В вашей организации должен быть локальный нормативный акт - график отпусков. Он обязателен как для работника, так и для работодателя. В графике должны стоять даты начала вашего отпуска.Если вы конкретно хотите сначала отгулять отпуск по графику, то перед началом отпуска пишите заявление об увольнении, в котором указываете "прошу предоставить мне отпуск с.. по... с  последующим увольнением" Днем увольнения  будет последний день отпуска. Все выплаты вам произведут до отпуска, трудовую книжку тоже выдадут до отпуска. Если вы вдруг передумали увольняться, то увы, вы будете все равно уволены.Если в организации по какой то странной причине графика нет, либо вы хотите вне графика взять отпуск перед увольнением - то это все на усмотрение работодателя..Проще всего уволиться по соглашению сторон, для этого, как вы это называете, "две недели отрабатывать" не нужно.