Дни отпуска от должности не зависят, в том смысле, что ничего никуда не пропадает. В конце декабря прошлого года у вас должен быть составлен график отпусков, где вы указывали период отпуска - он сохраняется. В новой должности вы можете либо пойти по графику, либо по заявлению перенести. Если по новой должности у вас отпуск длиннее - например. вы стали кандидатом наук (36 раб. дней), а до этого были инженером (28 календарных), то с того момента как принесли  в отдел кадров диплом канд. наук отдел кадров будет рассчитывать из кандидатских  дней. Подойдите в отдел кадров.