect of Lactobacillus gasseri OLL 2716 (LG21) on Helicobacter pylori infection in humans. J Antimicrob Chemother. 2001 May;47(5):709-10. PMID 11328791, Boonyaritichaikij S1, Kuwabara K, Nagano J, Kobayashi K, Koga Y. Long-term administration of probiotics to asymptomatic pre-school children for either the eradication or the prevention of Helicobacter pylori infection. Helicobacter. 2009 Jun;14(3):202-7. doi: 10.1111/j.1523-5378.2009.00675.x. PMID 19702850
* Lactobacillus reuteri diminue la prolifération de bactéries pathogènes Spinler JK, Taweechotipatr M, Rognerud CL, Ou CN, Tumwasorn S, Versalovic J. Human-derived probiotic Lactobacillus reuteri demonstrate antimicrobial activities targeting diverse enteric bacterial pathogens. Anaerobe. 2008 Jun;14(3):166-71. doi: 10.1016/j.anaerobe.2008.02.001. PMID 18396068, améliore la qualité du microbiote et de la santé en résultant Casas Ivan A, Dobrogosz Walter J. Validation of the Probiotic Concept: Lactobacillus reuteri Confers Broad-spectrum Protection against Disease in Humans and Animals. Microbial Ecology in Health and Disease , Volume 12, 2000, Issue 4, Pages 247-285 texte intégral
** Lactobacillus reuteri sécrèterait une substance nommée reutérine qui inhibe la croissance de bactéries gram-positives et gram-négatives, de levures, d’agents fongiques et de protozoaires Talarico TL, Dobrogosz WJ. Chemical characterization of an antimicrobial substance produced by Lactobacillus reuteri. Antimicrob Agents Chemother. 1989 May;33(5):674-9. PMID 2751282
** Une souche spécifique de Lactobacillus reuteri GMNL-263 (Lr263) réduit la résistance à l’insuline et diminue la formation de la stéatose hépatique Hsieh FC, Lee CL, Chai CY, Chen WT, Lu YC, Wu CS. Oral administration of Lactobacillus reuteri GMNL-263 improves insulin resistance and ameliorates hepatic steatosis in high fructose-fed rats. Nutr Metab (Lond). 2013 Apr 17;10(1):35. doi: 10.1186/1743-7075-10-35. PMID 23590862, Hsieh FC, Lan CC, Huang TY, Chen KW, Chai CY, Chen WT, Fang AH, Chen YH, Wu CS. Heat-killed and live Lactobacillus reuteri GMNL-263 exhibit similar effects on improving metabolic functions in high-fat diet-induced obese rats. Food Funct. 2016 May 18;7(5):2374-88. doi: 10.1039/c5fo01396h. PMID 27163114, diminue l'hyperlipémie et améliore la fonction cardio-vasculaire chez le hamster obèse Ting WJ, Kuo WW, Kuo CH, Yeh YL, Shen CY, Chen YH, Ho TJ, Viswanadha VP, Chen YH, Huang CY. Supplementary heat-killed Lactobacillus reuteri GMNL-263 ameliorates hyperlipidaemic and cardiac apoptosis in high-fat diet-fed hamsters to maintain cardiovascular function. Br J Nutr. 2015 Sep 14;114(5):706-12. doi: 10.1017/S0007114515002469. PMID 26234728
* Sur des souris soumises à un régime riche en graisse, le mélange de deux souches de probiotiques (Bifidobacterium animalis subsp. lactis LA804 et Lactobacillus gasseri LA806) limite la prise de poids et de masse grasse, diminue l’accumulation de lipides hépatiques, baisse les triglycérides plasmatiques, en outre il inhibe l’activité de la protéine FXR, ce qui améliore l’équilibre métabolique en entrainant une augmentation de la production d’acides biliaires dans l’intestin des souris Beau A, Benoit B, Le Barz M, Meugnier E, Penhoat A, Calzada C, Pinteur C, Loizon E, Chanon S, Vieille-Marchiset A, Sauvinet V, Godet M, Laugerette F, Holowacz S, Jacouton E, Michalski MC, Vidal H. Inhibition of intestinal FXR activity as a possible mechanism for the beneficial effects of a probiotic mix supplementation on lipid metabolism alterations and weight gain in mice fed a high fat diet. Gut Microbes. 2023 Dec;15(2):2281015. doi: 10.1080/19490976.2023.2281015. PMID 37985749; PMCID: PMC10730200.
