1. Медузы тут не все время сидят. Могут и уйти. 2. Если сроки поездки такие короткие, лучше не планировать пятницу-субботу здесь, т.к. это выходные дни, на пляже толпы, транспорт не ходит. Ну, разве что, экскурсиями эти дни занять?3. Экскурсии - ближе к поездке накидаю у кого и что смотреть. Заранее ничего не покупайте! Места точно будут! Как приедете и глянете на погоду, так и будете планировать. Выезды в Иерусалим есть каждый день. Мертвое море, как мне кажется, тоже. В принципе, вам этих двух поездок на 3-4 дня вполне хватит. Если время останется -  возьмете экскурсию "Галилея Христианская". Не из-за названия, а потому что очень интересная и насыщенная экскурсия. Вам ТОЧНО понравится при любом отношении к христианству. Хотя и Мертвое море, и Галилея - это экскурсии с утра и до позднего вечера. Иерусалим - по разному. Бывают и на полдня. Ну и увидите, понятное дело, меньше.4. Жить лучше ближе к морю, но не в южной части, то есть к Яффо лучше не приближаться. Остальное не существенно. Где жить - апарты или отель - сами решайте. На букинге выбор большой. Если нужен будет совет по размещению (из того, что вы там найдете) - напишите что нашли и между чем выбираете. Подскажу что лучше. Я ж не знаю ваш бюджет.В Яффо сходите ножками погулять. Брать туда экскурсию не нужно. И экскурсия по Тель-Авиву - это лишнее. 5. Билеты - лучше Аэрофлот. Наш Эль-Аль вам всю душу вытрясет на проверке безопасности. Аэрофлот расслаблен и спокоен в этом плане.6. Живя в Тель-Авиве, машину лучше не брать. Парковки дороги безумно. А экскурсии - вас заберут с набережной и туда же и вернут. В худшем случае приедете на место выезда экскурсии (тоже в Тель-Авиве). Такси из/в аэропорт - около 50 долларов в одну сторону. Может повезет и будет чуть дешевле.