У меня есть такие. Самые простые люди... Период этот не учитываю для отпуска все что свыше 14 дней. С начала работы товарища - да пересчитать период. Бух записку с расчетом. Если сотрудник перегулчл - оповестить под роспись, чтобы в курсе был. Я бы так сделала.