О, нашла более-менее внятное объяснение:В соответствии с действующими орфографическими правилами русского языка слово "загс" должно писаться строчными буквами, так как оно является лексической аббревиатурой, образованой от нарицательного наименования (органы записи актов гражданского состояния ). Такие аббревиатуры читаются по слогами ( не "зэ-а-гэ-эс" , а "з-а-г-с" ) и свободно склоняются (загса, загсу, загсом).Но в практике написания это слово нередко в научных и официально-деловых текстах пишется прописными (ЗАГС).В качестве исключений орфографические справочники указывают слова: АЭС; ГЭС; ЖЭК; ЛЭП; ТЭЦ. Написание этих аббревиатур следует запомнить.Вот сами правила:Прописные буквы в сложносокращенных словах и аббревиатурахС прописной буквы пишутся сложносокращенные слова, обозначающие названия учреждений или организаций, например: Политиздат, Моссовет (но: родовые названия – ревком, рабфак).Аббревиатуры, читаемые по названиям букв, пишутся только прописными буквами: ЦРУ (центральное разведывательное управление), ФСБ (федеральная служба безопасности).Аббревиатуры, читаемые по звукам, пишутся– прописными буквами, если они образованы от собственного имени (ООН – Организация объединенных наций, МХТ – Московский художественный театр),– строчными буквами, если образованы от нарицательного наименования (вуз – высшее учебное заведение, загс - орган записи актов гражданского состояния). Однако закрепились следующие написания: ГЭС (гидроэлектростанция), ЛЭП (линия электропередачи).В аббревиатурах, образованных из иноязычных букв, первая буква каждого названия пишется прописью, а сами названия соединяются дефисом, например: радиостанция Би-Би-Си, телекомпании Си-Эн-Эн, Си-Би-Эс.http://www.feoktistov.ru/node/179Но как-то все равно надуманно.