У них не может быть одинаковая транскрипция. Т.к. в слове pan звук открытый, длинный, надо сильно и широко окрыть рот (утрирую), а в pen-короткий, губами чуть шевелить. Но это лучше вживую, даже на гугловской озвучке слышно, картинки есть. Коротко: pan-широкий и открытый, pen-короткий и более нейтральный. У американцев эта разница очень слышна и видна визуально.