Не зачтется. У меня так сыну отказали и штамп в паспорт поставили,хотя в Испанию он ездил  2 раза за ту визу  . Если вы не могли поехать ,то должны были анулировать их визу и получить визу той страны ,куда собирались . Но ,иногда везет и все это проходит без последствий .