* L’association des deux probiotiques Lactobacillus reuteri et Lactobacillus plantarum présente une résistance à de nombreux antibiotiques Egervärn M, Roos S, Lindmark H. Identification and characterization of antibiotic resistance genes in Lactobacillus reuteri and Lactobacillus plantarum. J Appl Microbiol. 2009 Nov;107(5):1658-68. doi: 10.1111/j.1365-2672.2009.04352.x. PMID 19457037
* Bifidobacterium lactis et Lactobacillus reuteri diminuent la fréquence des épisodes de diarrhée chez l’enfant, sans effet sur les infections respiratoires Weizman Z, Asli G, Alsheikh A. Effect of a probiotic infant formula on infections in child care centers: comparison of two probiotic agents. Pediatrics. 2005 Jan;115(1):5-9. PMID 15629974
* Lactobacillus rhamnosus améliore la dysbiose entérique Bull-Otterson, L., Feng, W., Kirpich, I., Wang, Y., Qin, X., Liu, Y., ... & Kong, M. (2013). Metagenomic analyses of alcohol induced pathogenic alterations in the intestinal microbiome and the effect of Lactobacillus rhamnosus GG treatment. PloS one, 8(1)., améliore l'immunité locale avec Bifidobacterium lactis et des prébiotiques Roller, M., Rechkemmer, G., & Watzl, B. (2004). Prebiotic inulin enriched with oligofructose in combination with the probiotics Lactobacillus rhamnosus and Bifidobacterium lactis modulates intestinal immune functions in rats. The journal of Nutrition, 134(1), 153-156., favorise l'intégrité intestinale et améliore les lésions hépatiques induites par l'alcool Yuhua Wang, Irina Kirpich, Yanlong Liu, Zhenhua Ma, Shirish Barve, Craig J. McClain, Wenke Feng. Lactobacillus rhamnosus GG Treatment Potentiates Intestinal Hypoxia-Inducible Factor, Promotes Intestinal Integrity and Ameliorates Alcohol-Induced Liver Injury. The American Journal of Pathology, Volume 179, Issue 6, 2011, Pages 2866-2875, https://doi.org/10.1016/j.ajpath.2011.08.039.
* Une association symbiotique, associant un probiotique artificiel, Limosilactobacillus fermentum CECT5716 à des galacto-oligosaccharides, influencerait la composition du microbiote intestinal et les paramètres du milieu fécal des nourrissons, de façon équivalente à l’effet du lait maternel Lagkouvardos I, et coll. Early life gut microbiota profiles linked to synbiotic formula effects: a randomized clinical trial in European infants. Am J Clin Nutr. 2023 Feb;117(2):326-339. doi: 10.1016/j.ajcnut.2022.11.012. PMID 36811568.
* Lactobacillus johnsonii améliore la vaginose bactérienne induite par Gardnerella vaginalis Joo HM, Hyun YJ, Myoung KS, Ahn YT, Lee JH, Huh CS, Han MJ, Kim DH. Lactobacillus johnsonii HY7042 ameliorates Gardnerella vaginalis-induced vaginosis by killing Gardnerella vaginalis and inhibiting NF-κB activation. Int Immunopharmacol. 2011 Nov;11(11):1758-65. doi: 10.1016/j.intimp.2011.07.002. PMID 21798373
* Lactobacillus helveticus améliore la candidose vulvovaginale en inhibant la croissance de Candida albicans Joo HM, Kim KA, Myoung KS, Ahn YT, Lee JH, Huh CS, Han MJ, Kim DH. Lactobacillus helveticus HY7801 ameliorates vulvovaginal candidiasis in mice by inhibiting fungal growth and NF-κB activation. Int Immunopharmacol. 2012 Sep;14(1):39-46. doi: 10.1016/j.intimp.2012.05.023. PMID 22735758
* Lactobacillus casei rhamnosus Lcr35 induit une régénération de la flore vaginale après traitement antibiotique d'une vaginose bactérienne Petricevic L, Witt A. The role of Lactobacillus casei rhamnosus Lcr35 in restoring the normal vaginal flora after antibiotic treatment of bacterial vaginosis. BJOG. 2008 Oct;115(11):1369-74. doi: 10.1111/j.1471-0528.2008.01882.x. PMID 18823487, diminue les récidives de mycose chez les femmes souffrant de candidose vulvovaginale récidivante A.M. Kern, J.M. Bohbot, J.M. Cardot. Traitement préventif de la candidose vulvovaginale récidivante par probiotique vaginal : résultats de l’étude observationnelle Candiflore (Preventive treatment of vulvovaginal candidosis with vaginal probiotic (Gynophilus®-Lcr Regenerans®): results of the observational study Candiflore). La Lettre du Gynécologue, n° 370, mars 2012 texte intégral
* Lactobacillus casei rhamnosus Lcr35 seul, ou Lactobacillus acidophilus + Bifidobacterium bifidum LaBi, en suspension, améliorent la mucite induite par la chimiothérapie Yeung CY, Chan WT, Jiang CB, Cheng ML, Liu CY, Chang SW, Chiang Chiau JS, Lee HC. Amelioration of Chemotherapy-Induced Intestinal Mucositis by Orally Administered Probiotics in a Mouse Model. PLoS One. 2015 Sep 25;10(9):e0138746. doi: 10.1371/journal.pone.0138746. eCollection 2015. PMID 26406888
