На чистоту не проверяет. Формально проверяет наличие документов на квартиру. В целом по ипотеке нарваться на паленую квартиру шансов меньше. Кроме палёности у сторон сделки могут возникнуть разногласия и недоговоренности, что приведет к срыву сделки. Необходимо обсудить все детали заранее