Именно что противоречат.  В указанной вами статье нет ни  слова  о необходимости согласия родителя на регистрацию ребенка по месту жительства.  Речь идет лишь о наличии или отсутствии   споров о месте проживания детей. В отсутствии спора   ребенок регистрируется по месту жительства  родителя, с которым проживает. Согласие второго родителя для этого не требуется.   Никакого суда не нужно - достаточно  вежливо попросить письменный  отказ со ссылкой на нормативный акт. И все.  На этом  конфликт  исчерпывается, ребенок прописывается. И не надо никаких согласий.