* Lactobacillus casei souche Shirota inhiberait la pousse d'Helicobacter pylori Sgouras Dz, Maragkoudakis P, Petraki K, Martinez-Gonzalez B, Eriotou E, Michopoulos S, Kalantzopoulos G, Tsakalidou E, Mentis A. In vitro and in vivo inhibition of Helicobacter pylori by Lactobacillus casei strain Shirota. Appl Environ Microbiol. 2004 Jan;70(1):518-26. PMID 14711683
* Lactobacillus casei souche CCFM0412 améliore l'intolérance au glucose, la dyslipidémie et le stress oxydatif chez les souris atteintes de diabète de type 2, pourrait être un traitement préventif prometteur pour la prévention du diabète de type 2 Chen P, Zhang Q, Dang H, Liu X, Tian F, Zhao J, Chen Y, Zhang H, Chen W. Antidiabetic effect of Lactobacillus casei CCFM0412 on mice with type 2 diabetes induced by a high-fat diet and streptozotocin. Nutrition. 2014 Sep;30(9):1061-8. doi: 10.1016/j.nut.2014.03.022. PMID 25102821
* Lactobacillus casei, Lactobacillus paracasei, Lactobacillus plantarum, Lactobacillus rhamnosus, Lactobacillus sake sont des hôtes normaux des voies digestives et urogénitales Louis Farina. Intérêt des probiotiques en parodontologie. Médecine humaine et pathologie. 2016. [dumas-01320911texte intégral
* Lactobacillus crispatus est prédominant dans le microbiote vaginal sain, il synthétise de fortes quantités d’acide lactique aux propriétés antimicrobiennes et immunomodulantes. On peut l’utiliser comme probiotique préventif des infections vaginales ou en complément d’un traitement antibiotique ou antifongique Lepargneur Jean-Pierre. Lactobacillus crispatus, biomarqueur de l’écosystème vaginal sain. Annales de Biologie Clinique Volume 74, numéro 4, Juillet-Août 2016 
* Lactobacilles et bifidobactéries jouent un rôle favorable dans l’anxiété et les symptômes mentaux de la fatigue chronique Rao AV, Bested AC, Beaulne TM, Katzman MA, Iorio C, Berardi JM, Logan AC. A randomized, double-blind, placebo-controlled pilot study of a probiotic in emotional symptoms of chronic fatigue syndrome. Gut Pathog. 2009 Mar 19;1(1):6. doi: 10.1186/1757-4749-1-6. PMID 19338686
* Lactobacillus brevis NCL912 synthétise le GABA (acide gamma-aminobutyrique), avec application potentielle dans la fermentation à grande échelle pour une production commerciale Li H, Qiu T, Huang G, Cao. Y. Production of gamma-aminobutyric acid by Lactobacillus brevis NCL912 using fed-batch fermentation. Microbial Cell Factories 2010, 9:85 http://www.microbialcellfactories.com/content/9/1/85. texte intégral
* * L’administration de probiotiques (Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus casei, Bifidobacterium bifidum, 2 × 10.9 unités formant colonie de chaque) chez des patients atteints de troubles dépressifs caractérisés montre des effets bénéfiques sur l’inventaire de dépression de Beck, un questionnaire servant à mesurer la sévérité de la dépression clinique Akkasheh G, Kashani-Poor Z, Tajabadi-Ebrahimi M, Jafari P, Akbari H, Taghizadeh M, Memarzadeh MR, Asemi Z, Esmaillzadeh A. Clinical and metabolic response to probiotic administration in patients with major depressive disorder: A randomized, double-blind, placebo-controlled trial. Nutrition. 2016 Mar;32(3):315-20. doi: 10.1016/j.nut.2015.09.003. PMID 26706022.
* La bactérie Faecalibacterium prausnitzii est diminuée dans la flore intestinale des patients atteints de MICI (maladie de Crohn, rectocolite) Sokol H, Pigneur B, Watterlot L, Lakhdari O, Bermúdez-Humarán LG, Gratadoux JJ, Blugeon S, Bridonneau C, Furet JP, Corthier G, Grangette C, Vasquez N, Pochart P, Trugnan G, Thomas G, Blottière HM, Doré J, Marteau P, Seksik P, Langella P. Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Oct 28;105(43):16731-6. doi: 10.1073/pnas.0804812105. PMID 18936492
* La bactérie Akkermansia muciniphila (bactérie dégradant la mucine) protège la souris de l’athérosclérose Li J, Lin S, Vanhoutte PM, Woo CW, Xu A. Akkermansia Muciniphila Protects Against Atherosclerosis by Preventing Metabolic Endotoxemia-Induced Inflammation in Apoe-/- Mice. Circulation. 2016 Jun 14;133(24):2434-46. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.115.019645. PMID 27143680 et sa concentration diminue en cas de diabète de type 2 ou d'obésité Everard A, Belzer C, Geurts L, Ouwerkerk JP, Druart C, Bindels LB, Guiot Y, Derrien M, Muccioli GG, Delzenne NM, de Vos WM, Cani PD. Cross-talk between Akkermansia muciniphila and intestinal epithelium controls diet-induced obesity. