У меня была похожая ситуация: штраф, оплаченный в 2015 году (500 рублей), списали в 2017 году, но на тот момент был бардак в базе ГИБДД. Я написала в ССП ругательное письмо с приложением документов (вроде бы через сайт, но точно уже не могу сказать), через полгода "по английски" (молча) вернули, на претензию не ответили.