Когда мы в свое время ходили апеллировать русский (стояла 4 из 5, была пропущена одна запятая и в ответе на вопрос было написано "мало" ), то учитель, который обсуждал с нами работу, еще раз ее посмотрел и сказал, что в одном месте, где проверяющий ошибку не засчитал, т.к. она была на правило, которое еще в 4 классе не проходили, комиссия может снизить, т.к. могут посчитать это ошибкой при списывании. В то же время одному ребенку рекомендовали попробовать и в итоге повысили балл с 3 до 4,  и учителя искренне поздравляли родителей. Так что, прежде чем идти писать заявление, можно обсудить с учителями возможные шансы.