У меня такое было.Купила квартиру в старом фонде Питере,когда рабочие делали ремонт,сняли решетки с вентиляции.Приезжаю-а мух видимо невидимо,ещё из унитаза лезли,там вода пересохла-вонь из старых домовых труб дикая и мухи тут как тут.Проверьте вентиляцию,поставьте  сетку,как от комаров,типа москитной.