Про родство в ДКП указывать не нужно, это не договор дарения. И кто там будет заниматься выявлением родства, особенно если у людей фамилии разные?Из буквалбного прочтения НК та и следует - продаешь долю, получаешь право на вычет от 1млн., пропорциональный продаваемой доле. Но существует множество подзаконных писем от Минфина, что если доля продается сама по себе, отдельным договором, то такому дольщику полагается вычет в  1 млн. Вызвано это тем, что в Петербурге, да и во многих других городах России, приватизация коммуналок осуществлялась через доли, без выделения комнат в отдельный субъект недвижимости, и таким образом питерские продавцы комнат в коммуналках оказываются ущемленными по сравнению с московскими. Ну и как всегда не очень корректно сформулированные разъяснения можно пытаться трактовать в свою пользу. Но надежнее получить персональные разъяснения по данному конкретному случаю. И схема все равно живая, потому что даже если сестра получит право на вычет в 500тыс., то у брата будет как минимум право на вычет в размере 1 млн, что в сумме дает 1.5 млн, а не 1 млн., как при продаже квартиры двумя долями и одним договором.