Вычитают. Мой папа льготник (пенсионер, 81 год) и единственный собственник однушки 36 метров. В платежке полная сумма 4 с чем-то тысячи, к оплате за вычетом льгот 2600. А за телефон, действительно, возвращают потом в виде прибавки к пенсии (карты у него нет).