Генетическое что-то может быть. Про мышей не знаю, а у хомячов например есть такое - летальный ген. Даже наверняка, раз от одного производителя. Зачем вообще таких животных размножение допускаете? Таких близкородственных вязок не должно быть.  И  слишком молодых и слишком старых производителей тоже.