Будьте уверены, что не компетентна. Вы не можете выставлять УПД с НДС. вернее, можете, но нужно тогда НДС оплатить в бюджет. У вас сложный случай, принципал... агент... Я не бухгалтер, не подскажу.. Но точно знаю - бегите в вайлдберис, договаривайтесь переделать документы. Попробуйте просто в ЭДО отозвать и выставить сразу же новые, без НДС, от той же даты.  Это если 4 квартал. если 3 квартал - то не знаю даже что делать. Кстати, ВБ возможно не обрадуется что вы на упрощенке. Им же нужен входной НДС.