Варганова была очень предана родному театру, боялась потерять интересную работу и поэтому несерьёзно отнеслась к своему здоровью. Дело осложнялось ещё и тем, что на большинство медицинских препаратов, особенно – на антибиотики у актрисы с детства была сильная аллергия. Это всегда значительно усложняло для неё борьбу с болезнями. Несмотря на сильную простуду Лина не стала просить и замене и отправилась домой после спектакля  28 декабря 2013 года, уже очень больной. Муж Ангелины – Роман, вспоминает, что у неё уже тогда была высокая температура, но вызванный утром на дом врач, определил у неё заурядную кишечную инфекцию и прописал какие-то таблетки.  Актрисе не становилось лучше. 3 января 2014 –го ей стало совсем плохо и приехавшие на «Скорой помощи» специалисты увезли её в Боткинскую больницу. Только там Лине сумели поставить правильный диагноз «двухстороннее воспаление лёгких», но было уже поздно. Роман рассказал, что снимок лёгких его жены представлял собой почти целиком белый лист, на котором виднелись два крошечных живых пятнышка.Она скончалась в реанимации 4 января, в возрасте 41 года. Коллега актрисы –Денис Матросов, вспоминая,  почему умерла Ангелина Варганова, называл виновниками её гибели врачей, которых «не докричишься» во время новогодних каникул. Её убитые горем родные были просто не в состоянии кого-то обвинять. После прощания в больничном морге, тело Ангелины увезли для захоронения в её родной город Конаково, находящийся в 100 км. от Твери.http://tizer42.ru/news/smert_angeliny_varganovoj/2016-10-17-153