У меня тоже самое - начислено 20 000, переплата 10000 руб, причем произошло это одновременно... Приписали 14 и 15 год зачем-то.. Я не знаю как быть ..Может кто посоветует? или действительно тупо оплатить за минусом переплаты? а вдруг пени будут начислять... Ведь правильно заметили -  логики в действиях налоговой нет