Заполнить декларацию вы должны были по итогам продажи в 2015г., т.к. квартирой владели менее. Не заполните - оштрафуют несильно. У вас есть доход 4.3 млн. рублей и право на вычет из дохода в размере 5млн. рублей. Т.е. база для расчета налога отрицательная и вы ничего платить не должны.