Ничего не надо оформлять. Пишется заявление в уведомительной форме: "Довожу до вашего сведения, что ребенок не будет посещать школу с ... по ... в связи с особенностями здоровья. Ответственность за здоровье и прохождение программы беру на себя". Весь смысл - в последней фразе. Отследите только, чтобы было по три оценки по каждому предмету. Хотя, в первом классе и это не нужно.