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 May 28;110(22):9066-71. doi: 10.1073/pnas.1219451110. PMID 23671105, sa présence est augmentée par la consommation de canneberge (cranberry) Anhê FF, Roy D, Pilon G, Dudonné S, Matamoros S, Varin TV, Garofalo C, Moine Q, Desjardins Y, Levy E, Marette A. A polyphenol-rich cranberry extract protects from diet-induced obesity, insulin resistance and intestinal inflammation in association with increased Akkermansia spp. population in the gut microbiota of mice. Gut. 2015 Jun;64(6):872-83. doi: 10.1136/gutjnl-2014-307142. PMID 25080446, Anhê FF, Varin TV, Le Barz M, Desjardins Y, Levy E, Roy D, Marette A. Gut Microbiota Dysbiosis in Obesity-Linked Metabolic Diseases and Prebiotic Potential of Polyphenol-Rich Extracts. Curr Obes Rep. 2015 Dec;4(4):389-400. doi: 10.1007/s13679-015-0172-9. PMID 26343880
* L’alimentation de la mère influe sur la qualité du microbiote de son enfant, mais pour des raisons épigénétiques, le surpoids du père au moment de la conception double le risque d'obésité de sa progéniture et pourra induire des troubles métaboliques (études chez la souris et chez l’humain) Tomar, A., Gomez-Velazquez, M., Gerlini, R. et al. Epigenetic inheritance of diet-induced and sperm-borne mitochondrial RNAs. Nature (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07472-3
* La composition microbienne de l'intestin dépend des habitudes alimentaires : le microbiote fécal d'enfants européens a été comparé à celui d'enfants d'un village du Burkina Faso, où le régime alimentaire, riche en fibres, est similaire à celui des humains lors de la première sédentarisation
** Les enfants burkinabés ont plus d'acides gras à chaîne courte, une forte concentration en Bacteroidetes et faible en Firmicutes, une abondance de bactéries des genres Prevotella et Xylanibacter, capables d’hydrolyser la cellulose et le xylane, que l’on ne retrouve pas chez les enfants européens, qui ont plus d’entérobactéries (Shigella et Escherichia)
** Les auteurs précisent que ce trésor de diversité microbienne des anciennes communautés rurales du monde entier doit être préservé De Filippo C, Cavalieri D, Di Paola M, Ramazzotti M, Poullet JB, Massart S, Collini S, Pieraccini G, Lionetti P. Impact of diet in shaping gut microbiota revealed by a comparative study in children from Europe and rural Africa. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Aug 17;107(33):14691-6. doi: 10.1073/pnas.1005963107. PMID 20679230; PMCID: PMC2930426.
* Les acides gras à chaîne courte du colon sont absorbés et métabolisés chez l’homme et ont un effet sur le métabolisme des glucides et des lipides Wolever TM, Brighenti F, Royall D, Jenkins AL, Jenkins DJ. Effect of rectal infusion of short chain fatty acids in human subjects. Am J Gastroenterol. 1989 Sep;84(9):1027-33. PMID 2773895.
* Les fibres alimentaires augmentent la production d'acides gras à chaîne courte du colon, ce qui peut réduire le risque de diabète de type 2 en réduisant les acides gras libres postprandiaux, et en affectant favorablement les hormones intestinales qui régulent l'apport alimentaire, dont la ghréline à effet orexigène Tarini J, Wolever TM. The fermentable fibre inulin increases postprandial serum short-chain fatty acids and reduces free-fatty acids and ghrelin in healthy subjects. Appl Physiol Nutr Metab. 2010 Feb;35(1):9-16. doi: 10.1139/H09-119. PMID 20130660.
==Mécanisme d'action==
* Résulterait d'une immunorégulation entre cytokines pro- et anti-inflammatoires O'Mahony L, McCarthy J, Kelly P, Hurley G, Luo F, Chen K, O'Sullivan GC, Kiely B, Collins JK, Shanahan F, Quigley EM. Lactobacillus and bifidobacterium in irritable bowel syndrome: symptom responses and relationship to cytokine profiles. Gastroenterology. 2005 Mar;128(3):541-51. PMID 15765388, Ducrotté P. Physiopathologie des TFI et implications thérapeutiques. Post’U. 2013 ;189-196. texte intégral
* Certains probiotiques élaborent des molécules antibactériennes (bactériocines), d'autres augmentent la production de molécules immunitaires innées dans la barrière muqueuse (mucines, défensines), ou favorisent des réponses immunitaires adaptatives (immunoglobuline A sécrétoire, lymphocytes T régulateurs, interleukine-10), certains probiotiques activent des récepteurs dans le système nerveux entérique, favorisant ainsi le soulagement de la douleur viscérale Sherman PM, Ossa JC, Johnson-Henry K. Unraveling mechanisms of action of probiotics. Nutr Clin Pract. 2009 Feb-Mar;24(1):10-4. doi: 10.1177/0884533608329231. PMID 19244144
