ИМХО в Мюнхене больше. В Фюссене хватит 1 дня. Мы жили не в самом Фюссене, а в деревне неподалеку от замков. Красиво, вид на горы, термы есть.  Если все таки машину не будете брать - то берите "баварский проездной" на поезд.