Не надо ничего выкидывать. Удаляйте маленькие пасынки, где ещё нет цветов и помидорок. Если уже есть цветы и помидорки на пасынках, я бы оставила. Нижние листья  убирайте, которые земли касаются.  Всё будет хорошо. Томаты можно  формировать не только в один стебль, но и в 2 и в 3 и как угодно.