* La zonuline, protéine synthétisée par la muqueuse intestinale, est le modulateur physiologique des jonctions intercellulaires fortes, intervenant dans l’hyperperméabilité intestinale (syndrome de l'intestin perméable ou « leaky gut syndrome » des anglo-saxons), incriminée dans diverses pathologies (dysbioses, bactériémies, inflammation, autoimmunité, cancer) Fasano A. Leaky gut and autoimmune diseases. Clin Rev Allergy Immunol. 2012 Feb;42(1):71-8. doi: 10.1007/s12016-011-8291-x. PMID 22109896, Fasano A. Intestinal permeability and its regulation by zonulin: diagnostic and therapeutic implications. Clin Gastroenterol Hepatol. 2012 Oct;10(10):1096-100. doi: 10.1016/j.cgh.2012.08.012. PMID 22902773, Fasano A. Zonulin and its regulation of intestinal barrier function: the biological door to inflammation, autoimmunity, and cancer. Physiol Rev. 2011 Jan;91(1):151-75. doi: 10.1152/physrev.00003.2008. PMID 21248165, Suzuki T. Regulation of intestinal epithelial permeability by tight junctions. Cell Mol Life Sci. 2013 Feb;70(4):631-59. doi: 10.1007/s00018-012-1070-x. PMID 22782113, Fasano A, Nataro JP. Intestinal epithelial tight junctions as targets for enteric bacteria-derived toxins. Adv Drug Deliv Rev. 2004 Apr 19;56(6):795-807. PMID 15063590
** La gliadine du gluten induit une perméabilité intestinale accrue aux macromolécules Drago S, El Asmar R, Di Pierro M, Grazia Clemente M, Tripathi A, Sapone A, Thakar M, Iacono G, Carroccio A, D'Agate C, Not T, Zampini L, Catassi C, Fasano A. Gliadin, zonulin and gut permeability: Effects on celiac and non-celiac intestinal mucosa and intestinal cell lines. Scand J Gastroenterol. 2006 Apr;41(4):408-19. PMID 16635908
* Certaines souches sont anti-inflammatoires : Lactococcus lactis, Lactobacillus casei, Lactobacillus plantarum, Bifidobacterium infantis, Faecalibacterium prausnitzii Watterlot Laurie. Analyse des effets de souches probiotiques anti-inflammatoires. Alimentation et Nutrition. Thèse AgroParisTech, 2010. Français. <NNT : 2010AGPT0028>. <pastel-00570505>
* La combinaison des effets d'extraits de plantes médicinales ou d’huiles essentielles et de probiotiques peut représenter une nouvelle approche en raison de leurs effets antimicrobiens complémentaires Shipradeep, Karmakar S, Sahay Khare R, Ojha S, Kundu K, Kundu S. Development of probiotic candidate in combination with essential oils from medicinal plant and their effect on enteric pathogens: a review. Gastroenterol Res Pract. 2012;2012:457150. doi: 10.1155/2012/457150. PMID 22811700
* La triméthylamine et la diméthylamine, précurseurs de la diméthylnitrosamine, un cancérogène puissant, sont produits, entre autres, à partir de la choline alimentaire par les bactéries intestinales Steven H. Zeisel, Kerry A. daCosta , Mervat Youssef, Stephanie Hensey. Conversion of Dietary Choline to Trimethylamine and Dimethylamine in Rats: Dose-Response Relationship. The Journal of Nutrition, Volume 119, Issue 5, 1 May 1989, Pages 800–804, https://doi.org/10.1093/jn/119.5.800, conversion réalisée par des microorganismes anaérobies composants du microbiote humain et influencés par l'environnement Craciun S, Balskus EP. Microbial conversion of choline to trimethylamine requires a glycyl radical enzyme. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Dec 26;109(52):21307-12. doi: 10.1073/pnas.1215689109. PMID 23151509
==Indications==
* Acné (Lactobacillus reuteri) Kang MS, Oh JS, Lee SW, Lim HS, Choi NK, Kim SM. Effect of Lactobacillus reuteri on the proliferation of Propionibacterium acnes and Staphylococcus epidermidis. J Microbiol. 2012 Feb;50(1):137-42. doi: 10.1007/s12275-012-1286-3. PMID 22367948
* Infections gynécologiques Reid G, Burton J, Devillard E. The rationale for probiotics in female urogenital healthcare. MedGenMed. 2004 Mar 29;6(1):49. PMID 15208560, Reid G. Probiotics for urogenital health. Nutr Clin Care. 2002 Jan-Feb;5(1):3-8. PMID 12134717, vaginose bactérienne Homayouni A, Bastani P, Ziyadi S, Mohammad-Alizadeh-Charandabi S, Ghalibaf M, Mortazavian AM, Mehrabany EV. Effects of probiotics on the recurrence of bacterial vaginosis: a review. J Low Genit Tract Dis. 2014 Jan;18(1):79-86. doi: 10.1097/LGT.0b013e31829156ec. PMID 24299970, infections génito-urinaires Barrons R, Tassone D. Use of Lactobacillus probiotics for bacterial genitourinary infections in women: a review. Clin Ther. 2008 Mar;30(3):453-68. doi: 10.1016/j.clinthera.2008.03.013. PMID 18405785, mais des études complémentaires sont requises Falagas M, Betsi GI, Athanasiou S. Probiotics for the treatment of women with bacterial vaginosis. Clin Microbiol Infect. 2007 Jul;13(7):657-64. PMID 17633390 et les associations les plus pertinentes sont encore à l'étude Vicariotto F, Del Piano M, Mogna L, Mogna G. Effectiveness of the association of 2 probiotic strains formulated in a slow release vaginal product, in women affected by vulvovaginal candidiasis: a pilot study. J Clin Gastroenterol. 2012 Oct;46 Suppl:S73-80. doi: 10.1097/MCG.0b013e3182684d71. PMID 22955364
