Обращаться в пенсионный фонд, там подскажут более профессионально как и что. Но сразу могу сказать, что все это будет делаться через куплю-продажу долей, а не через обмен. Будет 2 договора КП - по каждой квартире свой.  Все подробно прописывается договорах КП. Прошли подобную сделку