У меня тоже был период, когда я занималась йогой, и  также шея болела и под лопатками. У меня инструктора хорошего не было и из-за этого были проблемы,неправильно что-то делала. И ещё, надо было уделять особое внимание расслаблению мышц шеи, чего не было в моём случае. Возможно, и у вас та же проблема. Упражнения упражнениям рознь, это да. Сейчас ЛФК занимаюсь с физиотерапевтом, плюс массаж регулярный - совсем другое дело.