* Immunostimulation Brufau J, Esteve E, Tarradas J. Review of immune stimulator substances/agents that are susceptible of being used as feed additives: mode of action and identification of end-points for efficacy assessment. Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA), EFSA External Scientific Report, décembre 2015, [10.2903/sp.efsa.2015.EN-905 EFSA], démontrée pour Lactobacillus gasseri CECT 5714 et Lactobacillus coryniformis CECT 5711 Olivares, M., Díaz-Ropero, M. P., Gómez, N., Lara-Villoslada, F., Sierra, S., Maldonado, J. A., & Xaus, J. (2006). The consumption of two new probiotic strains, Lactobacillus gasseri CECT 5714 and Lactobacillus coryniformis CECT 5711, boosts the immune system of healthy humans. International microbiology, 9(1), 47-52. pdf intégral
* Colopathie fonctionnelle (syndrome de l'intestin irritable) Coffin Benoît. Syndrome de l’intestin irritable: traitements conventionnels et alternatifs. Post’U FMC-HGE, pp 85-94 texte intégral et MICI
* Obésité Miyoshi M, Ogawa A, Higurashi S, Kadooka Y. Anti-obesity effect of Lactobacillus gasseri SBT2055 accompanied by inhibition of pro-inflammatory gene expression in the visceral adipose tissue in diet-induced obese mice. Eur J Nutr. 2014;53(2):599-606. doi: 10.1007/s00394-013-0568-9. PMID 23917447 et troubles métaboliques Cho YA, Kim J. Effect of Probiotics on Blood Lipid Concentrations: A Meta-Analysis of Randomized Controlled Trials. Medicine (Baltimore). 2015 Oct;94(43):e1714. doi: 10.1097/MD.0000000000001714. PMID 26512560, réduction de la graisse abdominale Kadooka Y, Sato M, Imaizumi K, Ogawa A, Ikuyama K, Akai Y, Okano M, Kagoshima M, Tsuchida T. Regulation of abdominal adiposity by probiotics (Lactobacillus gasseri SBT2055) in adults with obese tendencies in a randomized controlled trial. Eur J Clin Nutr. 2010 Jun;64(6):636-43. doi: 10.1038/ejcn.2010.19. PMID 20216555, Kadooka Y, Sato M, Ogawa A, Miyoshi M, Uenishi H, Ogawa H, Ikuyama K, Kagoshima M, Tsuchida T. Effect of Lactobacillus gasseri SBT2055 in fermented milk on abdominal adiposity in adults in a randomised controlled trial. Br J Nutr. 2013 Nov 14;110(9):1696-703. doi: 10.1017/S0007114513001037. PMID 23614897 par action sur l'adiponectine ((Lactobacillus gasseri SBT2055 = LG2055) Ogawa A, Kadooka Y, Kato K, Shirouchi B, Sato M. Lactobacillus gasseri SBT2055 reduces postprandial and fasting serum non-esterified fatty acid levels in Japanese hypertriacylglycerolemic subjects. Lipids Health Dis. 2014 Feb 19;13:36. doi: 10.1186/1476-511X-13-36. PMID 24548293, effet hypocholestérolémiant par suppression de la réabsorption des acides biliaires dans la circulation entérohépatique et augmentation de l’excrétion stéroïdienne dans les feces (Lactobacillus gasseri SBT0270) Usman, Hosono A. Effect of administration of Lactobacillus gasseri on serum lipids and fecal steroids in hypercholesterolemic rats. J Dairy Sci. 2000 Aug;83(8):1705-11. PMID 10984145, amélioration de l’intégrité de la muqueuse intestinale, diminution de l’entrée de substances inflammatoires dans les cellules intestinales et adipeuses Kawano M, Miyoshi M, Ogawa A, Sakai F, Kadooka Y. Lactobacillus gasseri SBT2055 inhibits adipose tissue inflammation and intestinal permeability in mice fed a high-fat diet. J Nutr Sci. 2016 May 30;5:e23. doi: 10.1017/jns.2016.12. eCollection 2016. PMID 27293560
