Вы же пишете "никому он в той квартире не нужен". Он и не должен быть нужен никому, кроме отца.  Выходит и отцу не нужен, так?   Настолько, что от  простого формального действия  его останавливает даже перспектива обменять  пресловутые доли на отдельное жилье.  Ну что ж, старшенький подрастет и спасибо скажет папеньке, что оставил ему прописку в неприватизированном жилье с кучей  родни вместо половины  квартиры в собственности.