Это могло быть в одном случае: вы - мать- не имели с собой свидетельства о рождении ребенка, чтобы подтвердить родство. Все. Если есть подтверждение того, что ребенок ваш сын/дочь, то ни один пограничник не попросит  у вас согласие от отца, так как это неправомерно.