** Lactobacillus gasseri SBT 2055, Lactobacillus rhamnosus ATCC 53103, une association entre Lactobacillus rhamnosus ATCC 53102 et Bifidobacterium lactis Bb12 peuvent réduire la prise de poids Mekkes MC, Weenen TC, Brummer RJ, Claassen E. The development of probiotic treatment in obesity: a review. Benef Microbes. 2014 Mar;5(1):19-28. doi: 10.3920/BM2012.0069. Review. PMID 23886977
* Prévention des diarrhées post-antibiotiques chez l'enfant Johnston BC, Goldenberg JZ, Vandvik PO, Sun X, Guyatt GH. Probiotics for the prevention of pediatric antibiotic-associated diarrhea.Cochrane Database Syst Rev. 2011 Nov 9;(11):CD004827. doi: 10.1002/14651858.CD004827.pub3. PMID 22071814, prévention des infections à Clostridium difficile Goldenberg JZ, Ma SS, Saxton JD, Martzen MR, Vandvik PO, Thorlund K, Guyatt GH, Johnston BC. Probiotics for the prevention of Clostridium difficile-associated diarrhea in adults and children. Cochrane Database Syst Rev. 2013 May 31;(5):CD006095. doi: 10.1002/14651858.CD006095.pub3. PMID 23728658, Sinclair A, Xie X, Saab L, Dendukuri N. Lactobacillus probiotics in the prevention of diarrhea associated with Clostridium difficile: a systematic review and Bayesian hierarchical meta-analysis. CMAJ Open. 2016 Nov 24;4(4):E706-E718. doi: 10.9778/cmajo.20160087. PMID 28018885
* Deux groupes de bactéries dominantes dans l’intestin humain, Bacteroidetes et Firmicutes, ont été étudiées pour leur rôle dans l’apparition de l’obésité, il apparaît que Bacteroidetes tend à diminuer chez les obèses Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI. Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity. Nature. 2006 Dec 21;444(7122):1022-3. PMID 17183309 et Firmicutes tend à augmenter dans les fèces des humains obèses par rapport à celles des sujets minces. La perte de poids (d'au moins 6%) instaurée par un régime hypocalorique, quelqu'il soit, a provoqué un retour à un profil bactérien similaire à celui des sujets minces (Solmon), Turnbaugh PJ, Ley RE, Mahowald MA, Magrini V, Mardis ER, Gordon JI (2006) An obesity associated gut microbiome with incraesed capacity for energy harvest . Nature 444: 1027-1031
* Faecalibacterium prausnitzii semble en augmentation dans le microbiote d'enfants obèses en Inde Balamurugan R, George G, Kabeerdoss J, Hepsiba J, Chandragunasekaran AM, Ramakrishna BS. Quantitative differences in intestinal Faecalibacterium prausnitzii in obese Indian children. Br J Nutr. 2010 Feb;103(3):335-8. doi: 10.1017/S0007114509992182. PMID 19849869
* On doit porter une attention particulière au contenu en lactobacilles des probiotiques : L’administration de Lactobacillus acidophilus entraine un gain pondéral chez les animaux et les humains, Lactobacillus fermentum et Lactobacillus ingluviei chez les animaux uniquement. Lactobacillus gasseri est associé à une perte de poids chez les animaux et les humains, Lactobacillus plantarum chez les animaux uniquement Million M, Angelakis E, Paul M, Armougom F, Leibovici L, Raoult D. Comparative meta-analysis of the effect of Lactobacillus species on weight gain in humans and animals. Microb Pathog. 2012 Aug;53(2):100-8. doi: 10.1016/j.micpath.2012.05.007. PMID 22634320
* Certaines bactéries induisent une conversion de l'acide linoléique oméga-6 en CLA (conjugated linoleic acid) ou acides linoléiques conjugués, anticarcinogènes : Lactobacillus plantarum Khosravi A, Safari M, Khodaiyan F, Gharibzahedi SM. Bioconversion enhancement of conjugated linoleic acid by Lactobacillus plantarum using the culture media manipulation and numerical optimization. J Food Sci Technol. 2015 Sep;52(9):5781-9. doi: 10.1007/s13197-014-1699-6. PMID 26344992, Lactobacillus acidophilus Macouzet M, Lee BH, Robert N. Production of conjugated linoleic acid by probiotic Lactobacillus acidophilus La-5. J Appl Microbiol. 2009 Jun;106(6):1886-91. doi: 10.1111/j.1365-2672.2009.04164.x. PMID 19228257 et Lactobacillus casei Alonso L, Cuesta EP, Gilliland SE. Production of free conjugated linoleic acid by Lactobacillus acidophilus and Lactobacillus casei of human intestinal origin. J Dairy Sci. 2003 Jun;86(6):1941-6. PMID 12836928, Bifidobacterium bifidum Rashad R. Al-Hindi, Salem Abd El Ghani. Production of Free Conjugated Linoleic Acid by Fermentation Performed Using Lactobacillus casei and Bifidobacterium bifidum. Global Veterinaria, 2015, 14 (5): 720-728. DOI: 10.5829/idosi.gv.2015.14.05.94272, ou par des associations (Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus bulgaricus, Lactobacillus casei, Lactobacillus plantarum, Bifidobacterium breve, Bifidobacterium infantis, Bifidobacterium longum, Streptococcus thermophilus) Ewaschuk JB, Walker JW, Diaz H, Madsen KL. Bioproduction of conjugated linoleic acid by probiotic bacteria occurs in vitro and in vivo in mice. J Nutr. 2006 Jun;136(6):1483-7. PMID 16702308 texte intégral
