Я даже помню объяснение. Т к физтех первоначально был факультетом МГУ, то поэтому и остались эти выражения, как если бы речь шла о мехмате, например.  Никто же не говорит из мехмата, а говорят с мехмата. Не в физтехе (в мехмате), а на физтехе (на мехмате).