Вам нужно развестись для начала. Доли детям выделить обязательно. По поводу ремонта - ремонт не увеличит вашу долю квартиры, у вас ремонт оплачен в период брака. При раздльном проживании вы конечно можете доказать, что это были личные средства, но это не будет основанием увеличить вашу долю, а будет основанием взыскать эти деньги с супруга.Это же касается и вложений в ремонт после расторжения брака. Так что не стоит при отсутсвии раздела квартиры или хотя бы брачного договора пока вы в браке вкладывать средства в ремонт квартиры. Это будет ваша проблема и серьезная. Так что сначала решите все. И деньги выплаченные по ипотеке в период раздельного проживания вы также вправе взыскать с супруга в размере половины при доказханности и после развода также. Если доли вам сделают равными