Одинаково. Туда и туда самолёт летит 4 часа, только из Горно-Алтайска до турбаз Горного Алтая и санаториев Белокурихи несравнимо ближе. А вот если горные лыжи Шерегеша нужны, то лететь чуть даль, в Новокузнецк, например.