я вам не советую жить рядом с миниатюрком, т.к. будете ездить ко всем остальным местам, неудобно это. А в самом миниатюрке хорошо провести пол дня, ну день - больше уже тоже не надо.  В парке Гюльхане в самом центре(рядом с Археологическим музеем) есть площадка, недалеко от акведука по трамвайному маршруту тоже была, есть еще фонтан между Айя-софией и Голубой мечетью, площадь ипподрома с лавочками и египетскими обелисками. Пусть в Еребатан сходят вдвоем, он так же в самом центре, а рыбы в подземном бассейне для ребенка трех лет просто восторг Опять же раз у вас 2 парня, то могут на пол дня в баню сходить (Гедик паша хамам) - там обалденные исторические интерьеры и баня правильная, ребенка развлекут вполне. Музей мозаики с тыльной стороны голубой мечети для ребенка тоже очень и очень хорош и тоже в историческом центре. В Стамбуле ходить и ходить, глядеть и глядеть, там и без анимации некогда скучать.Т.е. я бы в первый день отправила их в Еребатан и на площадь ипподрома, на второй день поедут в миниатюрк(но тогда ребенку надо будет отдохнуть после поездки), а в третий день поехали бы в аквариум. А жилье при этом в центре, любое по кошельку.