по каждому сотруднику проверьте начисленный налог - там и вылезет разница. как это сделать - все зависит от программы и мозгов.ну и старый добрый эксель вам в помощь. если никаких спецстредств нет (отчеты в программе) то сохраняете по месячно ведомость в эксель и там на каждого сотрудника сверяете по базе и по формуле.нежно "люблю" ндфл, а отчет новый 6-ндфл "скрасил" не один мой вечер. )))