С ипотекой может быть другая картина. Банк  потребует акта приемки-передачи квартиры и оформления залога в тот срок, который указан в кредитном договоре. Акта не будет, так как квартира в срок не построена, закладывать нечего. Как поступит банк? Неизвестно. В том числе может и попросить вернуть кредит. Если Вы сами платили свои деньги, то Доп.соглашение по переносу сроков строительства, на мой взгляд, подписывать не следует, чтобы не лишаться права на взыскание неустойки.