В резюме написать должность как в трудовой. А в функционале расписать какие были фактические обязанности, с чем приходилось работать,  что с чем совмещали.  На собеседовании также говорите что выполняли обязанности указанной должности и плюс  это и это,  умею то и то.  Тут вакансия на нн попалась, ищут секретаря - офис менеджера и чтоб он по совместительству вел кадровое делопроизводство ( и зп оч щедрая, целых 30 рубликов),  ясен пень в трудовой будет указан секретарь..Так что  ситуация подобно вашей не единична, нет повода переживать