Вы думаете, что в МГУ одна наука, а во ВШЭ и ФУ прикладное? Все эти заведения -- университеты, и ФГОС у нас один. Прикладное - это начало специализации на старших курсах бакалавриата, магистратура и допобразование, его можно получить в любом из этих вузов.У нашей семьи не стоял выбор: платное одно или бесплатное другое, поскольку БВИ был с 9 класса, и дочь выбирала, в первую очередь, именно программу, а не просто вуз.Но, вообще, в Вашей формулировке: существует немалое количество студентов, которые выбрали бесплатный ФУ против платной Вышки. Как впрочем есть и такие, которые при двух и более бесплатных вариантах, выбрали кто ВШЭ, кто ФУ. А есть такие, например, которые бесплатному ФЭН ВШЭ предпочли сильно дорогой МИЭФ, тоже ВШЭ.  Тут уж у кого какие хотелки, возможности и приоритеты.