Автор, а у вас собака в режиме? Вы в одно и то же время кормите-гуляете? Это важно, особенно вначале. Не понятно, такое ощущение, что у вас собака срет в нон-стоп режиме. Но вообще у них довольно системно все происходит, чем старше, тем упорядоченнее по времени. Это щенкам маленьким свойственно каждые 5 минут писать, а какают они все таки тоже как-то ритмично достаточно, если со здоровьем все нормально. Не беру в расчет болезни, отравления, поносы и тыпы. М.б. прогулки непродолжительные у вас. Собаки хорошо понимают территориальный принцип, они ведь и в квартире, когда мелкие щенки даже и ещё не гуляют, не абы куда ходят, а предпочитают определенные места, чаще по периметру квартиры, у двери, окна. Потом понимают, что такое свой дом, а что не свой, и там гадят. Входите в режим, гуляйте подольше, чтоб собака все дела свои сделала. Если просится - выходите, сначала терпеть не будет особо.