* La restriction calorique et l’activité physique ont un impact sur la composition du microbiote Santacruz A, Marcos A, Wärnberg J, Martí A, Martin-Matillas M, Campoy C, Moreno LA, Veiga O, Redondo-Figuero C, Garagorri JM, Azcona C, Delgado M, García -Fuentes M, Collado MC, Sanz Y; EVASYON Study Group. Interplay between weight loss and gut microbiota composition in overweight adolescents. Obesity (Silver Spring). 2009 Oct;17(10):1906-15. doi: 10.1038/oby.2009.112. PMID 19390523
==Autres microbiotes==
* Jusqu’à 2012, les voies urinaires d'individus en bonne santé étaient considérées comme stériles, mais le séquençage métagénomique a révélé un microbiote urinaire dont la dysfonction (dysbiose) pourrait induire divers troubles des voies urinaires basses Antunes-Lopes T, Vale L, Coelho AM, Silva C, Rieken M, Geavlete B, Rashid T, Rahnama'i SM, Cornu JN, Marcelissen T; EAU Young Academic Urologists (YAU) Functional Urology Working Group. The Role of Urinary Microbiota in Lower Urinary Tract Dysfunction: A Systematic Review. Eur Urol Focus. 2020 Mar 15;6(2):361-369. doi: 10.1016/j.euf.2018.09.011. PMID 30270128, Magistro G, Stief CG. The Urinary Tract Microbiome: The Answer to All Our Open Questions? Eur Urol Focus. 2019 Jan;5(1):36-38. doi: 10.1016/j.euf.2018.06.011. PMID 30042043
* Il a été démontré récemment que le poumon sain lui-même n’est pas stérile, et qu’il possède son microbiote spécifique, avec un lien encore mal connu entre le poumon et le tractus gastro-intestinal, certaines situations pathologiques entrainant une augmentation de la perméabilité intestinale associée à une hyper-perméabilité alvéolo-capillaire, comme cela semble être le cas dans la maladie COVID-19 Vassilios Fanos, Maria Cristina Pintus, Roberta Pintus, Maria Antonietta Marcialis. Lung microbiota in the acute respiratory disease: from coronavirus to metabolomics. Journal of Pediatric and Neonatal Individualized Medicine (JPNIM), Vol 9, No 1 (2020)
* Certaines bactéries commensales du microbiote utérin (Fusobacterium nucleatum) joueraient un rôle dans le développement et la persistance de l’endométriose Muraoka A, Suzuki M, Hamaguchi T, Watanabe S, Iijima K, Murofushi Y, Shinjo K, Osuka S, Hariyama Y, Ito M, Ohno K, Kiyono T, Kyo S, Iwase A, Kikkawa F, Kajiyama H, Kondo Y. Fusobacterium infection facilitates the development of endometriosis through the phenotypic transition of endometrial fibroblasts. Sci Transl Med. 2023 Jun 14;15(700):eadd1531. doi: 10.1126/scitranslmed.add1531. Epub 2023 Jun 14. PMID 37315109.
==Précautions d'emploi==
* Bonne tolérance Hoy-Schulz Y, Jannat K, Roberts T, Zaidi S, Unicomb L, Luby S, Parsonnet J. Safety and acceptability of Lactobacillus reuteri DSM 17938 and Bifidobacterium longum subspecies infantis 35624 in Bangladeshi infants: a phase I randomized clinical trial. BMC Complementary and Alternative Medicine 2016, 16:44 (2 February 2016) Abstract texte intégral
* Éviter chez les patients immunodéprimés ou diabétiques non équilibrés EF Zein, S Karaa, A Chemaly, I Saidi, W Daou-Chahine, R Rohban . Septicémie à Lactobacillus rhamnosus chez une patiente diabétique prenant un traitement probiotique. Annales de Biologie Clinique. 2008;66(2):195-198. doi:10.1684/abc.2008.0210 , les porteurs de cathéter veineux, les diabétiques (risque de bactériémie à Lactobacille) Husni RN, Gordon SM, Washington JA, Longworth DL. Lactobacillus bacteremia and endocarditis: review of 45 cases. Clin Infect Dis. 1997 Nov;25(5):1048-55. PMID 9402355, mais les risques sont modérés et la pathogénicité faible Antony SJ, Stratton CW, Dummer JS. Lactobacillus bacteremia: description of the clinical course in adult patients without endocarditis. Clin Infect Dis. 1996 Oct;23(4):773-8. PMID 8909843
* Éviter la supplémentation en CLA chez les femmes enceintes 
==Bibliographie==
* Dapoigny M. Syndrome de l’intestin irritable : épidémiologie/poids économique. Doi : 10.1016/S0399-8320(09)71519-2 
* Reid G, Anukam K, Koyama T. Probiotic products in Canada with clinical evidence: What can gastroenterologists recommend? Canadian Journal of Gastroenterology. 2008;22(2):169-175. texte intégral en français
* Gibson GR, Roberfroid MB. Dietary modulation of the human colonic microbiota: introducing the concept of prebiotics. J Nutr. 1995 Jun;125(6):1401-12. PMID 7782892
* Kaliannan K, Wang B, Li XY, Kim KJ, Kang JX. A host-microbiome interaction mediates the opposing effects of omega-6 and omega-3 fatty acids on metabolic endotoxemia. Sci Rep. 2015 Jun 11;5:11276. doi: 10.1038/srep11276. PMID 26062993
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