Ну почему же, как раз все прекрасно объяснимо и называется адаптацией организма. Ее организм адаптировался и к пониженным калориям (путем сброса части мышечной массы что бы понизить расходную часть) и поэтому ее 1000 калорий теперь для организма это нормально и можно накапливать жир.