Позволят. Точно так же можно иметь 3 по общеобразовательным предметам или по каким-нибудь не очень интересующим предметам. Главное, чтобы по основным предметам была не то чтобы оценка 5, а интерес, энтузиазм. К нему и оценка 5 сама собой приложится. Поэтому ВУЗ и факультет надо выбирать правильно, чтобы было как можно меньше не интересующих предметов.